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CRISPRs details
NZ_CP016087_7
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_CP016087_7                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium saccharoperbutylacetonicum GCF_002003305
RefSeq :
NZ_CP016087 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP016087_7
DR consensus (30 bp) :
ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG
Number of repetitions :
28
Begin Position :
3635366
End Position :
3637172
3635366
TTTTTCATTCCAATATGGATATATTTAAAG
TAACATAATTGTTATTTGCTCAATTACTCTAAAGGA
3635431
3635432
ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG
TTTTAAGTATTTTGAACTATTTGCTGGTTCAGGTAT
3635497
3635498
ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG
CTACTGCATTACCACACCTTGCCTTTTGCTCTGTAGT
3635564
3635565
ATTTACATTCCAATATGGCTATATTAAAAG
TAATTTTAATAGTGTAGAAATTTCTTGCTGACTTAA
3635630
3635631
ATTTACATTCCAATATGGAATATTAAAAGT
GTTAAGGCTTTTTTCTTGCTATCCCTTTTATCCTT
3635695
3635696
ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG
CCGCTTCAATTAATTTTATGTAATTCATGATCCT
3635759
3635760
ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG
CTCCCATGAACTTTATTTTGAACAAAAGTAAATTAA
3635825
3635826
ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG
AACTTTTTAAACATGCTTCAATTAAAGTTTTAGCACC
3635892
3635893
ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG
ATCTTTCTTTGTTGCACAGGCATATATTTCTGCTCC
3635958
3635959
ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG
TAATACAACTTGTAAGATTTTAACTTCATTTGATAA
3636024
3636025
ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG
ACTAAAGGATTGCATAAAGTAAGTATCACAATAACA
3636090
3636091
ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG
CTATTCCTCCATGTGATTCATGATATGTTATATTTG
3636156
3636157
ATTTACATTCCAATATGAATATATTAAAAG
GATTCCAGAGCATACATGTTATATAGAATTATTCTT
3636222
3636223
ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG
GTTTTTGTAAGTTCCAAGTCTTGTATAAACATCAAT
3636288
3636289
ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG
GCCTGTTTAATAGTTGAATCATTAGCTTTCATGCTT
3636354
3636355
ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG
GTGGCCTTATCAGTTACATCAATTAAAAACTTCTCA
3636420
3636421
ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG
CCAAGAAAATGTGATTGCGGTGGAGCTAATGAATTT
3636486
3636487
ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG
GGATTTATCATTAGGAATTAAAACAAACACATTAAC
3636552
3636553
ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG
GCTTGTACTGCTGTTTCACTTCCTGTTGTATCCCAA
3636618
3636619
ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG
ATCCAATACTTACTCAAACTCAAATGATTATAAGGA
3636684
3636685
ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG
TGCTAATCAAGCATGGGAAGAAATAAAAGCTACTAT
3636750
3636751
ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG
TGTTTTTGCGTTACTCTTTTTTCGTTTCTTACTTTG
3636816
3636817
ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG
TTCTCTAGCCCGTTCTATTGTACAAGTAGTGTTAAG
3636882
3636883
ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG
TATATTCAATTAGAGGATGATAAGGGCAAAATTAAT
3636948
3636949
ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG
AGGTTCTGGGTAGCACCTGCAATTATATATATTCCC
3637014
3637015
ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG
CAACTAAAAGAAGCTAAATTCGTCACTAATTATGTA
3637080
3637081
ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG
ACTTGGTGTCGCTGCCCAGAACCTAGCTTTAT
3637142
3637143
ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG
3637172
Left flanking sequence : Till position 3635366 (length
bp)
AACTTTTCCGATTTCATATGTTTTTATTATGGCATCCATGCTGCCTATATGTTCTTCATCAGAATAATCA
ATAATTAGTTTCAGAGTTTTATTAGTTCCA
Right flanking sequence : From position 3637172 (length
bp)
ACACCTCTTATTTTAACCCCTATTAATGGGGGGTGCGACACTAGTTTTTGTCGATGTCTTTTCATTACCT
ATTTATATTGAGCCAATGATAATGTATTTT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp