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CRISPRs details
NC_000909_8
Flanking alignement tool
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NC_000909_8                                                                                                                 
top
Strain :
Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661
RefSeq :
NC_000909 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_000909_8
DR consensus (30 bp) :
GTTAAAATCAGACCGATTCGGAATGGAAAC
Number of repetitions :
15
Begin Position :
428572
End Position :
429572
428572
GTTAAAATCAGACCGATTCGGAATGGAAAC
TAACATAACAAAAATTCATCAAGTGTTTTACATTTTATGTG
428642
428643
GTTAAAATCAGACCGATTCGGAATGGAAAC
TTAATTCTATTTTTTATTTCAGTTTTGTCAATTTCTGAT
428711
428712
GTTAAAATCAGACCGATTCGGAATGGAAAC
AATAATATAAGTTGGCCAATCATTTCTCGGATGGTCAACA
428781
428782
GTTAAAATCAGACCGATTCGGAATGGAAAC
CGAAACAGATATATTAGGAAATTATATTGATGATAT
428847
428848
GTTAAAATCAGACCGATTCGGAATGGAAAC
TTTGGCAATTTATATAGCTCAATTGCGTATTCTTTCTT
428915
428916
GTTAAAATCAGACCGATTCGGAATGGAAAC
ATGAACTCTTTTAAATTATCTCTTTTACTACCCCTACAAATTCCC
428990
428991
GTTAAAATCAGACCGATTCGGAATGGAAAC
TATTTACCTAATATTTTGATTAAATACTAAAAATTCT
429057
429058
GTTAAAATCAGACCGATTCGGAATGGAAAC
TTTTTAGGTAGGATACTGAGGGCTGTAAGTTTTTTT
429123
429124
GTTAAAATCAGACCGATTCGGAATGGAAAC
TCAGAATTCTCATCTGCATATTGCTTCATTATTCTCTTTAACGTTA
429199
429200
GTTAAAATCAGACCGATTCGGAATGGAAAC
GAGTGTGGATATGTTGAAGATTTTGGAGTTGATTATTGTGGTG
429272
429273
GTTAAAATCAGACCGATTCGGAATGGAAAC
TTATAACATAAGATTTTTATGTGTTCTTTTTGTTTTCT
429340
429341
GTTAAAATCAGACCGATTCGGAATGGAAAC
ATACTCAGATTTTGTTGTATGATTTGCATCTTTATTTT
429408
429409
GTTAAAATCAGACCGATTCGGAATGGAAAC
TTCGGTTATCAAAAAGTTTAAATTTATGATAGGAAT
429474
429475
GTTAAAATCAGACCGATTCGGAATGGAAAC
TTTTTAACGAGAGTTTTCAGAGCATTTAGCTTTTTTGA
429542
429543
GTTAAAATCAGACCGATTCGGAATGGAAAC
429572
Left flanking sequence : Till position 428572 (length
bp)
ATTTATATTATGAGATAGTTATTTATCCTTAGAAAAATGTGGTGTAGAAAAGCTTAAATATTAGGAGAGT
AGTATAAATTATATTGTGGATAAGCCTCCT
Right flanking sequence : From position 429572 (length
bp)
TAAGCTTCACCTTTTAACAAATAATAAGCACTTGATTAAAATCATATCTCTTAGAGAATAAATTATGCTC
TTTTTAGTACAAAATAGTTATTAATAAAAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp