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CRISPRs details
NC_007681_1
Flanking alignement tool
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NC_007681_1                                                                                                                 
top
Strain :
Methanosphaera stadtmanae DSM 3091
RefSeq :
NC_007681 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_007681_1
DR consensus (29 bp) :
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
Number of repetitions :
62
Begin Position :
490169
End Position :
494226
490169
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
CGGATTTGATTAAAACGTATTACCCAATCATATATTTC
490235
490236
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
TAGATATTTCAAATTTACAATTACCATTTAAAAAAAC
490301
490302
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
AAGAACGTTTTGCTTCTAATTCAGAGTATAATACTTTT
490368
490369
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
CCAATGAGGAAGAATATCTCGGTCTAGAAAAAGGAG
490433
490434
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
AAGGAAATTATAATTATACTCACCAGTATGATATTAA
490499
490500
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
CAATAGAGGAATAAAAACAATGTCAAGTATAATAAAA
490565
490566
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
TTGAGGTAGAAATTGATAATGAGTTCATTAATGAAC
490630
490631
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
TATATATGGAATAATATTGAAACAGTGTTTAAAATAA
490696
490697
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
AACAAATAATATGTGTCATTATACTTATAGATTTTAC
490762
490763
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
CTGGATAATCAATCCCTTTAAAACTAGCCGGACTAA
490827
490828
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
TTCGTAGAGGTGGTGAGTCCAACAATTTTATTTTTTC
490893
490894
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
CATCTTCCCATTCATAGTCTTGTTTAAATTCTCCATT
490959
490960
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
TGATAACATTCAAAAAGATATGTGGAAAACAATCAAT
491025
491026
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
CACTTGAAATAAAACACATAGTACAATTTCAACTGT
491090
491091
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
AGGTCATCAATATCATATTCTTTTACAAGTGTATTTC
491156
491157
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
TTATGAAAACAAGTGATGGAACAAATAAAACAATAAT
491222
491223
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
GATGCTTTTAAATTAATATATTTTAATATTAATTCA
491287
491288
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
ATAGTGAATATACAGACCCCCTTAAAAAGCCAACAATA
491354
491355
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
TGAAAATTGATTATAAAAAAGTAGGAGATGTATTTGAA
491421
491422
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
TATGGAATCACGTAAAAGAGCAACGTTGGGTTATCA
491486
491487
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
TAACAAAACTACTCAAAACAAAAATAACAGAAACAGA
491552
491553
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
AAAATGGAGATAAAACAGATTATAAAATGGAACTTATA
491619
491620
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
CTTAGATGCAGTAGAAATGAAAATCTGTTATACTAA
491684
491685
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
CATCTTCTGTATTTGGTGGAGTAATATATTTTTCAC
491749
491750
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
AACTCTTTTTCACTATTTATTCCTATTTTCAAATAA
491814
491815
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
GGTTTATTAATTCATCTTCAATATGTTTCATGTAATC
491880
491881
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
TACCAATAAAATAGTCTTGATTTGTACTTTTAAGCTGGA
491948
491949
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
AAATTATTGCTACAACAAAAGATACAATTACAATTACA
492015
492016
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
TTTCATTATTTTGTTGTTCTTTGTTGTTGTAGTGTA
492080
492081
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
AATGGATTTTGAGCATCATTATCAGGAGTAATACTTGG
492147
492148
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
CAAATACTATAGATTACATAATACTTTTAACAGAAAAT
492214
492215
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
TTTGTTTGAGGTGGAATTACTTGTGTATACATTGTATT
492281
492282
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
TTATTTAAATGAAAGTGATATACCTAATACAACTCC
492346
492347
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
GTAATGATTTCTACAGTGAAATTGAAGAATTTATAG
492411
492412
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
TAATAGTGGACGTTTATATGTAAAGAATATTAAATTA
492477
492478
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
CTAGACGAGGATAAAACAATTCCAAGTGATACATGG
492542
492543
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
TAATGTTGCAAGACAAATAAAAGAAGTAATTAAGAAC
492608
492609
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
TGATTATATTACTGAATCAGAAGCTTTTGACTACATA
492674
492675
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
TACTTCCTCTACTGCAACAATTCTATAAAAAAAATC
492739
492740
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
TTTAATCTTCTAAAACATAAATAATCATACAAAAAG
492804
492805
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
GCAAATGGTGTTGATACAAATAATATTCGGGAAATGT
492870
492871
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
CACCTATATGTACTAGAATTTACGCCCATTTCATAGG
492936
492937
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
GCAAATGGTGTTGATACAAATAATATTCGGGAAATGT
493002
493003
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
CACCTATATGTACTAGAATTTACGCCCATTTCATAGG
493068
493069
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
CCAAACTGGGTAGAAGCAAATACTACTGCAAACAAT
493133
493134
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
CATGAAAAATACATCACAAAAAATAAAACAAGTTACC
493199
493200
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
TCTATTCTGTATATATTCAATTTAGGATAGAATTTC
493264
493265
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
TAGTTTAGTGCCCTTAGTATTTAAAGGTTTGTTCATA
493330
493331
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
GAATACAACACTTTAAATACTAGAAATGACAAATAA
493395
493396
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
ATCTATATTGGGAAAAAAGAAGGCACTTCTTTTAGA
493460
493461
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
TTTTTATTACTTGCTGCTAAATCCCATACACGACAATA
493527
493528
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
TGGATATAATATGACTGAAATAGGTCGTAATAGTAAAGCTG
493597
493598
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
CGGAGATATGTGCCAATTAATTCATCACCTACCTCTTCAT
493666
493667
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
CAAAATTGGATGTGGACTATAAACAGCTACTTTTTTAAAC
493735
493736
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
ACAAATAAAACACTAACAGAGTATAGTATTGATAAT
493800
493801
GTTTAAAATAGACTTAATAATATGAAAAC
TTGAACACCATGAAAAGAAATGCCCGTGTTTTTATTTTT
493868
493869
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
CACTCTCACAATCCTTATGATGAATGTATCTACTTC
493933
493934
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
GTCTTATCATCAGAATTTTCATCAACAACATCTATTT
493999
494000
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
CTTATGAAGGAGAAAAAGAAGTCGAATATAAAAGACAC
494066
494067
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
CACTTGTAACTGTACCACCACCAGTATAACATAATAC
494132
494133
GTTTAAAATAGACTTAATAGTATGAAAAC
CTTGAGTCAGGAAACTTTGAAATACATCATTATAGA
494197
494198
GTTTAAAATAGACTTAATTGTAAAACCAA
494226
Left flanking sequence : Till position 490169 (length
bp)
CTCCCCTATAATTTTTACAACATTAGGGGTGGACTATAAACAACTACTTTTTTAAACAATCACAACAGTT
TAAAGAGTAAAATACGAAAAATTTTTTGGC
Right flanking sequence : From position 494226 (length
bp)
AAAAAGATGTACTAACAAAAGAAAATAAAGAGAGTTAATTGTCAGAAACTTAGTTGATTTTTGAATTTTT
AAAATTTTCAATAAAAAAATAGAAATACAC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp