Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NZ_CP019389_4                                                                                                                 top


Strain : Seonamhaeicola sp. S2-3 GCF_001971785 RefSeq :NZ_CP019389 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP019389_4
DR consensus (46 bp) : GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGNumber of repetitions :53
Begin Position : 3561886 End Position : 3565877

3561886GTCGCTGCGCTCGGTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGGATGTCTTGTAAAAAATTGATGCAGTTCTT3561961
3561962GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGATAATCATCTAAAATAGTCTAAATCCGAGT3562037
3562038GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGGGTTCGATTGCAAAGCCTTGTATCTATTTC3562113
3562114GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGCACCGCTTGTAATATTACCGTTTAACGCT3562188
3562189GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGCACAGGCTTTTTAACGCGCACCCCAAAAG3562263
3562264GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGTTTAAGGTCGTCCATCTTTGCAACACCCTC3562339
3562340GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGCTAACGATTTTATCAACCTGCTCCTGGCTT3562415
3562416GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGCTAACGATTTTATCAACCTGCTCCTGGCTT3562491
3562492GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGGTTAGCAGTAAGTTAAACAACCTACCAATC3562567
3562568GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGAGATGAAAACAACACTACAATAGCAACTTG3562643
3562644GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGAAGTTACTTTAATCAAATGCTGCTTAGTGA3562719
3562720GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGAATTGGGTTTTTGGAATTAAAGGTGTGCCT3562795
3562796GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGCAATCTCTTTTAAACCTGCTTTTTTGATGT3562871
3562872GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGTTAAAAACAGATAGTTTATTAGTGGAACTT3562947
3562948GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGAAATAATAAAAGGCGATGGGTACTCTATTG3563023
3563024GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGCTATATTGAGATATGCGATTTACAAATTA3563098
3563099GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGGTAGTTTCTTTTATCGTTAAATGTAGCCCT3563174
3563175GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGCTTTATTTTGTGCATTTATATATCTATTAT3563250
3563251GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGGGGTTATGACCAAGATACAGACCCTAATAT3563326
3563327GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGTAATATTCAGTAAAATAGCCGTAATTATTA3563402
3563403GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGTCTAATTTTGCCGGTACAGAAGTAACGGCA3563478
3563479GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGTTGTATATAAGTGCTTTATAGCAACGGTAT3563554
3563555GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGCCCCAATAAAATTTTGAAGGCTCACCTATT3563630
3563631GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGTAAACTTATCAGCTCCTAGCGGTGCTGGTA3563706
3563707GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGTTTGCTTTCAGCGCAAAGGCTTTTACGTCC3563782
3563783GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGAAATGTTTATGTAGGTGTTAAGTATGTACT3563858
3563859GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGAGAGTAATTAGTCTTTTAAGTTTGATTAAT3563934
3563935GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGTCCGACTTTTATACATTTAGATTTTGATAT3564010
3564011GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGAGGAATGATTAAATGTGCATGCAATGAAAA3564086
3564087GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGTAAGGTATCATTTTCATTTTTACCACATAC3564162
3564163GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGCTTGCTAGGTATTGGAGGGAATTATCTCAA3564238
3564239GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGGAACAGTAGAAGTGGATGACATTGAATATG3564314
3564315GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGATATAAATTAAAAATTACTTACTTATCTAT3564390
3564391GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGTGCGCCCAATGTGAAAAGTATAAAAGCAA3564465
3564466GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGTTTGTTTAAGTTGTTCAACAATTCGCCCAA3564541
3564542GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGCGGCCAATTAAAGTTAATAGAATCTGTAGT3564617
3564618GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGAAAGAAATTAGATAAATCAAAAATTAAACA3564693
3564694GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGACTATAATGTATTTATCATTTTCTTTATCA3564769
3564770GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGTTTAGAAATTAATATCAATCAAACTCCAGA3564845
3564846GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGTACATTGAATATTAATGGAAATAACACCA3564920
3564921GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGAGTAGTTATTTGTTCTTCTTTTGGTTTGTA3564996
3564997GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGGGGTGGTGATACAAACCCAGACTTAGAAGA3565072
3565073GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGTGCAACAGTAAACAGATTAATTGTTTTTCC3565148
3565149GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGAAACTTCCATGAGCTGTAGGTAATCAATGT3565224
3565225GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGTTTTATAATACAATGTGTTATTGTTTTTG3565299
3565300GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGTGAACCCAGAAATAAAAGCACAATTAGATG3565375
3565376GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGCTAGGGCTTAGGTTATTATTAGATATGTAT3565451
3565452GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGGCACTACTCCTAGTGTTATTATTACAGTTC3565527
3565528GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGAGACCAAACCGATTTGCAAGCAGCTTTAGA3565603
3565604GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGTGTACCTGCAGTGTTTAAACAGCGTTGGAG3565679
3565680GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGAAAGAGCGAATTTGCTATTTTTAAAGGCTA3565755
3565756GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGGTTTCGATAAAAAAGAAAATGGTGTTGTATT3565831
3565832GTTGTGAATTGCTTTCAGTTCTTTAAATTTATGGATGATTCACAGG3565877
Left flanking sequence : Till position 3561886 (length bp)
GAAACTACTGCATACGCAAGCCTAAAATCTTTTTAACACGTCATTGACCGTTGTGAATTGCTTTATTCAC
CAATCCTATTTTAAACTAATGTGTTCATCG
Right flanking sequence : From position 3565877 (length bp)
ATACTTGCCGTAATAGGCTGGTATCCTGTTTTTTAACTGCATTGTTAGATTTTACTTTTTTAATGCCTAG
TAAAACGTTATTTAAGCTTAACGCTTGCTT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp