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CRISPRs details
NZ_CP019609_2
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_CP019609_2                                                                                                                 
top
Strain :
Vagococcus penaei GCF_001998885
RefSeq :
NZ_CP019609 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP019609_2
DR consensus (36 bp) :
GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAAC
Number of repetitions :
32
Begin Position :
1801260
End Position :
1803349
1801260
GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAAC
TATATCACAAGATTTTAAAAAAATAGTTGT
1801325
1801326
GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAAC
TAGATAGTCGCATAGTTTTAGATGATGATTA
1801392
1801393
GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAAC
CAAAATAGTTATCCATTATTTTTTATCAAGA
1801459
1801460
GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAAC
GTTTGCATTATCGACGAAGCACCACTCAAT
1801525
1801526
GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAAC
ATCACTTCTACCCAACTTTTGCCGTCCCAT
1801591
1801592
GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAAC
ACTGATTTACCACTACCACAACCTGACACG
1801657
1801658
GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAAC
CAAAAATCAGTTAGACGACAGAAAAGGTTGT
1801724
1801725
GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAAC
CAAAATAGTTATCCATTATTTTTTATCAAGA
1801791
1801792
GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAAC
GTTTGCATTATCGACGAAGCACCACTCAAT
1801857
1801858
GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAAC
ATCACTTCTACCCAACTTTTGCCGTCCCAT
1801923
1801924
GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAAC
CTACGGCGGTGCAATCGGCACGTACGGGCG
1801989
1801990
GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAAC
AAAATTATCTCAATTAAAAAATGTTTTGGC
1802055
1802056
GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAAC
AACATGTTTATCGTTTATGATGACACCATT
1802121
1802122
GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAAC
TAAAGTTGTTATCCTTCTGCTCTTCGCTAC
1802187
1802188
GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAAC
GTTTTTTAAGACAATCCTATCCAGAGCTGT
1802253
1802254
GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAAC
AAAATTATCTCAATTAAAAAATGTTTTGGC
1802319
1802320
GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAAC
AGTGAAGCTGATACTTGTTTTCGTTCATCA
1802385
1802386
GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAAC
ATCTCAACGAGGAACGTATTGGGCTGTTCG
1802451
1802452
GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAAC
ATTCCGATTGAAATTGTTGACGGAATTACA
1802517
1802518
GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAAC
CAGAAGGTGAGCGTGTTCTTTTCATCACTG
1802583
1802584
GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAAC
CAATACCTTTTATTCCGCTTGTAAATCCAT
1802649
1802650
GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAAC
TAAAATTTTTTCTTTGATTAAGACTTTTTC
1802715
1802716
GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAAC
TTGGTTTTTTTGACAAACGTCACATCGTCT
1802781
1802782
GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAAC
TTCTACACTTTTAAAAAAAGAGCAAACATG
1802847
1802848
GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAAC
TTTTCTTTTGGCTCTGGAATAAGGAGTTTG
1802913
1802914
GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAAC
TTCTACACTTTTAAAAAAAGAGCAAACATG
1802979
1802980
GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAAC
TATGCCTCCTGTTTTTTAGAAATTCGGTAA
1803045
1803046
GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAAC
AAACGTCAAAGCGCGGGTAATAAATTAGGTACAG
1803115
1803116
GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAAC
TAAAAGTATTGAAACCATTTATTGATAAAG
1803181
1803182
GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAAC
TGATTAATTTTTCTCAAAATGACAATAGCA
1803247
1803248
GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAAC
CAACTCATTTACTGCCCAGCCACGTCCACG
1803313
1803314
GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAAC
1803349
Left flanking sequence : Till position 1801260 (length
bp)
ACATAATAGTTAAGAGCCCAAAAAAAGTATTGACTAAACTAGAAGAAGCGTATTTAATGTAGGTAGGTAT
AAAAATTTTATTTGGAGACGTTCATTTGAG
Right flanking sequence : From position 1803349 (length
bp)
ATTAAAGAATTGTTAGTTGTGCAACTTAACATTAACGCATTTTTGCATTGAAATCACACTTAAAAAGCTC
TAGTCACTACCAAATACAACATAAGGTAGT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp