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CRISPRs details
NZ_CP013353_1
Flanking alignement tool
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NZ_CP013353_1                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium butyricum GCF_001465175
RefSeq :
NZ_CP013353 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP013353_1
DR consensus (30 bp) :
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
Number of repetitions :
59
Begin Position :
554563
End Position :
558382
554563
ATCTAAATACATCTCATGTTACTGTTAATC
GTACTATCTAGTAATTCGAATAGAGCCTTTTCTCTT
554628
554629
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CAATCTACCATGTAATCTAAATTAGAGTTTAAATTT
554694
554695
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TGAATATTTTTTAATGTATCTATATATTTTTGCTTT
554760
554761
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
GCAATATAGTGAAACGTGTTCGGATTATCCTTTCG
554825
554826
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CTAAATGCTCTACGCAACATTGTATATTGTTGTTC
554890
554891
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TAGTTATTTGATGTATTTTTTCTTCGTTGTACCA
554954
554955
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TGCTTCTCGTACATATACAGAGTATTTTGGTTCAA
555019
555020
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CTCAAGAAGAACCACCAAAAAAGAGGGAGTTCGG
555083
555084
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
AAAACGCTAACAATGATTTAGGTAACTCAAGTTTAA
555149
555150
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTTAACTTTATTAACATGATTATACCCCGCATAT
555213
555214
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
AAATAAATTAAAAGATAAGGTAATGATTATAAATTG
555279
555280
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
ATGCGTTTTTTAGAGCGTTCGACAATGAGAATTACA
555345
555346
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
ATTAAAATTACAGATGGAGAAAATGCAAAAGAAAAT
555411
555412
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTTAATAATTGGAATTGCATTTGGATTTCTATTAAA
555477
555478
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TGTGCTTTGTCAAGAACAATTTTGTTACTGTTTGCT
555543
555544
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CATATTAAATACACTCTATCTCCTAAAATTAACCAT
555609
555610
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
GTTCTGTTATCGCTATTATACACGTTCATAATATTC
555675
555676
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
AATAACGATTTTAAAAGGAAGTTCAAGGAGGGATTA
555741
555742
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TATTGCCAATTGCTGTTCAATTTTAGTTGCCATATAT
555808
555809
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
AGTGATAGTAATTCAAACAGTTCTAGTGCTTCGGT
555873
555874
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CTCAATATATGTGTTTAATAGTGTTTATTCTTCTGG
555939
555940
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
AGAAATTCAAAACCATGTAAATACAGAAGAAGTAAC
556005
556006
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TCTCTAGCTTGTACAACATAAGCTTCTTTTTCATC
556070
556071
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
AAAATCCTGTAAATCCAAAATTTTCCCTCATTAGCT
556136
556137
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CTGTTTAGCGCCTGTGTGACATTCGTCAATTAAAACA
556203
556204
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
AAGATTAGATAAACTAGTAGGATGGCATATAGGAA
556268
556269
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTACGCCATATCTTAATAATAACAATAATAATTTATC
556335
556336
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTTAGAAATTCAGGACAAGATTAGAAAATTATCAAA
556401
556402
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTAGATTCAAGTACAGAGTTGGTAGATAGTTATTG
556466
556467
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTTGTTTTCTTTTCTTTGATTGTATTTTCTTTTT
556530
556531
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
GTTTTTAGAAAGATATAAAAAATAATTTTATGAGG
556595
556596
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
AATAGATATGATAATACAAAGAAAGTTTATAGCTT
556660
556661
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CAATTGGGTTTATGCATTTCTTATCTTTCTAAAAA
556725
556726
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TGGATGCTAATAGCATTAGAATTCATATTATAGA
556789
556790
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CAATTGCAACAAGATTTACAGAAAAAGATGTAAC
556853
556854
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTGGGATATAGATTTACCAAGTTTGAATTACAACAA
556919
556920
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
AAATTCAATCTACTAAAAGCAAATGATATATATA
556983
556984
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTTATTTCTTAAAACCTAACACAAAACCCACAACT
557048
557049
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
GTTAAGTCTCTGTGTTTAAATTCTTTAACTATTGT
557113
557114
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
ATTGTTTTGATATATTTTAGTTAATTCATTATATTT
557179
557180
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TCTTACTTGACTCCCATCATTTGCTAAAACTGTT
557243
557244
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
AACTAGCTAAAAGTATAGCAGATGCAAGTTTCTT
557307
557308
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TAAAATATATAAAGATGGTTTTAATATATCAGATGA
557373
557374
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
GAAATAGTTAAAAGCGTACAAGCAACAGGGAAATA
557438
557439
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTTCAGTATTTTCAACTATTGTATTGTTTTCTTC
557502
557503
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
AATATTTTATTTAATCTATTAACATATTCTTCTTTT
557568
557569
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
GCCTTCCTACAGGTAGTGGCAAAACTATTTTGATGGC
557635
557636
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTAGAGGATATAAAACATAAATAAATAAAATCAA
557699
557700
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CAAAATCTATTATATAATTAGTACATAAGATAAA
557763
557764
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
ATAGCATAAAATAAATAATAAGAGGTGTAAAGATA
557828
557829
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CTATCATTGTATGTCAAACTTGTTAATGTCGTATA
557893
557894
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
GAGGATGTTAACAGTTAAATAAAATTAAAGGGAGT
557958
557959
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CATAAAGAAACATTAAATATTATAATAAAGTTAAG
558023
558024
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
ATTCTCTTTATATTGAGTATATAACTGATTATTAGT
558089
558090
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTGGAAAGTTTTTAGATGTATACACCATTGAAAACAG
558156
558157
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTTTAGATTTGAAAGCTTCTAATAATTCATTGTTT
558221
558222
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CCAACTGTATTTGATATTTTTTCTTTTCTTGCTAC
558286
558287
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CTTATTTATATTTATAAATATTGTTCTTTTGTTCTA
558352
558353
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
558382
Left flanking sequence : Till position 554563 (length
bp)
CTGTTAATTATAGACTTTATAATATGATCGTATAAAAGTGTTGGCAATCTAGTTCCTGTTAATTCGTTAA
TTCTCTATTAAAATCCTTTTTCTGCAACCA
Right flanking sequence : From position 558382 (length
bp)
CAAAGAAAACAAGCCATTTATCCACTTTAATAAATTCCATCTATACTAGATATAATAACACTTCTACTAA
TAAATTTCCAGCTGAATTACTACAAAGTAG
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp