Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NZ_CP013610_2                                                                                                                 top


Strain : Lactobacillus acidophilus GCF_001469775 RefSeq :NZ_CP013610 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP013610_2
DR consensus (36 bp) : GTTTTAGAAGGTTGTCTATTCAATAAGGTTTAACCCNumber of repetitions :21
Begin Position : 767269 End Position : 768625

767269GTTTTAGAAGGTTGTCTATTCAATAAGGTTTAACCCGTTGCCACCGCATTTTCTGGCTTTTTGTAG767334
767335GTTTTAGAAGGTTGTCTATTCAATAAGGTTTAACCCGTAAGTTTACTTTGGTTGATGCAGCTAATG767400
767401GTTTTAGAAGGTTGTCTATTCAATAAGGTTTAACCCAACTGACAGCAGTGTAGACCGAATTCGTGA767466
767467GTTTTAGAAGGTTGTCTATTCAATAAGGTTTAACCCGGCTTTTGCCTTGCACGACTTTTGCCTGCA767532
767533GTTTTAGAAGGTTGTCTATTCAATAAGGTTTAACCCCGTGTCGTCGTCAGATAATCTACATCCTGT767598
767599GTTTTAGAAGGTTGTCTATTCAATAAGGTTTAACCCCAGACTCATTGTCAAGACCTTACAGAAGTT767664
767665GTTTTAGAAGGTTGTCTATTCAATAAGGTTTAACCCATTTGTCAAGGAGTACGGCTGGCGGATTGA767730
767731GTTTTAGAAGGTTGTCTATTCAATAAGGTTTAACCCATACATACCGGCCCTTTGCGCCGTCAACAT767796
767797GTTTTAGAAGGTTGTCTATTCAATAAGGTTTAACCCGCTGCCATGGCGTCAATCGGCCGGGTGTTA767862
767863GTTTTAGAAGGTTGTCTATTCAATAAGGTTTAACCCCACTTGCCTCCCCTTTTTAAGCCAGCCCCT767928
767929GTTTTAGAAGGTTGTCTATTCAATAAGGTTTAACCCATTTAATAACGCCTGTAATCTTGCCCTCTT767994
767995GTTTTAGAAGGTTGTCTATTCAATAAGGTTTAACCCGTATATCTGGCGCTGATAGTCACAGTAGTC768060
768061GTTTTAGAAGGTTGTCTATTCAATAAGGTTTAACCCTGCCGGCAGTTGACCAAGCCTTATAAGGTA768126
768127GTTTTAGAAGGTTGTCTATTCAATAAGGTTTAACCCAATAACTGTGTGATTTTAATCGGAAGACTG768192
768193GTTTTAGAAGGTTGTCTATTCAATAAGGTTTAACCCCATATCCGTGCGCTCAGCCTCATGGACAGC768258
768259GTTTTAGAAGGTTGTCTATTCAATAAGGTTTAACCCCAAATTTAAGCCAAATGCTGATACCAGCAC768324
768325GTTTTAGAAGGTTGTCTATTCAATAAGGTTTAACCCCCGTTTTCCGTCACATGATACTCCGGCATC768390
768391GTTTTAGAAGGTTGTCTATTCAATAAGGTTTAACCCATATGGATTCAATTTGAACACTCAAACATT768456
768457GTTTTAGAAGGTTGTCTATTCAATAAGGTTTAACCCACAAATATCGCGGTTTTGATCGGTCGTCCGA768523
768524GTTTTAGAAGGTTGTCTATTCAGTAAGGTTTAACCCCAACCGACATCACTGTTGCTCAAGGCGCAG768589
768590GTTTTAGAAGGTTGTCTATTCAATAAGGTTTAACCG768625
Left flanking sequence : Till position 767269 (length bp)
AAGGATCAGGTTGTATATGGTGATGCAAAATTCAGTTATATCGATGAGGATCTTGTTGATTGGTACTAGC
CTTATATTAAAGCTGTGTTAAAAAATAACG
Right flanking sequence : From position 768625 (length bp)
CTGCTTGGATGCGTGGATTGAAATAGTTTTATAGGGGTGCTTATTCAATGTTGTCAATTTTCCCGACGTA
TGTTGGGGTGGCCATCATAATGGCCTAATA
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp