CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_007644_3
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_007644_3                                                                                                                 
top
Strain :
Moorella thermoacetica ATCC 39073
RefSeq :
NC_007644 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_007644_3
DR consensus (29 bp) :
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
Number of repetitions :
47
Begin Position :
1772658
End Position :
1775677
1772658
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGATCAC
TCTGCCAGGTGGCCGTGGATAGTTTTGATCAACTGCC
1772723
1772724
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
CGTAGTTGGACTTTTATGCGCAGCAAGGCCCCCGGTA
1772789
1772790
GTTCAAATTCCTCTATGGTCAATGGTCAC
CCAGTTTTTGCCGATGAGGACCTGGGATTGCTTCAG
1772854
1772855
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
AAATGGCCGTAAAACTGAAAGAGGCGGGATTAAAA
1772918
1772919
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
CTAATATTCCAGTGCTTTTTAACCTATTATATCTAA
1772983
1772984
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
GTGCAGTTACCCAAATACCGCATTACGGTGAGCCAG
1773048
1773049
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
AGTTTAATTCCTCTACAGGGAAGGTTACTGTTATGA
1773113
1773114
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
TCACCCAGGGAACGTGATGCCTGGGTGGCTCAATGTA
1773179
1773180
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
GGGTACCCCGGTGGCGTATGGAGCGGCTTGGGACG
1773243
1773244
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
ACTCAACGGGTTTGAAAAGTACCTCTACATGAGCG
1773307
1773308
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
GAGATTTGCCGGCAGAAATATTTTATTCCCTGCCCGAA
1773374
1773375
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
CGAAGACGCCTGCCGCCTGGACCACCTGGACGAAAAG
1773440
1773441
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
AGTTTAATTCCTCTACAGGGAAGGTTACTGTTATGA
1773505
1773506
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
TCACCCAGGGAACGTGATGCCTGGGTGGCTCAATGTA
1773571
1773572
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
GGGTACCCCGGTGGCGTATGGAGCGGCTTGGGACG
1773635
1773636
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
ACTCAACGGGTTTGAAAAGTACCTCTACATGAGCG
1773699
1773700
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
GAGATTTGCCGGCAGAAATATTTTATTCCCTGCCCGAA
1773766
1773767
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
CGAAGACGCCTGCCGCCTGGACCACCTGGACGAAAAG
1773832
1773833
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
AATAAAGACCTTCTCCGAATTCAAGCGATCTGGTAG
1773897
1773898
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
GGGTGGGAATGTTGAGAGAAGAGCTCCGAGAGCTTG
1773962
1773963
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
CTTTATGAATTTCGGCTCTCCGCCTACGCCCCGTAA
1774027
1774028
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
CGGTTGTCGCCCCGACTGGAAACCTCGGTGAGTAA
1774091
1774092
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
TCTTCATATTGCCTTCAGGGTCATCAGTAAAAGGA
1774155
1774156
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
CCCTGTCACGGAAGAAACCACCTGGCTCCGAGCCGGA
1774221
1774222
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
TAAAATGCTTGATGCGGATTTAATTGATGTTTATA
1774285
1774286
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
GCAAAAAGAAAACCGGCTTATTTGTCGCCGGTTTCTT
1774351
1774352
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
TCTTCGTAAATCGACTTCTTTTGCTTGATATGCCGCA
1774417
1774418
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
TGCCGTACTCTTCTTCACCATGCCAGACGATCCATT
1774482
1774483
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
CTTCGGCCCACGGCACGGAAACTTATGCTTATAAACC
1774548
1774549
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
CCGGAAGGGGACAAACACTTTGTGCCCCTTAACA
1774611
1774612
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
TGGCACACTCGCGGCACTCATTCCGCGTTATCGGG
1774675
1774676
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
GCTTCGACGGTTTACGGGGCTATTCCGTCATCGCTA
1774740
1774741
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
TGCTACGTCCAGCTTCAATATCCGCTATAAAAGAA
1774804
1774805
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
TTGAACACGGTCGATGCAATCCATCCATTGAAAAGCT
1774870
1774871
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
AAACAGGATCGGCCAGCAGCCGTTCTTCCTGGGGAT
1774935
1774936
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
CCGGAGCAGGCTAACGGACCGGTAAAGACGACCC
1774998
1774999
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
CTCTTTTGCCCCATTTACAAATACAGCAATCTCCGA
1775063
1775064
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
CTGCCGTGGGGATGGTCAGGGTTTCGGGAGAGCGGG
1775128
1775129
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
CGCTACTGGCGTAGAGAATTGACTTCAGGCGGTCGA
1775193
1775194
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
CCTGATACCACCGCGGCCAATGACCTTCGGGTAAGTA
1775259
1775260
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
GGTCGCCATTGCCTGCGGGGCTGTTGATAAGCTTAAA
1775325
1775326
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
TTCGACGGGCAGAAAACTCAAGGGCGCAAGGGCAAA
1775390
1775391
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
GGGTGCTAGACCCGCAGGAGGGGACGGTGGAGTTT
1775454
1775455
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
ACGTAGAGCATAACGTCGAGACTTTGAAAATCTCCC
1775519
1775520
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
GGCTGGCCGAAAAGGAAGGAATAATTGTAGATTAT
1775583
1775584
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
AATCTGCTGTTGATTATAGTACTACTTTTACCGCAG
1775648
1775649
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
1775677
Left flanking sequence : Till position 1772658 (length
bp)
TATACGTCGCACCATTTCTTGCTGAAAAACTTGCAACCGGGTACCCAGCCCGATTACTACTCCACCTTTG
ACGTTATCACCAGATTTTTATCTCCACCCT
Right flanking sequence : From position 1775677 (length
bp)
CGCAGATGAAAGGCTTGTCCCGACAGGGATTTTAGCAATTTTTTAAAAGCCCCTGCGTCAAACCGCCAGT
TTGCACTTACACTACAGGAAATTATCTGTA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp