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CRISPRs details
NZ_CP013489_3
Flanking alignement tool
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NZ_CP013489_3                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium butyricum GCF_001456065
RefSeq :
NZ_CP013489 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP013489_3
DR consensus (30 bp) :
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
Number of repetitions :
58
Begin Position :
781962
End Position :
785715
781962
ATCTAAATACATCTCATGTTACTGTTAATC
GTACTATCTAGTAATTCGAATAGAGCCTTTTCTCTT
782027
782028
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CAATCTACCATGTAATCTAAATTAGAGTTTAAATTT
782093
782094
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TGAATATTTTTTAATGTATCTATATATTTTTGCTTT
782159
782160
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
GCAATATAGTGAAACGTGTTCGGATTATCCTTTCG
782224
782225
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CTAAATGCTCTACGCAACATTGTATATTGTTGTTC
782289
782290
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TAGTTATTTGATGTATTTTTTCTTCGTTGTACCA
782353
782354
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TGCTTCTCGTACATATACAGAGTATTTTGGTTCAA
782418
782419
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CTCAAGAAGAACCACCAAAAAAGAGGGAGTTCGG
782482
782483
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
AAAACGCTAACAATGATTTAGGTAACTCAAGTTTAA
782548
782549
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTTAACTTTATTAACATGATTATACCCCGCATAT
782612
782613
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
AAATAAATTAAAAGATAAGGTAATGATTATAAATTG
782678
782679
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
ATGCGTTTTTTAGAGCGTTCGACAATGAGAATTACA
782744
782745
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
ATTAAAATTACAGATGGAGAAAATGCAAAAGAAAAT
782810
782811
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTTAATAATTGGAATTGCATTTGGATTTCTATTAAA
782876
782877
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TGTGCTTTGTCAAGAACAATTTTGTTACTGTTTGCT
782942
782943
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CATATTAAATACACTCTATCTCCTAAAATTAACCAT
783008
783009
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
GTTCTGTTATCGCTATTATACACGTTCATAATATTC
783074
783075
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
AATAACGATTTTAAAAGGAAGTTCAAGGAGGGATTA
783140
783141
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TATTGCCAATTGCTGTTCAATTTTAGTTGCCATATAT
783207
783208
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
AGTGATAGTAATTCAAACAGTTCTAGTGCTTCGGT
783272
783273
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CTCAATATATGTGTTTAATAGTGTTTATTCTTCTGG
783338
783339
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
AGAAATTCAAAACCATGTAAATACAGAAGAAGTAAC
783404
783405
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TCTCTAGCTTGTACAACATAAGCTTCTTTTTCATC
783469
783470
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
AAAATCCTGTAAATCCAAAATTTTCCCTCATTAGCT
783535
783536
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CTGTTTAGCGCCTGTGTGACATTCGTCAATTAAAACA
783602
783603
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
AAGATTAGATAAACTAGTAGGATGGCATATAGGAA
783667
783668
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTACGCCATATCTTAATAATAACAATAATAATTTATC
783734
783735
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTTAGAAATTCAGGACAAGATTAGAAAATTATCAAA
783800
783801
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTAGATTCAAGTACAGAGTTGGTAGATAGTTATTG
783865
783866
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTTGTTTTCTTTTCTTTGATTGTATTTTCTTTTT
783929
783930
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
GTTTTTAGAAAGATATAAAAAATAATTTTATGAGG
783994
783995
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
AATAGATATGATAATACAAAGAAAGTTTATAGCTT
784059
784060
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CAATTGGGTTTATGCATTTCTTATCTTTCTAAAAA
784124
784125
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TGGATGCTAATAGCATTAGAATTCATATTATAGA
784188
784189
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CAATTGCAACAAGATTTACAGAAAAAGATGTAAC
784252
784253
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTGGGATATAGATTTACCAAGTTTGAATTACAACAA
784318
784319
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
AAATTCAATCTACTAAAAGCAAATGATATATATA
784382
784383
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTTATTTCTTAAAACCTAACACAAAACCCACAACT
784447
784448
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
GTTAAGTCTCTGTGTTTAAATTCTTTAACTATTGT
784512
784513
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
ATTGTTTTGATATATTTTAGTTAATTCATTATATTT
784578
784579
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TCTTACTTGACTCCCATCATTTGCTAAAACTGTT
784642
784643
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
AACTAGCTAAAAGTATAGCAGATGCAAGTTTCTT
784706
784707
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TAAAATATATAAAGATGGTTTTAATATATCAGATGA
784772
784773
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
GAAATAGTTAAAAGCGTACAAGCAACAGGGAAATA
784837
784838
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTTCAGTATTTTCAACTATTGTATTGTTTTCTTC
784901
784902
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
AATATTTTATTTAATCTATTAACATATTCTTCTTTT
784967
784968
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
GCCTTCCTACAGGTAGTGGCAAAACTATTTTGATGGC
785034
785035
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTAGAGGATATAAAACATAAATAAATAAAATCAA
785098
785099
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CAAAATCTATTATATAATTAGTACATAAGATAAA
785162
785163
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
ATAGCATAAAATAAATAATAAGAGGTGTAAAGATA
785227
785228
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CTATCATTGTATGTCAAACTTGTTAATGTCGTATA
785292
785293
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
GAGGATGTTAACAGTTAAATAAAATTAAAGGGAGT
785357
785358
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CATAAAGAAACATTAAATATTATAATAAAGTTAAG
785422
785423
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
ATTCTCTTTATATTGAGTATATAACTGATTATTAGT
785488
785489
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTGGAAAGTTTTTAGATGTATACACCATTGAAAACAG
785555
785556
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTTTAGATTTGAAAGCTTCTAATAATTCATTGTTT
785620
785621
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CCAACTGTATTTGATATTTTTTCTTTTCTTGCTAC
785685
785686
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
785715
Left flanking sequence : Till position 781962 (length
bp)
CTGTTAATTATAGACTTTATAATATGATCGTATAAAAGTGTTGGCAATCTAGTTCCTGTTAATTCGTTAA
TTCTCTATTAAAATCCTTTTTCTGCAACCA
Right flanking sequence : From position 785715 (length
bp)
CAAAGAAAACAAGCCATTTATCCACTTTAATAAATTCCATCTATACTAGATATAATAACACTTCTACTAA
TAAATTTCCAGCTGAATTACTACAAAGTAG
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp