Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NZ_CP014672_7                                                                                                                 top


Strain : [Clostridium] stercorarium subsp. thermolacticum DSM 2910 GCF_001697245 RefSeq :NZ_CP014672 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP014672_7
DR consensus (30 bp) : ATTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAGNumber of repetitions :29
Begin Position : 1530277 End Position : 1532141

1530277ATTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAGATTGCATTACGAATTTTATGTGAGTGAATTTTCGA1530341
1530342ATTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAGTCGAATGGAGGAGAATAAACTATAACATCATCCAA1530406
1530407ATTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAGCTGCAAAACCTGTACGAATTTCTTGTTCATCGAA1530470
1530471ATTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAGATTTGGTAGTGTTGTAAATACTGATCCTGAACCGC1530535
1530536ATTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAGAAAGGGGGGATGATGGTGTCAGTTGGAGAGAAAATTA1530602
1530603ATTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAGTCAATTTTGATTGAATTTGAAGTACTTGTTAATCA1530667
1530668ATTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAGGCCGATTTTGATGTCGTTCCGGTTCAGCAAGTCGTAT1530734
1530735ATTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAGTGTCGCAGCTTTTTCAGTTGACTTCCCGTTTTTTC1530799
1530800ATTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAGAGAAATGAAATTATTATACCTGTCTATTTTACTAGA1530865
1530866ATTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAGGATTCATAAAAACATTACTGAAGTCAGTGAAAATGT1530931
1530932ATTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAGCGCCAACACAATTTGTTGTTGAGTTAAACTCAAAGA1530997
1530998ATTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAGTATTTGTCGGCGTATTTAACTGATTTAATTGATGAA1531063
1531064ATTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAGGCATTTATTGGTTTGTTAGTTATATTGCGAATAT1531127
1531128ATTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAGCTTAGTGACGGCACCAAGAAATTTATTGTTGTAGC1531192
1531193ATTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAGAATAGAAGTTATATATAAATATGAGGATGTTGTGA1531257
1531258ATTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAGCTCAAAAATATATGAGTTAGCGCTTTGTAATGAA1531321
1531322ATTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAGTTTCATTATAAAGGTCAAGACTTTCCGTTTACAACA1531387
1531388ATTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAGTTTTTCGGCGCTCTCCTTTTAGGAGGCGCCGTAAGG1531453
1531454ATTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAGGGAATTAATCGATATGATTGTAAGATGGTTATTAG1531518
1531519ATTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAGAATTCGGGGTCTTGTAAAACATTTAGAAAAGTTAAAA1531585
1531586ATTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAGTTATTTTTTTGTCTTATAATTGTCTTAAAGATGTTT1531651
1531652ATTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAGTAATTGTATTAAGCCTGCTGAAAGGTTTGTAAAGTA1531717
1531718ATTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAGCGCAACGCTATTGACAATACTATTAAGCCAATTAC1531782
1531783ATTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAGACCTCAAATCCCATCTAATCTTAATTGGTACAAT1531846
1531847ATTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAGCGAGGGAGCATTTGGGAAAAAATAGTAATGGTTATT1531912
1531913ATTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAGTCATTCGATACATATAAGAAAATAGAGAGATATTCA1531978
1531979ATTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAGAAAGAAGTACGGTAAAAGGTATAGATTACAATTACAT1532045
1532046ATTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAGATTACTATTGTTTCTTTAAATGTATTCGATTTTATT1532111
1532112ATTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAG1532141
Left flanking sequence : Till position 1530277 (length bp)
AATTTCTTCTCTTTTCCATAGTTCCATACTAACTTATTTTGGCCGTTTTGTCTGTCTTAATTTCTGGTAT
CATTATAATATTTCTGCTATGTTCACTTGT
Right flanking sequence : From position 1532141 (length bp)
TTATAAATATTCTGTCCTATATTTTCAGTATCAAAATTTACATTGTTAATTGCAATATTAAATGCAACAC
CTATAGTGGAAATCATCCATAATTTTAGGT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp