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CRISPRs details
NZ_LT799839_3
Flanking alignement tool
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NZ_LT799839_3                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium chauvoei JF4335 GCF_900168365
RefSeq :
NZ_LT799839 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_LT799839_3
DR consensus (30 bp) :
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
Number of repetitions :
11
Begin Position :
1117437
End Position :
1118127
1117437
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
TAATTGAAACTAGTATCACTGATTCTTTTTTTTCTT
1117502
1117503
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
AAAGGATTTCTTGTTCCGTATTTTTTAGATAAATTA
1117568
1117569
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
GGCACTTGGTAAAATATACCTTTTGCTTAAACTCTGC
1117635
1117636
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
TAAAATACCACTCTTCTATTAATCTTTGGCTTGTA
1117700
1117701
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
ATCTGCTTAGGATAGTCTTGTGTTTCTTCAAAGCTAG
1117767
1117768
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
ATTGATGGAATGGTTAATTGATTATAAGAGATTGAA
1117833
1117834
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
CTTATCCATCTGCCCATACCAGTTATACCATTCCA
1117898
1117899
GATTAACATTAACATGAGATGTAGTTAAAT
ACATATTTAACTTTCAAAAGCAACTGATTGCAATTC
1117964
1117965
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
ATGGTAGGCAATATATTTGTTGGAACTTATACTAAAG
1118031
1118032
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
GATTTATAGTTTTGACTATGATGATGAGTATATATA
1118097
1118098
GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
1118127
Left flanking sequence : Till position 1117437 (length
bp)
AAAATTTCCAGTAATATTAAAATAATAAAAATGATAATTACACAGAATTATCTATTCTCTCAAATATCCT
AACAATTAAGTATTATCTCTTATTCCCCTT
Right flanking sequence : From position 1118127 (length
bp)
ACAAGGCAATTTGAGTACTTGAGTATACCCAATTTGATAGACACATAGAAAGTACGTATAATAATAATTA
AGAAGGATGTGTTTATTAAATGGGAAACCA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp