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CRISPRs details
NZ_CP013238_2
Flanking alignement tool
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NZ_CP013238_2                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium butyricum GCF_001886875
RefSeq :
NZ_CP013238 (plasmid pNPD4_2 circ)
CRISPR id :
NZ_CP013238_2
DR consensus (30 bp) :
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
Number of repetitions :
97
Begin Position :
676959
End Position :
683258
676959
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
TGGGTTGAAGGTGGAGACACAGATAAAGATATTGCA
677024
677025
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
GCAAATTTATTCTCTAATGCATTAAAAGCACTTGG
677089
677090
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
TAAAACAGAAGAAGCTAAAGAAGGATTTAGTTGGG
677154
677155
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
GGAAAAGCACCTAATATAGCAATAGGAGGATTAGA
677219
677220
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
GCTGTAACAGAAATAGAAACAGTTGTTAATACTGGT
677285
677286
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
GAACTGGACCATTTCACCTCTAAAGCTGCCGGTGT
677350
677351
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
TTATTATAAACAGACAGGTGATATTGCTACTCTG
677414
677415
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
GGTCTACCTCTGTATATAGAACCATCTAACCTTATA
677480
677481
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
TAATTAATAGCCATGAAGTACCTAATATCATTTT
677544
677545
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
TGTTTTAAGTTATCTAACGATGTTTCTGCATAAAT
677609
677610
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
TTATATATTATTTCTCCCTTATTTCCATTATTGA
677673
677674
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
GATAATAATTTACTTGAATATTTAAATGGAGCTG
677737
677738
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
AAAGAATGGCTATTTTCCTTACTTTCTTGAACCTGG
677803
677804
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
GTTAGATTATCTCCCTATTAGGGGATTTTATAACG
677868
677869
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
TTTTTTGGAAGTACATTAGGGAAAGGTCTTACTG
677932
677933
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
TAGCAGAGAAAATATAAAATCATTACCAGCATATGC
677998
677999
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
AACTATTAAAGAATTCGAAGATAATGTAGAAATTAT
678064
678065
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
ATTACATTTTCTAAATAAATAAAATAAATAAAAG
678128
678129
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
GAAGATAAAGGAACACCATAAGGGATATTATCAA
678192
678193
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
ATAGATGAAAAACAAAAGCGATTAAAAACACTATT
678257
678258
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
TGTGGATCAAACATGCAAATGAGATATGGTCCCAAA
678323
678324
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
AGCAGCACTGAAATGCAGATGAATGAAAATAAGAT
678388
678389
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
AATAGAAATCGATAAAGGAACGTGTATAGCATGTGG
678454
678455
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
TGGGCAGTAGGACATTTATTACAACTTAAAGATATA
678520
678521
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
AGTAAAGATTTAATAATGTTTTTAACAAGCGTTGC
678585
678586
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
AGCATGCCCACCTGAACCTCCTTTGTTAAAAGTTACT
678652
678653
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
GGATTAACTGGTAAAATAAAAAATAAATCAGAAA
678716
678717
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
ACAGTTTAGAATAATAGATAAAGATACATCTAATGA
678782
678783
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
GACAGATTTATTAAAAATGGAGCTGGCTGAAAATA
678847
678848
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
GTTGCTTGGAAGAAATTACTACCATTACCAGCTGT
678912
678913
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
AAAATATTCTCTATGAGTAGACAACCAAAAATAAGA
678978
678979
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
TAATGAACATATGAGATATAATTGGGTAGAAATT
679042
679043
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
TCTAGTATATTCCAATTTAAGCCATCATTTGATCC
679107
679108
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
TACCTTGAGCGATATAATGTATATCAGTAGAATCAA
679173
679174
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
AAGAATCCCATATATACTGGTTCTACATATTTACTA
679239
679240
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
TTAAGTTGAACTAAAAAACTTGTATTACACTTCTAG
679305
679306
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
ATATTAAAATAATCCATTAAAGATTGATTGATTAAAC
679372
679373
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
ACTAACTACCCAAGTGATTATTATTATCCAGATGAA
679438
679439
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
GGAGATAGTTTTTTATAAGTTTTAGATAATTTAATCA
679505
679506
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
TACATTAACATGCAGAGCAGTTGAGGAGGGTGAGGCT
679572
679573
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
TTTTTTGGAAGCACATTAGGAAAAGGTCTTACTGCAC
679639
679640
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
GAAAGCGAAAAAGAAAGATTAGATGAGTTATCATC
679704
679705
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
TTTTCATTTTCACATTTTAAGCCATACAGTAAACC
679769
679770
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
ATACTGGATTTGAAGAAGTATCTTGGGGTAATAGTG
679835
679836
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
AGTGAAGTTATTACTAGAGTTGCAGTTTACGATAGT
679901
679902
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
GCATATGCCGATACAGAGCATAGGTTAAATGATAAA
679967
679968
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
CTCCAAATTACACAAAAAATACTATATTAGAAAAA
680032
680033
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
CAGGAGCTGTAATACCAGCTTTGATAGCATTAAG
680096
680097
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
GATATGAAATATCAATTCTAGATAAAAATAATGT
680160
680161
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
TTTCCCCATTGGCGTGCACTATTCATTTTTCTTTCT
680226
680227
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
ATAAAATACCCTTTAAGATAGGTCGGCTATCATC
680290
680291
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
AGAAACTCCAATATCTATATGTAGAAAGTTAGGTG
680355
680356
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
AATAAAATTGCTATTTTACTTCTACTTACTACCC
680419
680420
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
TAATACCAATCAAGATATGAATTTTTTTCTTGTAT
680484
680485
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
GCATAAAAATCTATTTCGCTTTTTGTTTTTCCGA
680548
680549
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
CAAGGAAGAAATATGGTTATGATAAACGGAGGACAA
680614
680615
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
AAACCATACAGAACATTTTAAAATAATTTATACCAC
680680
680681
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
TTAGCAAGGTAGAAAAATTCTCCACCCTGCTTACC
680745
680746
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
GTTATTCCAGTTATAACCGTTGAGCTATCACTTC
680809
680810
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
AAAGCACAATCTTTAGGAACAGATAAAGTCAATGAA
680875
680876
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
TTTAGTTTAAATCATACAACTCCTTATAGTGGCA
680939
680940
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
ATATAATTGGGTATCAAATATGGAACAAGAAGCAAAG
681006
681007
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
CCTTAAAACCAAAGGTGAGGATTGGAAAATGATA
681070
681071
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
CCATTTTAACACCAAAGTTTTAGTTAACTATACACCAA
681138
681139
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
GGGCTATATTACAGATAGATATACAAGCTTTACACC
681204
681205
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
AATTTAACCTTGATACTGAAAAGTATGGAAGTGTAT
681270
681271
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
AAAAGAAAATGATAAAAATATAAGTGGTTATATTAT
681336
681337
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
GGAAATCCATGTCAATACGCTAGTTTTCAGACAGC
681401
681402
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
AAATATCTAGTTGTTATATTTTTCATTTTAAGCATT
681467
681468
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
GGGAATACTGCAAATAAAAAAGTAAGAACTTTACC
681532
681533
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
AGACATGAACCTATTTTATCACCACGCTTTTTAA
681596
681597
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
GGCAAAACTGAAACCTTAGGAAACTCTAAAACTTGA
681662
681663
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
GAAAGTAATTGTGAAAAAGGAATTTTAAAGTTGTGT
681728
681729
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
AGAAAACTTTACGCAAGAAGCTCTCGCTGAATCTTT
681794
681795
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
AAATGATTGACTTAATAATACCTATTACAAGGTCG
681859
681860
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
TAACATCTTCTTAGCATTCCTCTCCAATATTCATAAG
681926
681927
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
GATATAACATTAGAACCAGATAGTGGAGAAGGAA
681990
681991
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
GAAGAAGACAACAGAGAACTTTTATGTAAAGAG
682053
682054
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
GACAAATATTCAGTTAATTTATATAAGTTTTTAA
682117
682118
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
GATGATGATAATAATGATGATGATAAGCTATTTAA
682182
682183
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
AGAAGTGGACTAGAAGAAGTAGTAAATAAATTAA
682246
682247
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
AATATCTGCATAAGGTGCAGCAGCTCTACACTCGTT
682312
682313
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
GGTGGAAATTTTGAACAGCTTTCTTTTGAAACATTT
682378
682379
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
TATAATCATCCTCTCTTATAGCTTATGAACGAATTT
682444
682445
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
AACTGGGAATTAGCTCCATGTGCTGATACAACAAAA
682510
682511
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
TGTTTAATTACTGCTGCTATCAAATTAGGATCAAC
682575
682576
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
GCAAATTTATTCTCTAATGCATTAAAAGCACTTGGC
682641
682642
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
TTAGAAAAAGATTTAGATAGTAGGATATGGGAAGA
682706
682707
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
GAGGATGCACTGAAAGAGATAAGAAAAATATAAGAGC
682773
682774
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
GTTGGAGAATCTGTTGTGCTAAATTTATTACTACT
682838
682839
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
CTACATGTATTTTTTACACCTTCCCATGTTTCACC
682903
682904
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
ATGTATCATATCCACTTTCACCTAAATCAAATCTTG
682969
682970
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
TAACTATAAGCTCTTAACACACAACCGCCTTTAA
683033
683034
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
TGATATCTTTCTTCTTCCGGAGCCTGAACTCCTCC
683098
683099
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
ATCCACCCTTGATAGAACTTAGTTTCCTTCTGAG
683162
683163
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAAAT
ATCTTTCTAATCATAATTGTTTCAATGTCTTCTAAT
683228
683229
GATTAACAGTAACATTAGATGTATTTAGAT
683258
Left flanking sequence : Till position 676959 (length
bp)
CTATTTTGTAGTAATTCAGCTGGAAATTTATTAGTGGAAGTGTTATTATATCTAGTATAGATGGAATTTA
TTAAAGTGGATAAATGGCTTATTTTCTTTG
Right flanking sequence : From position 683258 (length
bp)
GGGTTAGCAGAAAAAGGATTTTAATAGAGAATTAACGATTAACAGGAACTAGATTGTCAACACCTTTAAT
ACAACTTTTATTCGATCATATTATAAAGTC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp