Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_013315_11                                                                                                                 top


Strain : Clostridium difficile CD196 RefSeq :NC_013315 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_013315_11
DR consensus (29 bp) : GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATNumber of repetitions :12
Begin Position : 1504069 End Position : 1504821

1504069GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGGAAAGAGGTTTTTCAGAAGTATATGTACGTCTATATTGTAAA 1504134
1504135GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAAGGAAGGTGGAAGTCAATATGCATGGGTCAAATGG 1504199
1504200GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATACGAAATTAGAGTTTGAAATATATGACTACATAATA 1504264
1504265GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTTGTGTCACATCATTGTCACTTCTTTAGAATATCAAAA 1504331
1504332GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTTTTAAGCAGGTGATTAAATGATTAAAAAAGTAGAAAA 1504398
1504399GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAATAACTTGTCAATGTAGTTATATGCAACAACTTCTAT 1504465
1504466GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATGAATTATATATTATGAAAAAATATGGAGTCACAGAGG 1504531
1504532GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTTGCAGGTTTTCCTTATAGTTTGCCATATGTTCCTG 1504596
1504597GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTACTTTAGCACTAGTAAAGGTAGAATTATTAAAGT 1504660
1504661GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTCGAATGTGAATGGCACTTCTATTTCTCCAACTTTTG 1504726
1504727GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAGTATAATGTTGAAAAGTTAGAGAGTACAATCAAGAA 1504792
1504793ATTTTACATTAACTAAAATGTATAGAATA1504821
Left flanking sequence : Till position 1504069 (length bp)
ATGATAAACTTTATCATTTGCACTACTCATGGTTCACTGCAAATTTAAGAGAGTTGCACATGTGTAAGTA
TTGAAAATGCCCAGTTTATTTTGGGGTAAA
Right flanking sequence : From position 1504821 (length bp)
AAACATGTATTTATACTTAAATTCTGTACCTATATAAAAAAGTGAACTCTGTCAACAAAGCACTTTTTTA
TATAGATAAATTATCATTTTATTTTAAGAT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp