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CRISPRs details
NZ_CP016277_2
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_CP016277_2                                                                                                                 
top
Strain :
Flavobacterium columnare GCF_001677395
RefSeq :
NZ_CP016277 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP016277_2
DR consensus (36 bp) :
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
Number of repetitions :
29
Begin Position :
2377783
End Position :
2379660
2377783
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
GACGCGAAGCTCGAAAAAGGTAAAAACTTC
2377848
2377849
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
CATTCGCAGCAGTCATGTTTTCTTTTCCGA
2377914
2377915
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
TATGAAACTATACTTTTTTAATACCCTTAT
2377980
2377981
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
AATGGAAAATTAGAGTTTATGACAAAAGAA
2378046
2378047
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
CTTTTTGTTCATACGTCGCTCTCGATTGA
2378111
2378112
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
AGACGATTTAACAGGTCCAAATAATAGAG
2378176
2378177
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
CTTATTTAAGAAATTTCTTTTAATTAATTT
2378242
2378243
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
TGTTCTACTGTTATTTTAGACAAAGGTTCT
2378308
2378309
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
ACTTGACTGCTCCTTCACTAAATCTAAATG
2378374
2378375
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
ACACGGATACAAATCCCTTTGAAACTTTTG
2378440
2378441
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
GCAATAGGCGAGGAAATTATAATGGATTAT
2378506
2378507
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
CAGCCACCTGCATTAGTCTTACCACAGAAT
2378572
2378573
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
AACATCTATTCGTTAAAGAATTTTGAATAA
2378638
2378639
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
ATATTTGCTTTTTGTGTAATATCATTTTTA
2378704
2378705
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
CCTATACCATCAACAAGAGTTCCAATTACA
2378770
2378771
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
ATTAAATCTATTTGGATTGTCTTGATCTAT
2378836
2378837
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
AAACTATGAATACAAACGTCAATCACAATG
2378902
2378903
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
AATTCCCCAGGTTTTAATCTATGAAATTCG
2378968
2378969
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
CTTTGCTCCGTTGTTATATCGACTTTCTA
2379033
2379034
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
TAACAAATGCCATTGAAAGGTTTTGTCAG
2379098
2379099
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
ATGCGTGACTCCATATCGTCAGCATCGTC
2379163
2379164
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
CTTCTTTAGTTCGTCGCCGTGAGGTTTTA
2379228
2379229
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
ACTACATCAAAGCTCTTAAAAATGGAGACA
2379294
2379295
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
TGAAGATTGATGATTTCAAAATAAAAGGG
2379359
2379360
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
CATCTTCTTCAAAACCACCATATTTAGCCC
2379425
2379426
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
TATAGAATACTTTTTAAGGCGAAGCGACAAA
2379492
2379493
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
GTCGCTTTGATAATCATTTTAATAACTAAA
2379558
2379559
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
TGATAATTTTGATTCATTAATAAATGATGA
2379624
2379625
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAATTATAATC
2379660
Left flanking sequence : Till position 2377783 (length
bp)
AAAAATGCTTCAATCTTGGTATAACGTGCCAAAAAAGAAGCATTTTTTTTAACGATATTTCGGCTTAATG
CTTTGATATTTAATAACTAAGCTGTTAGCT
Right flanking sequence : From position 2379660 (length
bp)
ACAAACACACCTATAACAAATATTGACTTGGTGTTTGTAAACCACAACTGAAATTACAATCGTAATTTTT
AACCAAATAATATCGTGTTTTGACTTCGTT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp