Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NZ_CP019030_4                                                                                                                 top


Strain : Lactobacillus fermentum GCF_001941785 RefSeq :NZ_CP019030 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP019030_4
DR consensus (28 bp) : GTGCTCCCCATGTATATGGGGGTGATCCNumber of repetitions :19
Begin Position : 1769172 End Position : 1770307

1769172GTGCTCCCCATGTATATGGGGGTGATCCTTTGGGATGCCGGTTATGGCATTACTGACTTAG1769232
1769233GTGCTCCCCATGTATATGGGGGTGATCCTACATTTGAGCGAAGGCCGTGTCAGCGTTGTCA1769293
1769294GTGCTCCCCATGTATATGGGGGTGATCCTAATATGTAGTGCAGACGAGCAAGAGATTGCTT1769354
1769355GTGCTCCCCATGTATATGGGGGTGATCCTAAAATTCGAGCCGAGTTCCGCAAGAAGTACCA1769415
1769416GTGCTCCCCATGTATATGGGGGTGATCCCAGCGCCTGGAAGTTAGCTAATAGAATGATTGC1769476
1769477GTGCTCCCCATGTATATGGGGGTGATCCTCACATCAATGTTAGCAATACTGATTTGGATAT1769537
1769538GTGCTCCCCATGTATATGGGGGTGATCCTTTAGTAGTCTTCGTCGTCTCGAATGTCATCAT1769598
1769599GTGCTCCCCATGTATATGGGGGTGATCCTGGCTAGCTACGAGGCTCAATTAACACGGGCCA1769659
1769660GTGCTCCCCATGTATATGGGGGTGATCCTGACTGCTTCGAGTGATCGCATTCCAGTGGTGA1769720
1769721GTGCTCCCCATGTATATGGGGGTGATCCTACGGCCGGCGTTACTTGCCTAGCAAGGGCACC1769781
1769782GTGCTCCCCATGTATATGGGGGTGATCCTTTGGCACAACTTATCAAAACTTGGCTGCGATC1769842
1769843GTGCTCCCCATGTATATGGGGGTGATCCTAAACTGATTACGCATTACTTTACCTCCTTTGGATCAATTGCC1769913
1769914GTGCTCCCCATGTATATGGGGGTGATCCTAATAACATGAATACGGATTATTACGCAAACGG1769974
1769975GTGCTCCCCATGTATATGGGGGTGATCCTACCGCTAAAGCTACAATCACATCTGCAAAATT1770035
1770036GTGCTTCCCATGTATATGGGGGTGATCCTGGTACAATTGAAGGATCTGAATTAGATATTGG1770096
1770097GTGCTCCCCATGTATATGGGGGTGATCCCGTTGTCCCAGTACCCGTGTTGGCGTCAGAAAT1770157
1770158GTGCTCCCCATGTATATGGGGGTGATCCTAATACACCTAGCGGGAAGCGTTGTCAACAGTT1770218
1770219GTGCTCCCCATGTATATGGGGGTGATCCCCCGGACTCGGCAAGCGTTGAATATGCACTAAA1770279
1770280GTGCTCCCCATGTATATGGGGGTGATCC1770307
Left flanking sequence : Till position 1769172 (length bp)
TGCTCCCCATGTATATGGGGGTGATCCCATGTTGGACATCCGGCAACCGGCACTTACACGGTGATCCTAC
CGGTTGGATCCGTGACCGCTATGGCACGGA
Right flanking sequence : From position 1770307 (length bp)
TACATGGGCTTTAGTCGTACGAAGGAGTGATATGGTTGAGAGAATGTACGGCCACTACTACTCACCAACC
ACGGTTTCAAACATCACTAAGCGGACGGAA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp