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CRISPRs details
NZ_CP019302_2
Flanking alignement tool
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NZ_CP019302_2                                                                                                                 
top
Strain :
Prevotella intermedia GCF_001953935
RefSeq :
NZ_CP019302 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP019302_2
DR consensus (47 bp) :
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
Number of repetitions :
39
Begin Position :
2111197
End Position :
2114161
2111197
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
ATAAAATTTAAAATTATGCAAACTTTTTT
2111272
2111273
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
GGACAACTTCAAAAAGTTATCTTTCAGCG
2111348
2111349
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
CGCCCTATCGTCATTTCAATGCCACCGAGT
2111425
2111426
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
CAAAAGCGGTCGTAAGGGCTTTTATCCCG
2111501
2111502
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
TGGTGCAACCAAGTGGAGCGTATATTGTA
2111577
2111578
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
TATCAAATACAGGCGCATACTCCTTGTACA
2111654
2111655
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
TTTCTTCAAATAATTTCCTGTGCCTACGTT
2111731
2111732
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
TTTTTCGTTTCGTTCACACGTTGATATTC
2111807
2111808
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
CCTGCTCTACTTGTTGTATAGTTTCGTTCT
2111884
2111885
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
AGGAAAGAATAAACAGTGCTTGGAAATAAT
2111961
2111962
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
CGCCTCAACATTGCCAATATCCTCTCTCTA
2112038
2112039
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
CTTAGGTATGTTAGTTAGTGGTGCTGTTGG
2112115
2112116
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
GGCTATGCGCTCGATGCATATAATACTAA
2112191
2112192
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
CACAGACACATCAATAATAGTAACTTTCTC
2112268
2112269
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
GCGGGTGCAGCACTTGCCTACTTATACACA
2112345
2112346
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
TTGAAAATTATTGACATTAAAGGAAAGGGC
2112422
2112423
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
ATTTAATCTAAAAACTTTCATATTTATTTA
2112499
2112500
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
CACGTGTAACGATAGCACAGTTTCCGTCCT
2112576
2112577
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
CTGCCACCGTAACAACGTTTGAGCCATTAA
2112653
2112654
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
AATAAACTGTAATACTTCTTTTAGGTCTAC
2112730
2112731
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
TATACGACCAAATATTGAAGCAGAACCTTA
2112807
2112808
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
TGACGCTATGGGTTACGAACTTACCCCAAT
2112884
2112885
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
GGAAAGATGTTGTTGTATTGCTTGCTGCAG
2112961
2112962
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
CAACAACGTTAAAAAGTGGCAACCCATTTA
2113038
2113039
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
GCCCGTCAAATACTCGGCTTAGCTTATCAA
2113115
2113116
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
CCACTCGAAAAAGGTAGTATCGGACGAAGA
2113192
2113193
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
AAGCTCAAAGCCTTTACAATGCTGCTATTA
2113269
2113270
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
AGGGGATTTAATAATGACATACCACTAGGT
2113346
2113347
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
CGATTGTTTTCTCGTCGCCTTTCACGAGT
2113422
2113423
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
GGAAACATAAAACCTAAATTCATATCCTTT
2113499
2113500
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
TGTCAGCCTTTCCGTATTTGTCCTTTGGCA
2113576
2113577
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
TTCTATTTGGTCTGATAATTTAAATTATGG
2113653
2113654
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
GGTTATTCTCTCGACCCTAATTGTCAGAAT
2113730
2113731
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
ATGCCGAAGATGTAAGTAATGGTAGTGCCA
2113807
2113808
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
TAAAAATTTATATTGAAAAGATATGATAAA
2113884
2113885
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
AAACAGTCTTTGAAAATCTTGTGAAAATGC
2113961
2113962
GTTGTATTTGCCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
GACTATGGTATCTTCGTTATCGTCTACTT
2114037
2114038
GTTGTATTTACCAATGCAAAGATACTAATTTTAAAGCTAATCACAAC
AACCTCCGAGCACATTACGAAATGCCTACT
2114114
2114115
GTTGTATTTACCAATGCAAAGATACCAATTCTAAAGCAATCACAACT
2114161
Left flanking sequence : Till position 2111197 (length
bp)
AAGTTCCATTCTTGACGAGTGGAACTTTATTTTGCTTGCATTTTTCTTTCTCTCTAAGCTTTCGTAACAA
TACTGATGTTCATTACTTTAATCTACTTGA
Right flanking sequence : From position 2114161 (length
bp)
AACGACACTTCCGATTTATTGTTCTAAAATCAAGTAAATGGGGCAATAAATTTAACACAAGCGAAAAGGG
GAAAATAGAGAAAAAGAGAGCTGGAAAATA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp