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CRISPRs details
NZ_CP017006_2
Flanking alignement tool
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NZ_CP017006_2                                                                                                                 
top
Strain :
Sulfolobus sp. A20 GCF_001719125
RefSeq :
NZ_CP017006 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP017006_2
DR consensus (25 bp) :
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
Number of repetitions :
69
Begin Position :
13881
End Position :
18271
13881
CTTCCAATCCCTTGTGGGACGCATC
GTAGTATATTCCCAGTTTACTTCAATGTATCAAGTTTTGT
13945
13946
CTTTCAATCCCTTATGGGATGCATC
TTGACAACTTAACAGTAGACGATATCTATAAGCTAATAAG
14010
14011
CTTTCAATCCCGTTTGGGATGCATC
TCTTCTACTTGAGTCCACATTCGGACTTGACCTCTTCGG
14074
14075
CTTTCAATCCCGTTTAGGATGCATC
TTTACGCAATAACAGCATATGTTCAACTGCCTACTGG
14136
14137
CTTTCAATCCCGTTTGGGATGCATC
TTTAATTCTCCAACTCCTTCAACATAGTAAGCTAC
14196
14197
CTTTCAATCCCGTTTGGGATGCATC
GAAAAAGTACTGCGGAAATAGGGAATAAAATTATAAATCTAA
14263
14264
CTTTTAATCCCGTTAAGGATGCATC
AGAGTTTTTTTGGTAAAAGAAGGTAAAAGTATAAAATTTGA
14329
14330
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
AAATGTGTGAAGCACAAATCGATCCCCAAATCCAGGAATT
14394
14395
CTTTCAATCCCGTTAAGGATACATC
TCGTGTTCTTAGCCAATTTGTACAACAAATAACAAAGTGA
14459
14460
CTTTCAATCCCGTTAAGGATACATC
TTGAGCAGACACAGGAATAGCATGGGTTGGAACAATTTAG
14524
14525
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
GAGGAAGATAAGGACACTGATCCTCGTAACTGATGGCAT
14588
14589
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
GGAACCGTATAAGGAATACATACATAGGGCATGGGGGAC
14652
14653
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
AGGTGGTGAGACATTCCTTTACCTAAATCAAACTATAA
14715
14716
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
AGATCCACCTAGCGTTACTAAGTTTACGGAAAGAGAGA
14778
14779
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
GGGATCTTTGATGTAATTTACGGTCTATCGTTCCTAGG
14841
14842
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
GTGAACTGGGATTACTAAAGTGGGAAAATGAGGATAAGCA
14906
14907
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
AAGCCACAATATTATGCTTTAGCAAAAATACAAGTACATA
14971
14972
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
GTCTATTATATGTCACTGATTACCAATGTTAAAATTGA
15034
15035
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
TCATATAAGCTGTATGATTGCCATACAATTTTGTAAAC
15097
15098
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
AGTAAACAAACATTTGCTCTAGTTCAGCAGAGCACACAGTT
15163
15164
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
CATACCGAATGGGGCACAGAGTCACAATGTTGCTTATGT
15227
15228
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
AAAAAATCAATTTCTATAGTATAAAGATTTTAGAAGAAAT
15292
15293
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
AAAAAAATATGATATAAACTTTTTATACAAAAGATTTCTATT
15359
15360
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
CAGTCTCAAACCACACAAACCCAAATTAAACAAAAATCCT
15424
15425
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
TTGATGAGAGCAGACCCAGTAACAGCTATGAATTCTTTTTA
15490
15491
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
TTTTTTTATACGCAGATGTTAATAAACTGAAAATAGTTTA
15555
15556
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
GTTTGGATGCTGGGTCTGCACCGTAGTCAAGAACGATA
15618
15619
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
AGTAAACAAACATTTGCTCTAGTTCAGCAGAGCACACAGTT
15684
15685
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
CATACCGAATGGGGCACAGAGTCACAATGTTGCTTATGT
15748
15749
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
AAAAAATCAATTTCTATAGTATAAAGATTTTAGAAGAAAT
15813
15814
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
AAAAAAATATGATATAAACTTTTTATACAAAAGATTTCTATT
15880
15881
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
CAGTCTCAAACCACACAAACCCAAATTAAACAAAAAATCCT
15946
15947
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
TTGATGAGAGCAGACCCAGTAACAGCTATGAATTCTTTTTA
16012
16013
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
TTTTTTTATACGCAGATGTTAATAAACTGAAAATAGTTTA
16077
16078
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
GTTTGGATGCTGGGTCTGCACCGTAGTCAAGAACGATA
16140
16141
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
TATAAAAGGTTTATTAATATACGTTTTCATAATTTCTTT
16204
16205
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
AGGGTGGCTAATGAGAGATGGTGAAACTGTTGAGATA
16266
16267
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
CGGACATACTAATAGCGCTTAGCCAAGAACCTTTAACAA
16330
16331
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
TTGCAGAGTTCACAGGTCACAAGTTAACTAAAAGAC
16391
16392
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
AGTAAACAAAATGTGTTGGTCTACAAACTTAATGTCAGAGAT
16458
16459
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
AAATCACTATTTTTTAGACCTATGTTTTTACAAAATTATAC
16524
16525
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
ACAAAGAGAGCTATGAGCTTGGCTGTGACTGTCATGA
16586
16587
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
ATATTCTCTTCTAACACTTCATAGTCTTCTAATGTGTTG
16650
16651
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
CATCCCTATTAACATTAAGGATCCCAGAGGATGGGC
16711
16712
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
AAAAGGCTAGTAGTTAAAGATGAGCTCAACGTTTACGT
16774
16775
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
TGTGATGAATATTATTCGTTATGAGCCCCTAGATTTTAG
16838
16839
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
ACTATTTTTCTCTTGATGTGCCCCCTAAATTTTGTGAACC
16903
16904
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
AATATCTCACTGATCTTATACTTTATCATTCCAATCTC
16966
16967
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
TGCGAGATAAGGAAAGGAGTCCAGCAATCGAATCAAT
17028
17029
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
TAAAGATTATTACCTTATTATAAGGGTGAAACAAATGA
17091
17092
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
TTAAAGTCAGTGATTGGTAATAGGAAAATTATTGGACATTT
17157
17158
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
AAGAGGATAGCTGAGAAGTTTAAAGAGAAATATGGAGT
17220
17221
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
GTTGAGAGTAAGACCTAGGGAAGGGTTTGATATATTTGCTCT
17287
17288
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
TAAAAGGTGCGGATAAGGGTAAAAAGTACGTATTAGA
17349
17350
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
CTAGCGTTGAAACGTAACATCACTAGGAGCGAGCTTATA
17413
17414
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
AAAAAACTAATTTTTCGATTTTTTCAAAAAGGCTTAA
17475
17476
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
GTTACTCACGACATGGTCTTTTCGGCAATAAAGAGATTAA
17540
17541
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
AAACCTATGGAAAATTAACCCCTTAAACTTCAAGATGT
17603
17604
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
CCAGATACATCGCCAGAAGGTACACCGAAACTGTTATAC
17667
17668
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
TGATTTCTTGTGATCTTATGCGAAATCTTGCGAAATCT
17730
17731
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
AAAGAACCTGCAGGAACTCTGGCACGGGATAAAAAATAG
17794
17795
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
ATCAAGGTAAACCCTCAGACTATATAGTGACTCCTTCCCT
17859
17860
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
TTGTTTACTCCCCAGTGTACACTTAATAAAAAAAGGA
17921
17922
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
CTAATATAATCTAGATCTTTGCCCTCCATTTTATAATAA
17985
17986
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
GCTGGGCCAACGACAGAAGCTACATCTTTCATTGCATTAT
18050
18051
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
ATATTCAAAGTGCGTATACTTATAAACTCTCTGACATTTT
18115
18116
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
CTTCTATAAACTGTTGAATTTCCTCTTTTGTCCCAATAA
18179
18180
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
ATATCATTCCAGCGGATCAAATGGGAAATCATATCCACGTAA
18246
18247
CTTTCAATCCCGTTAAGGATGCATC
18271
Left flanking sequence : Till position 13881 (length
bp)
TGTCCTTTTCCCCTTAGATAGTTTACTTCATCGATTCATCTTTATATTTCTCGTGTATCGAGAGAATCAG
AGAACCATTTTTTATGGGGAAGTGTTATAT
Right flanking sequence : From position 18271 (length
bp)
TGATTTGTTTATTAACCCCTATGCCTTATCTTCTCCTTCCCCTATAATAAATTTTACTTTACTCACCTTC
CCCTATCATGCGAGGGTTTTTCCTAGTAAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp