Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NZ_CP017015_2                                                                                                                 top


Strain : Spiroplasma helicoides GCF_001715535 RefSeq :NZ_CP017015 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP017015_2
DR consensus (36 bp) : GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACNumber of repetitions :45
Begin Position : 1068189 End Position : 1071129

1068189GTTATACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACCTAGTGCTTCATCATCATTAAAACTAAAAG1068254
1068255GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACCAATATCAGAAATTAAACTTTGATTAAAGT1068320
1068321GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACAATAACCAATTAGAACTGAAATTATATTTTTATGAC1068386
1068387GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACTTATAGTCATTAATGTGATTATTAAATTCTA1068453
1068454GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACATACATTAATCGCTACATTTGTTATTAATT1068519
1068520GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACATATTGAACCAACATGCGAGTTTGTTGCTG1068585
1068586GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACAACACTTTCTATAATATGTTCATCATTAAG1068651
1068652GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACAATTGATACTATTTCATTTCTCAAATTCTT1068717
1068718GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACATAAAAAAAGGAGAAATAAAAAATGATAGA1068783
1068784GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACAGATAATAATTAATACTGGTATATTATTAA1068849
1068850GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACAATTTTGTTCAACATAATTATCTAGATTTT1068915
1068916GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACACATGGGCGATAAAACAGAAATCGTGCAAA1068981
1068982GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACTGGATGTTGCTTACAACAAACTTGTTTACA1069047
1069048GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACTTTGCAATAAACATTAACATGAATATTGCT1069113
1069114GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACTCAATTGACCAAGAAATGTTTCTAGGTTTT1069179
1069180GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACGCTGCCTCTGTTGCTTCTGGAGTGGCTTCA1069245
1069246GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACCAGCAACCATTAAAGCAATGGTTAATAACG1069311
1069312GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACCATTATATTTTGGATCAGCAAAACATGTTA1069377
1069378GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACTTGAGCAAGTTGAGTGATATGAAGCATATA1069443
1069444GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACCTAGTTTTATAACTTATTTTATACATTTTT1069509
1069510GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACGTGGCAATGTTGAAATACAGGAAAACCACA1069575
1069576GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACTAAACTCTTCTAATCAAGGTCTATCTTTTT1069641
1069642GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACTATACTCTATTTTTTTATCTCATGAGATTA1069707
1069708GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACTAGTGATAAGTTTTAAAACCTTATCTATAT1069773
1069774GTTCTAATACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACTCGGCACTATTCAATGTTTTAATAAAAGTC1069839
1069840GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACATGTATAGGTGCAGTTTTATGTATTATAGG1069905
1069906GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACCTACATGAGATATCTTCGTGTCTAAATCTT1069971
1069972GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACCATTGAGAGAAAGGGTCTATTTTGTTTAAT1070037
1070038GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACGCTCTGTTTCTGCTAGTTTTTGGTCTTTTG1070103
1070104GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACCTGGGCATTCATTAATATATTTATCTACTT1070169
1070170GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACTAAGTGTCTTCCATGTATTGTTTGTCAAAA1070235
1070236GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACATCACAAGTGTGGAACTTATTTAAGTACAA1070301
1070302GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACTTGGTATAGTGAAATAGTCTTCTAAAACCT1070367
1070368GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACGAGCTAGGTTTGGAAGCCAACTAATTTTAA1070433
1070434GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACCTATTCCTAATTGACTAAAACCTAGTGCTT1070499
1070500GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACTAACAATCACATTAGGATTTGAATTTGATA1070565
1070566GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACACAACTCACCCAAGGCCTTTTGTTTTTTAT1070631
1070632GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACGACAGTACAGTGAATTCAATTTATGACATG1070697
1070698GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACAATAAGCCACTATCAATTAAACCAATCTCG1070763
1070764GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACTAACCAACAAAATAAGTAATTTACAAAGTA1070829
1070830GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACCAGAGGATATTGTGAATAACTATGGTGGTA1070895
1070896GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACAAAAGTATTTTTTTTTATTTTTACTCTTAC1070961
1070962GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACCATTATAAATTTTTTGTTCTATCTGGTCCG1071027
1071028GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAACAGTTCTAGTTCAAATTCACACTTAGATTTT1071093
1071094GTTCTACTACTACATAATTTTACAGGGTACCATAAC1071129
Left flanking sequence : Till position 1068189 (length bp)
GATAATGAAGATATAGCTAATATTTATACAAAACATAGAACTTTATCAAGTTTTTATATATTTATTCTAT
TTAAAAATACATAATGAAGTTATTTTATCA
Right flanking sequence : From position 1071129 (length bp)
CTCAAATCAAGTAAAATTTAGTTATTTTACTTATTTAATAAATATTGGAAAACAGGATAGCTTAAATCTA
AATTTTTAGTGTTATAGTTTACAATTAAAT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp