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CRISPRs details
NZ_CP019388_3
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_CP019388_3                                                                                                                 
top
Strain :
Winogradskyella sp. J14-2 GCF_001971725
RefSeq :
NZ_CP019388 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP019388_3
DR consensus (36 bp) :
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
Number of repetitions :
26
Begin Position :
550806
End Position :
552549
550806
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
TGTAAAAGGATTTGGAAAAGCTCTGCAAA
550870
550871
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
TTGAACTCTGGAACTAAAAAACCGCCCAAA
550936
550937
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
TACGCTGACGTTGTAGGCTAATTGAGCAGA
551002
551003
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
ACGACTGCAATGAACCAGTACCAGGTATCG
551068
551069
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
AAAGGCGAAGAGTGATGAATCTAGTAATAT
551134
551135
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
ACGTTTACCAAACACCTCTTGTTTTGCTGC
551200
551201
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
TGTTATTGTTTCGTTAATTATTGGACGATT
551266
551267
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
GGCGGCCACCAAGAGGACGAAGATATAGAA
551332
551333
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
TAAAAGCATAGGCATATTCACTTTTAAACT
551398
551399
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
TGGATAAGCTGATATCTTTACACGATTTCC
551464
551465
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
TGCTCATCCTCTGCCACCTTCGTTATTGCT
551530
551531
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
GGATTCATAGTTGCATCTGTGAAGGTTGTT
551596
551597
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
TACTAGGATCCGCTGTTGGGATTTGTCAAAA
551663
551664
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
CACAGTTGAAGTTAGTCAGCCAACGGCAGC
551729
551730
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
AGGTAGAACGCCGTCTTGTCTTTCTGTATA
551795
551796
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
AATCTATTTTCAATAATAAATAGTTTTTGC
551861
551862
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
TGTATCTAATGATAATTTGTCTATTGTTT
551926
551927
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
TAGACATCATCACACAAGCCAAACGTTTTT
551992
551993
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
CACCTCTTGATAATCATCTAATGTTCCTCC
552058
552059
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
TATGCGACCTGTGGTTTGCTGATTTTGTTG
552124
552125
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
AACTTTTGATCATATAATACCATTAAGTAA
552190
552191
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
AATAAAGATGCTGATACTATTACACCAGAA
552256
552257
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
GTTAACGATAATAGCATGGACTGTATATG
552321
552322
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
AAGTAATTTGTTGTGACACCAGAACCGCCA
552387
552388
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAATCGAACG
CAGTAAGATTCACAAACACACCGATTAAAATAAAATGAGGTGTTTGTAAACCACTTTAACACTCAAAAGCAGTATCGCGCTGGCAACTAC
552513
552514
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAATCGAACA
552549
Left flanking sequence : Till position 550806 (length
bp)
AAAAATGCCTCAATCTCACCTAATCACTGTAAAAAAGAAGCATTTTTTAAAACGACATTTCATTACAATT
AACTGTATATCAAGCAACAAACAATAGCCT
Right flanking sequence : From position 552549 (length
bp)
TAGTGAGATTCACAAACACACCATTTAAAAAAATAAGGTGTTTTAAAACTTTATCCTATAATACGCTTGT
GTTTAAGGTATGGTAACTACTACCATAATA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp