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NC_013316_19                                                                                                                 top


Strain : Clostridium difficile R20291 RefSeq :NC_013316 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_013316_19
DR consensus (29 bp) : ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACNumber of repetitions :27
Begin Position : 3325026 End Position : 3326772

3325026ATTTAGATATGATTTAGTTAATATAAGGTGGATGTTTTAGTATATGCTATTGTTTATTCTACAA 3325089
3325090TTTTATATACTGCTTTATTAATATAAAATAAGTTTCTAAATACTCGTTGATATTGCTAATATTCT 3325154
3325155ACTTATCTACCACTTAGTTGATATAAAACCTGACACTGTGTCTTGTGTGAGTCTTTTCTTTATCCT 3325220
3325221ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGATTAAGCCCAGTAAAAAGACTCGAATCTCTTATCGC 3325286
3325287ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGCAAAAAATGTTGATATTCCCAAAATTAATATTGATGA 3325353
3325354ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACATTATAGAAGTACATATATTGCTGAAAAACCTCTTGT 3325419
3325420ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAGTTAGTGATATCAATATGCTAAGCAATATTTTTACA 3325485
3325486ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTTATATTTCGTCGCACGGATTCGTGCGAAGGGTTGG 3325551
3325552ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTAATTTAGTTATATCCATTTGTTTAACCCAATTAGT 3325616
3325617ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGTTTCATTTTGCACTATATCAAGCTTAGTATACAATG 3325682
3325683ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTTTATATTTAATTTTAAAGATTAAAGGTATAAACAA 3325748
3325749ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTACTAGAATTATTAAATGAAATGAACAATAATATTGT 3325814
3325815ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGATTTAAATGCAACACAAATTATAACATCTAAGAAT 3325879
3325880ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAAGATTGAAATTTCAACACTTTCACCTTGTATATCT 3325944
3325945ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAGGTTAAAAAGCAATATAAAAGATTGCATGGAATTACT 3326011
3326012ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAAGTCTCAATAACAACAGTCGAAGCAGAAAAATCCGG 3326077
3326078ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGTAAAATGAGAAATAAAAGTAAACAAAAAGGTTTAGT 3326143
3326144ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCTGAAACCCTCGGATTTAGTAACCGATTCTATGTCGAGTCT 3326213
3326214ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAATCTAAAATATGTTCGTTAAAAGGGAGTGTGTAATTA 3326280
3326281ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGTTTCTTATACAACTCTTAACTCCAAGCCCATTTTGGA 3326347
3326348ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGTATAAAAAAAGAGTTAGAAGCATTAGACAAATGGA 3326412
3326413ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTATAATTGGGATGGTCAGGTTTCTGATAAGGTTAATAA 3326479
3326480ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTGTTTTTTAGTTTTCGTGATTCAAATGGTTCTTTGTT 3326545
3326546ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAACTCATGTAACAAGTATTAAGACTTGCACCTTTAA 3326610
3326611ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTCATTAATTCCTTTCATAGCACTTAAGTTAACCAA 3326675
3326676ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCTTTAGTTGTTGTCGCTTTTGCTTCTACTATAGTTGCTT 3326743
3326744ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC3326772
Left flanking sequence : Till position 3325026 (length bp)
TGATTTTATTTATGTCTTTATTGTTTAATTTCTTTATCATAAATTTTGTTTCACCTCATTTTTGTATTGA
TTTTATAATGTTTATAGGTAAGTGCATTTT
Right flanking sequence : From position 3326772 (length bp)
CCCAAAATAGGTATAATTGAATACATTGAAAATACTTCAATCAAGCAATTATAATTCAATAAAAACATCA
AAATTTGCAGTGAGCGAGCAGTAGTGCAAT
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp