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CRISPRs details
NZ_LT799839_2
Flanking alignement tool
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NZ_LT799839_2                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium chauvoei JF4335 GCF_900168365
RefSeq :
NZ_LT799839 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_LT799839_2
DR consensus (30 bp) :
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
Number of repetitions :
34
Begin Position :
1113676
End Position :
1115873
1113676
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
AGATAACAACTGGAGAATAAAACCTATAGAAGAAG
1113740
1113741
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
AAATTGTGTTCCGCCGGGTGCAAAATTCCCTTATATA
1113807
1113808
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
CAGGAGTCGTTGTATTTGATGAAATACATGAATATGA
1113874
1113875
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
AAAGGAGAAATATATAGAGTTGATAAAAAAATATTT
1113940
1113941
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
ATTCTCCTAAAGATGATAAGAATGAATCTTTTAATG
1114006
1114007
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
AGATAAGCTAGGTAGTGACCCTGCTGGAAAATTACA
1114072
1114073
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
GCTGAATCTGGTGAGGACAATGTTGATATAACAATT
1114138
1114139
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
TTTGTGCAATACTATAGATATAGCAAGTGCAAGTTC
1114204
1114205
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
CATCTGACACTAATAAAATAGAACTAGAGATTTACA
1114270
1114271
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
CCTTCTGATGATATAACATTTGCTATAAGTTGTG
1114334
1114335
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
GTTAAAAATTTTCACCCACAAGGAACTTTTATACAA
1114400
1114401
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
AGTGAAAAAGAAAAGGAAATTAGAAAGAAAATAAG
1114465
1114466
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
AAGTCAGTTTATGTGTGGATTAATCCAAAAGCATT
1114530
1114531
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
TGGACTTTCCTCCCAAGCTTATTATTTTTTAAAACA
1114596
1114597
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
TTGTTAGCTTTCTGTATTTGCAAATCGCATATAATT
1114662
1114663
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
AAATTTGGAGGGATAATTTAAATGGGTATATTAAA
1114727
1114728
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
CTTTTAACATATCCCAATCCTTGATAACGAGAATAC
1114793
1114794
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
GATGCTTTGAAGAAGTTAAATGATGAAGAGAAGTT
1114858
1114859
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
TAGATTGAATGAGCATAAAAGCTTTTACTGTTTAAC
1114924
1114925
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
GTACAAGTGCAAGAATAAAGAATAGTGGAAAGGAA
1114989
1114990
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
TATATTATTTCAGCTAAATCTAACATTCCCGTATCA
1115055
1115056
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
GTAAGTAGGAGGATAAAGAGAGCTATAAAACATTTAA
1115122
1115123
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
ACAACTTACGAACTAGCTAACAAAATAAGCGGGGT
1115187
1115188
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
TTAAAGTTTCGGTTAGCTACGTCCATATTTTCCCTG
1115253
1115254
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
TTTGAAAGAGGTGTATTAATATGCCTATTTTTTTAT
1115319
1115320
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
GAGCAAGAAGAATATAGTACATCAAAAAATAATGA
1115384
1115385
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
TACTTAGGGTTTTCCTCATAACACCCGATATGGTAT
1115450
1115451
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
ATTCTTTGCTTTTATCTCTATATTTAACTATCTCT
1115515
1115516
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
CAGAAAGGCTAGGAATTCTAATAAAGAGTACGATGA
1115581
1115582
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
ATTGTAAATCAAGTGAGACCTTTCCCAACACCGGCT
1115647
1115648
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
AAAAGGAGCTGATGGGAATCAAGGACCAATTGGA
1115711
1115712
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
TAAGGAAATGTACAACAGTATAATTGGTAAAATGAA
1115777
1115778
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
GGTAGAAAATAATGATGAAATAAAATATTGTTTTTA
1115843
1115844
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
1115873
Left flanking sequence : Till position 1113676 (length
bp)
CTTTTATTTATAATAAAAAGCTGGTAATATATTTATATAAACATTATAAAATGGGCGTTGCATAGATATA
TAGTTATAAAAGAACTCTCATTTTTCTAAG
Right flanking sequence : From position 1115873 (length
bp)
ATCCGAGACAGTAGATAGTTTTGTGTAAAAACAAAACTATCTACTGTTTTTTGTATTAACAGTTGGAAGT
TTTGGAATAATATACTATATAAATTAGGAG
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp