CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NZ_CP016089_4
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NZ_CP016089_4                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium saccharobutylicum GCF_002003325
RefSeq :
NZ_CP016089 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP016089_4
DR consensus (30 bp) :
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
Number of repetitions :
33
Begin Position :
2818158
End Position :
2820276
2818158
ATTTAAATACATGTCATGTTAATGTTAATC
CTACACTTACTCTGTAGCTACCCCATGGCTTACT
2818221
2818222
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
ATTTCTTCCTTTTCTGTTTGCTATATTGGCTAATTT
2818287
2818288
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
ACTTTGAGCCAGTTATAGATAAGCTTATTAAATA
2818351
2818352
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
AAGATGAATAATGAAAGGTATAGATATTTCAAATAA
2818417
2818418
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
AGGTTAAAGTTATTACCAAAGAGTGTAATTACTGC
2818482
2818483
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TTAAACCGCCTTTTGGATACATAGGTATCTTATGGTT
2818549
2818550
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TTTGATTTGTTTTAGTCTTCTTTTTTTTATACAA
2818613
2818614
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
ACATAGTTACTTGGGCTTAAGTTATCTATTGTAGAT
2818679
2818680
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TCCAGCTAATGCTAGTGTATTACAAATAGATGGAA
2818744
2818745
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TTTATTCTTTTTGCTCGTACTAAACTATTATCTACA
2818810
2818811
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
ATAGATGGATTTACTCAACTTGGATTCGATGCAAA
2818875
2818876
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
AAAGTATTTAAAATAGAGAGGTGATAAATGATGAG
2818940
2818941
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
AACTATATTAATTTCATCATCTTTTAAATCAATGTA
2819006
2819007
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
CGAAAACTGATAATCCAAGTGACCCTGCTCCTTC
2819070
2819071
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
CTTGTGCAACAGACTTAAACTTAACATTATCAGAA
2819135
2819136
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
CCAACAGTTAATTTTTCCATCTTGACCTTTTATAT
2819200
2819201
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
AAGGTAGGCATATTTAAGTAGATTTTAAGAAGCTTT
2819266
2819267
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TTTTACTGATACAAACACTAAAACTGATACTAAAAC
2819332
2819333
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
ATAATGGTGGTAAATTCTACATGGTAATTCCTAA
2819396
2819397
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TATTCCGGAAATGTTGATATTTATTTAAAATTAGC
2819461
2819462
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
GCAAATTTAATTTAAGGAGGAAATTATTATTATGTT
2819527
2819528
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
ACTCATGTTACTATATGTTATACAAAAAGTGGTAG
2819592
2819593
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TAGTAAAAGTGAGGTTGAACATATGATAAAACATA
2819657
2819658
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TTATGGTTGCTCTGTTAGTGGATTTTCTTTTTCTGT
2819723
2819724
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
ATTTAGAAATAGATAAAACTCAAGAGAATAGAAT
2819787
2819788
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
GACTCACTTTTGTAAGGTCAGGTAATTCAGTTCGT
2819852
2819853
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TCATAAAGAAAATAAGAATCGCAAATATTAAAATATC
2819919
2819920
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
ACGTAACTATTATTAGAATGAAACGTATTTATACT
2819984
2819985
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
GGTTAATCCTAAATCAATTGCCCATTGTTCCATCAA
2820050
2820051
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TGACTTGGGTAAAGAACATCAGACTTTAGTTGTTAT
2820116
2820117
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TATCAATCAAATCCTCTTAGTGCATATTTCATCA
2820180
2820181
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TTCAAGGTATTCTGATTTTACATTTAGTCAGTTGAG
2820246
2820247
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
2820276
Left flanking sequence : Till position 2818158 (length
bp)
TCTGATTTTTATGCTAAAAACAATATGTCTTTTACAATTGGTTTCATCATAGTTAATGTTAGTCTTTAAA
TTATACAAAGCACAAGTATGTTTTAGATAA
Right flanking sequence : From position 2820276 (length
bp)
CCCTAAGAAAAAAGCCACTTCTTATATTAAGATAATGCTTTCATTATAGTTAGTGTAACACATCCTTAAA
AATTTACCAAGCACCCTCAACTTAAATTAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp