CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NZ_CP016086_4
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NZ_CP016086_4                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium saccharobutylicum GCF_002003285
RefSeq :
NZ_CP016086 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP016086_4
DR consensus (30 bp) :
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
Number of repetitions :
33
Begin Position :
2817546
End Position :
2819664
2817546
ATTTAAATACATGTCATGTTAATGTTAATC
CTACACTTACTCTGTAGCTACCCCATGGCTTACT
2817609
2817610
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
ATTTCTTCCTTTTCTGTTTGCTATATTGGCTAATTT
2817675
2817676
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
ACTTTGAGCCAGTTATAGATAAGCTTATTAAATA
2817739
2817740
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
AAGATGAATAATGAAAGGTATAGATATTTCAAATAA
2817805
2817806
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
AGGTTAAAGTTATTACCAAAGAGTGTAATTACTGC
2817870
2817871
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TTAAACCGCCTTTTGGATACATAGGTATCTTATGGTT
2817937
2817938
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TTTGATTTGTTTTAGTCTTCTTTTTTTTATACAA
2818001
2818002
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
ACATAGTTACTTGGGCTTAAGTTATCTATTGTAGAT
2818067
2818068
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TCCAGCTAATGCTAGTGTATTACAAATAGATGGAA
2818132
2818133
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TTTATTCTTTTTGCTCGTACTAAACTATTATCTACA
2818198
2818199
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
ATAGATGGATTTACTCAACTTGGATTCGATGCAAA
2818263
2818264
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
AAAGTATTTAAAATAGAGAGGTGATAAATGATGAG
2818328
2818329
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
AACTATATTAATTTCATCATCTTTTAAATCAATGTA
2818394
2818395
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
CGAAAACTGATAATCCAAGTGACCCTGCTCCTTC
2818458
2818459
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
CTTGTGCAACAGACTTAAACTTAACATTATCAGAA
2818523
2818524
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
CCAACAGTTAATTTTTCCATCTTGACCTTTTATAT
2818588
2818589
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
AAGGTAGGCATATTTAAGTAGATTTTAAGAAGCTTT
2818654
2818655
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TTTTACTGATACAAACACTAAAACTGATACTAAAAC
2818720
2818721
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
ATAATGGTGGTAAATTCTACATGGTAATTCCTAA
2818784
2818785
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TATTCCGGAAATGTTGATATTTATTTAAAATTAGC
2818849
2818850
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
GCAAATTTAATTTAAGGAGGAAATTATTATTATGTT
2818915
2818916
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
ACTCATGTTACTATATGTTATACAAAAAGTGGTAG
2818980
2818981
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TAGTAAAAGTGAGGTTGAACATATGATAAAACATA
2819045
2819046
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TTATGGTTGCTCTGTTAGTGGATTTTCTTTTTCTGT
2819111
2819112
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
ATTTAGAAATAGATAAAACTCAAGAGAATAGAAT
2819175
2819176
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
GACTCACTTTTGTAAGGTCAGGTAATTCAGTTCGT
2819240
2819241
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TCATAAAGAAAATAAGAATCGCAAATATTAAAATATC
2819307
2819308
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
ACGTAACTATTATTAGAATGAAACGTATTTATACT
2819372
2819373
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
GGTTAATCCTAAATCAATTGCCCATTGTTCCATCAA
2819438
2819439
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TGACTTGGGTAAAGAACATCAGACTTTAGTTGTTAT
2819504
2819505
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TATCAATCAAATCCTCTTAGTGCATATTTCATCA
2819568
2819569
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TTCAAGGTATTCTGATTTTACATTTAGTCAGTTGAG
2819634
2819635
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
2819664
Left flanking sequence : Till position 2817546 (length
bp)
TCTGATTTTTATGCTAAAAACAATATGTCTTTTACAATTGGTTTCATCATAGTTAATGTTAGTCTTTAAA
TTATACAAAGCACAAGTATGTTTTAGATAA
Right flanking sequence : From position 2819664 (length
bp)
CCCTAAGAAAAAAGCCACTTCTTATATTAAGATAATGCTTTCATTATAGTTAGTGTAACACATCCTTAAA
AATTTACCAAGCACCCTCAACTTAAATTAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp