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CRISPRs details
NZ_CP014705_3
Flanking alignement tool
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NZ_CP014705_3                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium butyricum GCF_001646605
RefSeq :
NZ_CP014705 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP014705_3
DR consensus (30 bp) :
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
Number of repetitions :
58
Begin Position :
623697
End Position :
627450
623697
ATCTAAATACATCTCATGTTACTGTTAATC
GTACTATCTAGTAATTCGAATAGAGCCTTTTCTCTT
623762
623763
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CAATCTACCATGTAATCTAAATTAGAGTTTAAATTT
623828
623829
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TGAATATTTTTTAATGTATCTATATATTTTTGCTTT
623894
623895
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
GCAATATAGTGAAACGTGTTCGGATTATCCTTTCG
623959
623960
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CTAAATGCTCTACGCAACATTGTATATTGTTGTTC
624024
624025
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TAGTTATTTGATGTATTTTTTCTTCGTTGTACCA
624088
624089
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TGCTTCTCGTACATATACAGAGTATTTTGGTTCAA
624153
624154
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CTCAAGAAGAACCACCAAAAAAGAGGGAGTTCGG
624217
624218
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
AAAACGCTAACAATGATTTAGGTAACTCAAGTTTAA
624283
624284
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTTAACTTTATTAACATGATTATACCCCGCATAT
624347
624348
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
AAATAAATTAAAAGATAAGGTAATGATTATAAATTG
624413
624414
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
ATGCGTTTTTTAGAGCGTTCGACAATGAGAATTACA
624479
624480
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
ATTAAAATTACAGATGGAGAAAATGCAAAAGAAAAT
624545
624546
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTTAATAATTGGAATTGCATTTGGATTTCTATTAAA
624611
624612
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TGTGCTTTGTCAAGAACAATTTTGTTACTGTTTGCT
624677
624678
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CATATTAAATACACTCTATCTCCTAAAATTAACCAT
624743
624744
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
GTTCTGTTATCGCTATTATACACGTTCATAATATTC
624809
624810
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
AATAACGATTTTAAAAGGAAGTTCAAGGAGGGATTA
624875
624876
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TATTGCCAATTGCTGTTCAATTTTAGTTGCCATATAT
624942
624943
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
AGTGATAGTAATTCAAACAGTTCTAGTGCTTCGGT
625007
625008
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CTCAATATATGTGTTTAATAGTGTTTATTCTTCTGG
625073
625074
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
AGAAATTCAAAACCATGTAAATACAGAAGAAGTAAC
625139
625140
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TCTCTAGCTTGTACAACATAAGCTTCTTTTTCATC
625204
625205
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
AAAATCCTGTAAATCCAAAATTTTCCCTCATTAGCT
625270
625271
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CTGTTTAGCGCCTGTGTGACATTCGTCAATTAAAACA
625337
625338
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
AAGATTAGATAAACTAGTAGGATGGCATATAGGAA
625402
625403
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTACGCCATATCTTAATAATAACAATAATAATTTATC
625469
625470
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTTAGAAATTCAGGACAAGATTAGAAAATTATCAAA
625535
625536
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTAGATTCAAGTACAGAGTTGGTAGATAGTTATTG
625600
625601
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTTGTTTTCTTTTCTTTGATTGTATTTTCTTTTT
625664
625665
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
GTTTTTAGAAAGATATAAAAAATAATTTTATGAGG
625729
625730
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
AATAGATATGATAATACAAAGAAAGTTTATAGCTT
625794
625795
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CAATTGGGTTTATGCATTTCTTATCTTTCTAAAAA
625859
625860
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TGGATGCTAATAGCATTAGAATTCATATTATAGA
625923
625924
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CAATTGCAACAAGATTTACAGAAAAAGATGTAAC
625987
625988
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTGGGATATAGATTTACCAAGTTTGAATTACAACAA
626053
626054
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
AAATTCAATCTACTAAAAGCAAATGATATATATA
626117
626118
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTTATTTCTTAAAACCTAACACAAAACCCACAACT
626182
626183
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
GTTAAGTCTCTGTGTTTAAATTCTTTAACTATTGT
626247
626248
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
ATTGTTTTGATATATTTTAGTTAATTCATTATATTT
626313
626314
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TCTTACTTGACTCCCATCATTTGCTAAAACTGTT
626377
626378
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
AACTAGCTAAAAGTATAGCAGATGCAAGTTTCTT
626441
626442
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TAAAATATATAAAGATGGTTTTAATATATCAGATGA
626507
626508
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
GAAATAGTTAAAAGCGTACAAGCAACAGGGAAATA
626572
626573
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTTCAGTATTTTCAACTATTGTATTGTTTTCTTC
626636
626637
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
AATATTTTATTTAATCTATTAACATATTCTTCTTTT
626702
626703
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
GCCTTCCTACAGGTAGTGGCAAAACTATTTTGATGGC
626769
626770
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTAGAGGATATAAAACATAAATAAATAAAATCAA
626833
626834
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CAAAATCTATTATATAATTAGTACATAAGATAAA
626897
626898
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
ATAGCATAAAATAAATAATAAGAGGTGTAAAGATA
626962
626963
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CTATCATTGTATGTCAAACTTGTTAATGTCGTATA
627027
627028
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
GAGGATGTTAACAGTTAAATAAAATTAAAGGGAGT
627092
627093
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CATAAAGAAACATTAAATATTATAATAAAGTTAAG
627157
627158
ATTTAAATATATCTAATGTTACTGTTAATC
ATTCTCTTTATATTGAGTATATAACTGATTATTAGT
627223
627224
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTGGAAAGTTTTTAGATGTATACACCATTGAAAACAG
627290
627291
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
TTTTAGATTTGAAAGCTTCTAATAATTCATTGTTT
627355
627356
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
CCAACTGTATTTGATATTTTTTCTTTTCTTGCTAC
627420
627421
ATTTAAATACATCTAATGTTACTGTTAATC
627450
Left flanking sequence : Till position 623697 (length
bp)
CTGTTAATTATAGACTTTATAATATGATCGTATAAAAGTGTTGGCAATCTAGTTCCTGTTAATTCGTTAA
TTCTCTATTAAAATCCTTTTTCTGCAACCA
Right flanking sequence : From position 627450 (length
bp)
CAAAGAAAACAAGCCATTTATCCACTTTAATAAATTCCATCTATACTAGATATAATAACACTTCTACTAA
TAAATTTCCAGCTGAATTACTACAAAGTAG
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp