Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NZ_CP013130_1                                                                                                                 top


Strain : Lactobacillus paraplantarum GCF_001443645 RefSeq :NZ_CP013130 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP013130_1
DR consensus (36 bp) : GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAACNumber of repetitions :12
Begin Position : 302519 End Position : 303280

302519GGTCTTGATCTTATTGATTTGATGTCCTTCTGAAGCCCTGGCTCATAGATGAGTGCAGGAAAAAAT302584
302585GGTCTTGACCTTATTGATTTAATATCCTTCTGAAACACGTTCTCGACACTATCTGGCACCTTCCTT302650
302651GGTCTTGACCTTATTGATTTGATGTCCTTCTGAAACTCATAAACGACTTGGTACCCATTAGAACGT302716
302717GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAACTGTAGGCGCCGTGCAATGCTAAGAACTCAT302782
302783GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAACTAATATTAATTGTTAGCTTCAGCTCAAAAA302848
302849GGTCTTGACCTTATTGATTTAACGTCCTTCTGAAACAGGTCGGTCATTTTCCTATTGAGTTGCATA302914
302915GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAACCGGAGGTGTGGTGGTATGTAATGGCAAAAG302980
302981GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAACGTGAAGCACCCTATCAAGCAACTTTGTAAA303046
303047GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAACCTGGCGACCAAAATCAAAATCTGCCTTCAT303112
303113GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAACTGAGTTGTTAACTCAATTTGGCATGCCATT303178
303179GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAACATAACTTTAAGAGCACTCGTGAAGACATGA303244
303245GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAAC303280
Left flanking sequence : Till position 302519 (length bp)
CTAAAGCCCACAGCATAGTTATCAACCGATAGCTAAGGCATAATCATATTAATCAATGTCCTTCTGAAAC
AGTACTTATAAAGCAATTAACCATGCTACT
Right flanking sequence : From position 303280 (length bp)
CGTTAATCTCTAATCGAAATTTAACATTCCATTAGTACCAATCAACAAAGTCTTCATCAATAAAATTGAA
CGACCCAACATCATAGTAATCGCGTTGATC

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp