Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_011297_3                                                                                                                 top


Strain : Dictyoglomus thermophilum H-6-12 RefSeq :NC_011297 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_011297_3
DR consensus (30 bp) : GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACNumber of repetitions :68
Begin Position : 178426 End Position : 182925

178426AATTGTAGCTTTCCTATGAGGGTATTAAAACAAATTTTGTAGCGTTTATGTAGTGTTAACGG 178487
178488GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACCTGTGAGGTGAAAAGATGATAAATACAAAGCTTTTTAA 178555
178556GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACTTTGTCATTGCTATCCCTCCTTTCGATGAAATAATC 178621
178622GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACTATAAAATGAAATAATCAAGAATAGTTTCTGTTTCTT 178688
178689GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACATGTTGTCTATTTTTTGCTCTAGCTCGTCCAGCTTCCC 178756
178757GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACCAAAGTGAAACAGAGAAATATAAAGCTGAAAAAGAAGC 178824
178825GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACTCCTCTACACCTCTCTCCCCTACAAGAATGTCTGGAA 178891
178892GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACTTGTATCGCCTCCCATCCTTAGTTTTGCTCAGTTTTA 178958
178959GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACCCCCATCCTCTTCTACATCCACAACAAGTTTGCCAA 179024
179025GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACAACATTAGCATTAATAAAATCTTAGCCACTTGGCCCC 179091
179092GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACCTTCGAAGGTTTGTTGCAAAAAACTGAAGGAAGCTG 179157
179158GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACAGCTAAAATTTGAAGAAATAGTTGGAGAATTAATTA 179223
179224GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACGAATTCACCATTCTATTCACTGTTTTTCTCTACCTCC 179290
179291GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACATTGGAGGTAGAGTTTGAAGTAAGTAGAGACAAGGTGA 179358
179359GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACACTGATCCAATTCTCTCTCTCTTCTTACTATCATC 179423
179424GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACTTGCGTCTGAGACAATTGGTAAAACATTCTGAGCAA 179489
179490GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACGGTACAGTTAGGAATGAATATGCAAGGCACTTTTAAC 179556
179557GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACATTCTTCTTCCGTTATCTGCTCGAATATTTTTTGTA 179622
179623GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACGGATGGATGCAGGTAAATTTCTAATTGTAGGCTTTAAA 179690
179691GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACTCCGTGTGTACAAAAGATTGTGTAGCCTATTCTTTT 179756
179757GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACTTTTGGAGAACCAAAAAGAGCTAAAACATATGATTG 179822
179823GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACCTTCTATAAGTTCTTTAATTGCTTCCTTAATCTCTT 179888
179889GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACTTGCGTCTGAGACAATTGGTAAAACATTCTGAGCAA 179954
179955GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACACCAAAAAGATGCAAAAAGCAAAAAAATGGCATGGAGC 180022
180023GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACAGTTTTTCGATACGATGTCTATGCCTTCAATATCAAGCTTAAACA 180097
180098GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACTTTTCCACTGACCAAACATTATATGTTAGTGGCATA 180163
180164GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACCTGGTAGGACGTTAAGACTATATGAAAATCTCTTAAG 180230
180231GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACGTTTGTGGCGGATAATGACCAAATTTCCATATAATTT 180297
180298GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACTGCAATACAGCTTGCGAAATTAGAAGCAATTGCAAAG 180364
180365GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACAGCCCTCTCCATTCTCTATCCCATTCTCCAAAATCCAA 180432
180433GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACTCTCTCAGGCTGGTGGAAAAATCACAAGGAATTATC 180498
180499GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACACCTAATAGCAAACGAATATTTTGACACGCCAAGCGCT 180566
180567GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACGACACTCCCAACTTTTTCCGAGTCTCAGACCTAAGAG 180633
180634GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACGAGCGTGCGGTCTTAAAGTCGTCGTATATTCTCTGCA 180700
180701GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACCAATACAGAAAAAGATAAACTTCAGGAGGGTAGTAA 180766
180767GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACCGTCTTGCCTGTTGCTGCGCAATTAGGAGTATCTTT 180832
180833GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACTTTCACACTTGGTTCTGGTGCAAGAGCGCTTTACCCA 180899
180900GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACGCAGCAGAGGCAACCGCAATAATGATAGACATCGTGA 180966
180967GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACGAATCTTTCTTAAGCATCTCCTCAAGGCAAATAGAGT 181033
181034GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACAGTTTGAAGGAAGCTTCATCTTGTAGCCTTTTTATCT 181100
181101GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACGTTTTTTAATCGCTTTTTAGCTTTCAGGTTTTTGCTT 181167
181168GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACATATTTCTATAGAAGCCCATGGATATCGCACCTCC 181232
181233GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACGTTTTTCTAGGAGTTCTACAACATCGTTTGCAAACT 181298
181299GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACCAGGCTCGATACTTACCCATGTTTTTATGCCTCTCTT 181365
181366GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACTTTAGCTGGCAATAATCTAAACAATTTTTAAAATCT 181431
181432GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACTTATCTCCCTCGCCACTGAGAATGATATCTTCCCCTC 181498
181499GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACCTGGTAGGACGTTAAGACTATATGAAAATCTCTTAAG 181565
181566GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACGTTTGTGGCGGATAATGACCAAATTTCCATATAATTT 181632
181633GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACTGCAATACAGCTTGCGAAATTAGAAGCAATTGCAAAG 181699
181700GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACATTTTCTCTTTTCCAAAGCACGCTTTTCCAATTCACGC 181767
181768GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACATGGAAAAAAATGCAGAAGCCTCTCAAACATCTCAA 181833
181834GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACGAGGTAAATATGTATACATTCCATATTTTGCTCAAG 181899
181900GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACTCCTACAACGCTGTCTGCGTCCCATTCCAAAATCTC 181965
181966GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACCACCACTCTATCAGTAGCTCCTTCTTGTTCTGTGGA 182031
182032GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACTCCTTATTTATTATTGTATTCTTTCTTTTTATAACT 182097
182098GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACATAACATAAAGTGAAACTGAGCGAGACATCCCTGAAC 182164
182165GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACAGGAGTGGGAAGAGATAGAAGATGAGTACAATATA 182229
182230GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACTAGTAGAAAAGAAAGAATAAAAAGAAAGAATAAATAA 182296
182297GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACCTTGCTGGAAGTGTAATGAGTTTCCCCTTAAAAACT 182362
182363GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACAGGTTCCCATTCCTTTGTCTTAGTTTCGTCTACAAAG 182429
182430GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACAAGGAAACGACGTAATAGAGCTAAGAAAATTTGAGA 182495
182496GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACAAGAATGGATGTAAGAAATTTGTTTTGGAGTTGCTT 182561
182562GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACAACTTACAGGAGCAAAGGGTTATAGAGGAGATGAAG 182627
182628GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACAAGGAAACGACGTAATAGAGCTAAGAAAATTTGAGA 182693
182694GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACAAGAATGGATGTAAGAAATTTGTTTTGGAGTTGCTT 182759
182760GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACAACTTACAGGAGCAAAGGGTTATAGAGGAGATGAAG 182825
182826GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAACTCTCTTTCCAAGCTTCAAAAGTAATGAAATCTTTAAGATA 182895
182896GTTTGTAGCGTGCCTATAAGGGATTGAAAG182925
Left flanking sequence : Till position 178426 (length bp)
ACCTCCAATAACCCCAAAACCCCGGGGGATCGACAGAAAGGTAAATTTTTGCATGAAATCCTCTTTACTA
CTTAATTTTTTTGTGATATATTATCCTTAA
Right flanking sequence : From position 182925 (length bp)
AGATAAGATAAGCGTCTAGGCTTATTAAACCTGAAAAAGAGTCTATTTCATGCTTAGCTAAGTTCCTATA
GATTGGTTGATCGGCAAAACTTATGTAAAT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp