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CRISPRs details
NZ_CP016400_1
Flanking alignement tool
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NZ_CP016400_1                                                                                                                 
top
Strain :
Lactobacillus johnsonii GCF_001714745
RefSeq :
NZ_CP016400 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP016400_1
DR consensus (36 bp) :
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
Number of repetitions :
33
Begin Position :
503558
End Position :
505706
503558
AGAAGTAAAATATTTGATCTGACAATCATCTAAAAC
AATGGGACACACCGTCATTGGCGATGTAGT
503623
503624
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
TTATCGATTGGAGAACTATAAGTAGCAACT
503689
503690
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
CTTTATTGAACCTTATGTGTATCATCAGTT
503755
503756
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
TTGAGGATTGTCGTACTTATTGGAAACAAA
503821
503822
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
TCTTACTCGCTCTAAGGTTGTGACGATTGT
503887
503888
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
TACCTACTGGTTCTCCTCAATTAATTTCTT
503953
503954
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
TGTCGATAAATATCGACTTAGCATATCCAG
504019
504020
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
AAGATGATGTCTAAATAGCTAGCCTTCTTA
504085
504086
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
CATAATGAGTAAATCTAACTGAAGATACAG
504151
504152
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
CCTTGTGCGGAGTTCTAGCGAGAGTTGCAT
504217
504218
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
TGTTAGCAAGGCATAATGCCCTACGTTTCC
504283
504284
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
CTTTGACGAATTTCCTGAAATCGACTTTGA
504349
504350
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
CAAAAGCACCTTGCGGTTTCCAATCTGGGC
504415
504416
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
AGGTCGAAGTAATGTTGTCAAATTTTATCT
504481
504482
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
CCAAAGTGGAGCATCAACATTATCTGAATA
504547
504548
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
TTATCACTACATCAAAGATAAGATTGGTGT
504613
504614
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
AACTCAAGACACTAAACACTTATATACATA
504679
504680
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
TTTCTTTGACCTCTTTTCTTAACTAACTCA
504745
504746
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
CTCTAATCCGCCAAAATAATCTAGAACCTG
504811
504812
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
AAAATAGTAACTCAACATGCTTACGACTAA
504877
504878
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
CATGGGCTACGTTTGCAGGTATGTTAAGGA
504943
504944
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
CTCTATTTGTAATCTTTTAAATGTTCTTGG
505009
505010
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
GCTTGGAACAGAACTTTTTAAGCTCTTCAA
505075
505076
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
GCATTAATTTGAAAAGATTAAGTATTTTTT
505141
505142
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
TGTCAAAATTATCAACGCCAATTTCGTTAA
505207
505208
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
CAAATTGTCAGATATTAAATCAGTCTCTGC
505273
505274
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
AATCTCTTAACCTTATATATACATTATATC
505339
505340
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
CTGATTCGTTGCTTGACCTATCTATGCCTT
505405
505406
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
GGTTGGATTTACTATTTAAAGAATTAGATG
505471
505472
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
GCTTAAACTCTTTGGAACTTCAAAATATGCT
505538
505539
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
GAAAGATCGAACTGCATATAATGAGTTAAG
505604
505605
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
AAAGAATTGGATTAATTTTTCCATTTGTGT
505670
505671
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
505706
Left flanking sequence : Till position 503558 (length
bp)
AGAAGCAAAAGAAAATGGTAATTTAGATAAGATTACCAAATTCAATAAAAGAAAAAGTCATTAATATCAA
TATTTTCAGTTAATACTAATGACTTTTATA
Right flanking sequence : From position 505706 (length
bp)
CGATAATTTATAATTATCCTTTAATGATAGCTGTTAGTACCAATCAACAAGGTCCCCATCAATGTAGAAG
TAATCAGCATCTTTCGGATAAACCAGACCC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp