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CRISPRs details
NC_011296_3
Flanking alignement tool
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NC_011296_3                                                                                                                 
top
Strain :
Thermodesulfovibrio yellowstonii DSM 11347
RefSeq :
NC_011296 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_011296_3
DR consensus (30 bp) :
GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
Number of repetitions :
32
Begin Position :
1074817
End Position :
1076909
1074817
GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
TTGTTTTGCCAAATTGATATTTCCAACCAGTTCCTCC
1074883
1074884
GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
TTGTATTCAGACAATAATTCTGTTCCTTCAAGCTTT
1074949
1074950
GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
AATAATCAAAATTATCAAGATTATCAGAGTTGTTATT
1075016
1075017
GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
GTTTTTTGGTGCATTTTCAAGACTTTTTATTGTTA
1075081
1075082
GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
GGTAAGTTATGTTCAGCCTTATGACCTTGTTAGAAC
1075147
1075148
GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
TTGTATTCTTCTTTAAAAATCACATAGCCATTTAT
1075212
1075213
GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
GTATCAGCTGTTGCATCTGCTGTTACAACAAACTGC
1075278
1075279
GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
GTTTGATACAGCTGCAGGATAGCCATTGACCTCTC
1075343
1075344
GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
TTAAAACTTCTCCATCTCTGGCTACGGTTCTAAGAA
1075409
1075410
GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
AACTATTTGTGGAGCAAGATATGCAGACAGCACTGCTAC
1075478
1075479
GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
TTCAACTTCAACCCCGTATCTTGGAGTTGTTTCAG
1075543
1075544
GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
CGCATTTACTTATAACAATTATCATTTCATTTCCTT
1075609
1075610
GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
CATTTAAGCCCCACCAATAAGCATAGAATAAATAAA
1075675
1075676
GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
AAGCTCTCAGAGATAACATATGATGCAGTCGTCGG
1075740
1075741
GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
CGAGGCTCAAACAGGTGGAATACTTCAAACACAAGGG
1075807
1075808
GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
ACTGTATTCTGTTTTTGTATCATTGAAGTGTGAAA
1075872
1075873
GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
ATTTCTCTCTTAAAATACCTTTTAAAAATTTTTTTTG
1075939
1075940
GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
CTTTACACTCCATTGCAACTTCATAAACCATATTATT
1076006
1076007
GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
ACATTTTGCCTGAACAGATATGTTTGCTCTAAGATGA
1076073
1076074
GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
TATCTATACCTTAACTCTCTCATACCTACCCTCTTT
1076139
1076140
GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
CCATGACGGCTTCAACACATCTTCAATTCTCGTTAAACC
1076208
1076209
GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
TTCAATTTCTAATTTTTTATTGTGTTCCATTTTTCTCC
1076276
1076277
GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
CTTGAAAAAACTTTTTTAAATCAATAACTTCATTATCCCGC
1076347
1076348
GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
TATTCTATAACTTTACCACCCTCATCCACACACAC
1076412
1076413
GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
ACTTTAATACTTCAAATTTCCTTTTACCTTTAGACA
1076478
1076479
GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
GTATTATTTGACATACCGCAAGCAAGCAAGAGATAGA
1076545
1076546
GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
TTTTATAACGCTCCCACACCATCTCCGCACTCGTC
1076610
1076611
GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
AACAAAATCGAACGAGGTTTAACGCTTTCATCAAACTC
1076678
1076679
GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
CCATACAAACCACCTTGCCCCAAAACATCGCATGG
1076743
1076744
GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
CTTTGTCAAGAACAAGCTCTTTCCATACTTTTGCACATT
1076812
1076813
GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
ACAACAAACTCATACATTTGAAGTGCTCCCTGAGCCC
1076879
1076880
GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
1076909
Left flanking sequence : Till position 1074817 (length
bp)
GAAATTATATTGAAAAATTAAAGATTTTTTGTTAAAATTCAAAAAATAACCAATGATCTTTGACAAGCGG
ATCAGATTGATTTTTTCACATTTTAAACGG
Right flanking sequence : From position 1076909 (length
bp)
AGAGAAGTTCATGCCTGAAAATTTTTCACTCCACACCCCATACAAAAAATGTATGATAAAATAATTAATG
AACTTCCTTTCAAATCAGCCGTCTAATATT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp