CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NZ_CP019389_4
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NZ_CP019389_4                                                                                                                 
top
Strain :
Seonamhaeicola sp. S2-3 GCF_001971785
RefSeq :
NZ_CP019389 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP019389_4
DR consensus (46 bp) :
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
Number of repetitions :
53
Begin Position :
3561886
End Position :
3565877
3561886
GTCGCTGCGCTCGGTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
GATGTCTTGTAAAAAATTGATGCAGTTCTT
3561961
3561962
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
ATAATCATCTAAAATAGTCTAAATCCGAGT
3562037
3562038
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
GGTTCGATTGCAAAGCCTTGTATCTATTTC
3562113
3562114
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
CACCGCTTGTAATATTACCGTTTAACGCT
3562188
3562189
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
CACAGGCTTTTTAACGCGCACCCCAAAAG
3562263
3562264
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
TTTAAGGTCGTCCATCTTTGCAACACCCTC
3562339
3562340
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
CTAACGATTTTATCAACCTGCTCCTGGCTT
3562415
3562416
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
CTAACGATTTTATCAACCTGCTCCTGGCTT
3562491
3562492
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
GTTAGCAGTAAGTTAAACAACCTACCAATC
3562567
3562568
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
AGATGAAAACAACACTACAATAGCAACTTG
3562643
3562644
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
AAGTTACTTTAATCAAATGCTGCTTAGTGA
3562719
3562720
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
AATTGGGTTTTTGGAATTAAAGGTGTGCCT
3562795
3562796
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
CAATCTCTTTTAAACCTGCTTTTTTGATGT
3562871
3562872
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
TTAAAAACAGATAGTTTATTAGTGGAACTT
3562947
3562948
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
AAATAATAAAAGGCGATGGGTACTCTATTG
3563023
3563024
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
CTATATTGAGATATGCGATTTACAAATTA
3563098
3563099
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
GTAGTTTCTTTTATCGTTAAATGTAGCCCT
3563174
3563175
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
CTTTATTTTGTGCATTTATATATCTATTAT
3563250
3563251
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
GGGTTATGACCAAGATACAGACCCTAATAT
3563326
3563327
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
TAATATTCAGTAAAATAGCCGTAATTATTA
3563402
3563403
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
TCTAATTTTGCCGGTACAGAAGTAACGGCA
3563478
3563479
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
TTGTATATAAGTGCTTTATAGCAACGGTAT
3563554
3563555
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
CCCCAATAAAATTTTGAAGGCTCACCTATT
3563630
3563631
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
TAAACTTATCAGCTCCTAGCGGTGCTGGTA
3563706
3563707
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
TTTGCTTTCAGCGCAAAGGCTTTTACGTCC
3563782
3563783
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
AAATGTTTATGTAGGTGTTAAGTATGTACT
3563858
3563859
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
AGAGTAATTAGTCTTTTAAGTTTGATTAAT
3563934
3563935
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
TCCGACTTTTATACATTTAGATTTTGATAT
3564010
3564011
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
AGGAATGATTAAATGTGCATGCAATGAAAA
3564086
3564087
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
TAAGGTATCATTTTCATTTTTACCACATAC
3564162
3564163
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
CTTGCTAGGTATTGGAGGGAATTATCTCAA
3564238
3564239
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
GAACAGTAGAAGTGGATGACATTGAATATG
3564314
3564315
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
ATATAAATTAAAAATTACTTACTTATCTAT
3564390
3564391
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
TGCGCCCAATGTGAAAAGTATAAAAGCAA
3564465
3564466
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
TTTGTTTAAGTTGTTCAACAATTCGCCCAA
3564541
3564542
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
CGGCCAATTAAAGTTAATAGAATCTGTAGT
3564617
3564618
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
AAAGAAATTAGATAAATCAAAAATTAAACA
3564693
3564694
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
ACTATAATGTATTTATCATTTTCTTTATCA
3564769
3564770
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
TTTAGAAATTAATATCAATCAAACTCCAGA
3564845
3564846
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
TACATTGAATATTAATGGAAATAACACCA
3564920
3564921
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
AGTAGTTATTTGTTCTTCTTTTGGTTTGTA
3564996
3564997
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
GGGTGGTGATACAAACCCAGACTTAGAAGA
3565072
3565073
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
TGCAACAGTAAACAGATTAATTGTTTTTCC
3565148
3565149
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
AAACTTCCATGAGCTGTAGGTAATCAATGT
3565224
3565225
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
TTTTATAATACAATGTGTTATTGTTTTTG
3565299
3565300
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
TGAACCCAGAAATAAAAGCACAATTAGATG
3565375
3565376
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
CTAGGGCTTAGGTTATTATTAGATATGTAT
3565451
3565452
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
GCACTACTCCTAGTGTTATTATTACAGTTC
3565527
3565528
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
AGACCAAACCGATTTGCAAGCAGCTTTAGA
3565603
3565604
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
TGTACCTGCAGTGTTTAAACAGCGTTGGAG
3565679
3565680
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
AAAGAGCGAATTTGCTATTTTTAAAGGCTA
3565755
3565756
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
TTTCGATAAAAAAGAAAATGGTGTTGTATT
3565831
3565832
GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG
3565877
Left flanking sequence : Till position 3561886 (length
bp)
GAAACTACTGCATACGCAAGCCTAAAATCTTTTTAACACGTCATTGACCGTTGTGAATTGCTTTATTCAC
CAATCCTATTTTAAACTAATGTGTTCATCG
Right flanking sequence : From position 3565877 (length
bp)
ATACTTGCCGTAATAGGCTGGTATCCTGTTTTTTAACTGCATTGTTAGATTTTACTTTTTTAATGCCTAG
TAAAACGTTATTTAAGCTTAACGCTTGCTT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp