Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NZ_CP017267_2                                                                                                                 top


Strain : Vagococcus teuberi GCF_001870205 RefSeq :NZ_CP017267 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP017267_2
DR consensus (36 bp) : GTTTTAGAGCTATGTTGTTTTGAATGCTTCCAAAACNumber of repetitions :18
Begin Position : 680341 End Position : 681498

680341GTTTTAGAGCTATGTTGTTTTGAATGCTTCCAAAACATTCAAGGAGCGAAACAATCGACTAGATAC680406
680407GTTTTAGAGCTATGTTGTTTTGAATGCTTCCAAAACTGTTAGATAGAATGGAAAATAGCTTAGAGC680472
680473GTTTTAGAGCTATGTTGTTTTGAATGCTTCCAAAACTGGGTTATATGGCGATTATAGTGAGCTGTT680538
680539GTTTTAGAGCTATGTTGTTTTGAATGCTTCCAAAACATTCGACAATGGAATGTCACGCTAAACGAA680604
680605GTTTTAGAGCTATGTTGTTTTGAATGCTTCCAAAACTTATTCGGGTGCAATTACTGTATTAGTTTA680670
680671GTTTTAGAGCTATGTTGTTTTGAATGCTTCCAAAACTGTTAGATAGAATGGAAAATAGCTTAGAGC680736
680737GTTTTAGAGCTATGTTGTTTTGAATGCTTCCAAAACTTGATTACTGTTCTTTTTGCCATTTCTTGT680802
680803GTTTTAGAGCTATGTTGTTTTGAATGCTTCCAAAACATCTGGATGGAATGAGTATGCTGGTACTGT680868
680869GTTTTAGAGCTATGTTGTTTTGAATGCTTCCAAAACTATAAATCCACGAAAATACGTTAATTTTTA680934
680935GTTTTAGAGCTATGTTGTTTTGAATGCTTCCAAAACCACCATCTAGTTCTGTAATAACTTTACCTT681000
681001GTTTTAGAGCTATGTTGTTTTGAATGCTTCCAAAACGCTGAATTTTGTTATTACACGAACATAAAC681066
681067GTTTTAGAGCTATGTTGTTTTGAATGCTTCCAAAACGCTCTAGCGATTGCGCTATTCAATCCACGA681132
681133GTTTTAGAGCTATGTTGTTTTGAATGCTTCCAAAACATATACTTTCGCATGACTTCTCATACTATC681198
681199GTTTTAGAGCTATGTTGTTTTGAATGCTTCCAAAACCCATTTAGCCAGTAATAAAAACGGTAGGGG681264
681265GTTTTAGAGCTATGTTGTTTTGAATGCTTCCAAAACAAATCAATGAAGCTTATGATCAATTTCATT681330
681331GTTTTAGAGTTATGTTGTTTTGAATGCTTCCAAAACAGTTTATGGTATTCATTTTCCATGCGAATA681396
681397GTTTTAGAGCTATGTTGTTTTGAATGCTTCCAAAACGGAGACGCTATTTAAAGGATTTGTGGTAAG681462
681463GTTTTAGAGCTATGTTGTTTTGAATGCTTCCAAAAA681498
Left flanking sequence : Till position 680341 (length bp)
AATACAAATAGAGCTCTTTGAAAAATTAAAAATGAAGCATTTAAAACAAAAGACCTGCTATGAGTCTCTA
TAGTGCGATTACGAAATCTTTTTCTACGAG
Right flanking sequence : From position 681498 (length bp)
TTATATACATAATTGAAATACCCCCAACAATTTTTATGATTGTTGGGGTTTTTTTGTTTTGTTGAATGAT
TTATTGACACCCATCAAAATTGCTTGTGTT
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp