Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NZ_CP014170_3                                                                                                                 top


Strain : Clostridium tyrobutyricum GCF_001642655 RefSeq :NZ_CP014170 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP014170_3
DR consensus (30 bp) : ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAATNumber of repetitions :18
Begin Position : 494826 End Position : 495975

494826ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAATAACCTCATATATCCTGGACAAAAGTTGGTGATACCA494891
494892ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAATTCATCATTACTTGTAATATGACCACAATTTGATATA494957
494958ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAATATTGGAGTATCAAGACAATCAGTATCTTTGTATGAA495023
495024ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAATTTACATCTGCTATATGGAATACTGCACAGAGACT495087
495088ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAATGCTAATGATATAGATAGTAAAGAAGCAGAGGAACTTA495154
495155ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAATTTAAATAAAAATAAATAGCAAAAATCCGTTAAACAG495220
495221ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAATCTGCTCATACATTGTCAAAATAGACATCATGGTATC495286
495287ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAATGGAAGATTTTTAGAATTACAGAAGAAAGCTGATGAACT495354
495355ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAATGCTCTTCTTCAAGTGCTCTGCATTCATTAGGAGTTT495420
495421ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAATAAAATACTATATCGCCTTTCGTCGCGTTTCCTTT495484
495485ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAATTTATTGTATTTGCCGTCACAAACATCAATAGCAAAT495550
495551ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAATTTTTATTAAATTCTTCTTTTAAATCGTCGTTTAAATA495617
495618ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAATAGGTATGTTTGCAGTATCACTATTAAGTTTTAAATC495683
495684ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAATTCCTCAGACTGGTTCCTTGATAAAACAGAAAAATGC495749
495750ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAATGATTAGGTCTCAATTTAAGCAATGGATATAAATAA495814
495815ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAATATTTCTTGGGTATAACTAGTATACAACTGAAGTCCA495880
495881ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAATCCAAAGAGGATATAGTTATACAATAAATCATAATG495945
495946ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAT495975
Left flanking sequence : Till position 494826 (length bp)
TTTATGTAAACAATTCAAAAAAATATACGACTATATTTATTCAATTGATTTTTGTCTAGTTTCAATGCCA
ATAGCAATGCACGGAGTGCATTACAGAGTT
Right flanking sequence : From position 495975 (length bp)
CACAGTAAAAGAGTCATTCTCTAAATTCATTATAACTCCCAAACCATTGAAAATAAAGCCATCTAATAAA
ATTTTTCCAACCATTTTGTATTATCTCACT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp