Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_014960_8                                                                                                                 top


Strain : Anaerolinea thermophila UNI-1 RefSeq :NC_014960 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_014960_8
DR consensus (37 bp) : GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACNumber of repetitions :121
Begin Position : 3137389 End Position : 3146252

3137389ACGGGGGTATCCACGAACGGATCGAGGGGGGTGCTGGCTCGGCAGGCTCGCCAACCGCCTTTTGCCAGAGTTTCAGCCGCGCCCCCCGAA 3137478
3137479CGGGGGGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACGCGAAGCAATTTGTTTAAGAGTTGCATGAAATATTCA 3137552
3137553GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCTGGCTCGGCAAGCTCGCCAACCGCCTTTTGCCAGAGTTTCAGCCGCGCCCCCCGAA 3137642
3137643CGGGGGGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACCCCGGCGGGGGCGTGGATTGAAAGCGACAAAAAAAAC 3137716
3137717GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACCGACGGAACAAAGGAAATCCCTGCGGCGGAAATCAA 3137789
3137790GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACGACTGAACCGATTTGCCATCGGCTCAGTCAGAATGC 3137862
3137863GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACTCCCCCAGGCGTGCCACCTGGGGGGGGGCGTGACAAA 3137936
3137937GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACGTTTGGCGGGGATTTCCTTCGCGCCATCGAGGACGA 3138009
3138010GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACTATGTGTAAAAGAAAATCCACTGAGTAATCAACTCAG 3138083
3138084GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACGCCGTAGTGGCGTGGGTGACAGCCGCCATTGAATTCGTACTG 3138162
3138163GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACTGAGTGTGTGTTCCGTGTCTATCTCCCTTGAGCAT 3138234
3138235GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACAGCCTCCCGGCAATGGTAGCACAGCGCCTTTTCCT 3138306
3138307GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACGGTTTGTATCCGCGCCAATCACAACTTGGAGTTCAG 3138379
3138380GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACCCGTGACGACGATGCCGTCGTTTTCACTGAGCTGACC 3138453
3138454GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACTCAACTCCTGTTTCGCAGTACTCAGCCGTTTTTTTTTG 3138528
3138529GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACACAGGTAGGATTTCAAGCCCCTCACGCAGCAGAGG 3138600
3138601GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACACCATGCCCTGATTGCATCAAAAAATCATCTTTCC 3138672
3138673GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACGGAGACTAAGGCTGTCGACTGGGCATGGCATCTCAGC 3138746
3138747GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACAAAGAGCTGCTGACCTGTATCGCGTTGAACAAGCG 3138818
3138819GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACGCTTTGTGTTACCACTGCAGGGAGGCTCATTATGT 3138890
3138891GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACGGTCAGAACAAAAGATGACCTGAAGAAAGCCGCTGT 3138963
3138964GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACACATCACTGTTTCAATGCCCTCCCCCGCGTCGAGGGG 3139037
3139038GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACCCAGCAATAAGAGTGGCACTTGTCGCACCAGCCGTCAT 3139112
3139113GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACCTGCGAGCGCAGGAGGACCTGTTGTACGCCAAAAAA 3139185
3139186GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACGCAATTCCAATTGAGTTCAAATAGGAGGTGAATTA 3139257
3139258GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACAAGTCGAGGGATTCCTGAGTGAAATCCCGCCAGTTCTTG 3139333
3139334GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACTGATAAACAAGCAGAAGATTTACACTGTGACCGAGT 3139406
3139407GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACGGAACTGCTGGAGGATGACGATGTCATCCTCTTGGA 3139479
3139480GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACCTTGCCCTGGGCAAGCATGCCCTATTCGTGATTAGACC 3139554
3139555GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACATTACGGTCGCACGGATTTCAGCAATCCGCGATGATGA 3139629
3139630GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACCTGTGCTTTACCCTGACCGTTCATACACCTCGCCT 3139701
3139702GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACTCTACAGCATCTGCGTAACGCAGCGAGACCTCCGGT 3139774
3139775GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACTTTCCGTCATACTGGGGAAATCCTCCCCAGTATGA 3139846
3139847GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACACAACGCCAGTTGTCCCTTCACTGGGACAACTGCAGG 3139920
3139921GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACTGTGTTCCGTCAAATGGGGTAACTGCCTCCAGATAGA 3139994
3139995GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACTTTTGTATCGCGCGCGCTTCAAGCTGTTGACCAACC 3140067
3140068GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACAACGAAGAGAAGGAATATCACGATAAACATCATCA 3140139
3140140GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACAGAATGCGCAGTACGTAGAGCAGGCGAAAGCTGCAAT 3140213
3140214GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACCGATGCGATGGCAGCGGGAGAATCAATCAAGCTCAAG 3140287
3140288GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACCCAAGAGGTGGTCACTGTTTGCGGACGGGCCTAGGA 3140360
3140361GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACGACGTAAGAGCGAAACGGGCTGGTACGAAGTAGAAG 3140433
3140434GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACTGGAACGCTTCCAATCCTGGAGAGGGCTTGGCCCTC 3140506
3140507GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACCCTGCGAGCGCAGGAGGACCTGCTGTCCAAAAAAG 3140578
3140579GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACCAAGGTTACACAGTTGAAAAGAAAAAAGGAGGAAAAA 3140652
3140653GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACAGCGGATATATCGGGGAGGGCGCGGCCCTGTCATTTGT 3140727
3140728GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACATTCGCCGATGTTGATAAACCTGAAGGTACAAACTG 3140800
3140801GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACTGGTACGAGGTTGCGGAAGACCAGCAGGAAGACCAGC 3140874
3140875GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACATTGGGATCAGTGCAGATGTCTATAGACCTCTACGT 3140947
3140948GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACAGGTGGCTCATAAGACACGTATTATCAAATCTTTAGA 3141021
3141022GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACATGAAAGAGTTAAGTACTGAAGTTGTTCCTGAATT 3141093
3141094GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACCCCATGATCTACTGCTCGCCGCGAATCATCAAAGAG 3141166
3141167GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACTTGACGCGCGTTGACAACTCCGCAATCTGACGTTGC 3141239
3141240GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACACTGGTACATCTGGCAGAAGACCAACACAACGAAC 3141311
3141312GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACTCAGACATGAGAATTTAGGTGGTACTGTGGTCGCT 3141383
3141384GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACCATATAACCCAAAGCATGGTAACAAAGTCGAGGTGA 3141456
3141457GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACGTTTTTTCAGAAACATCCCCCTTACCGTGTCGAGG 3141528
3141529GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACTGTCGTTGCAGTGAGAGATTAGAGACGCGCTCTTCCGC 3141603
3141604GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACCACCGGGATTGATCATGAAAGACGATTACAACAATAT 3141677
3141678GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACAAGCTCCTCTCGCAGGAGAATTTCGGTAGCACTGA 3141749
3141750GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACCCGGTATTTGCGGTGCGAAAGCACGAGCACCAGTCT 3141822
3141823GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACGGAGCATTTCGGCGCTACAGAAGGCCGTGAGCTGAAAG 3141897
3141898GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACAGCCGATAGGCACTTTTTTGAATTTGATATCCTCA 3141969
3141970GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACAGCCAATCTGGTAAAGACGCTGTCTACCAGAGTGA 3142041
3142042GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACGCAAAGCGGCTTTGTGGAATTCTCTGCGCTCAGAGAG 3142115
3142116GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACAAGGAAATCAAAAAATTTGCCCGTGACTACAATGAGG 3142189
3142190GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACCTGCCCATGCCCGACGACGCAGTCGTCGTCCTTGAC 3142262
3142263GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACAGGTCTGGGGCGTTTATGACCGTCTTGACCCTGGAG 3142335
3142336GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACCTTACTGGTATGCGCAGTCGCCGCTGGTTACCTTCG 3142408
3142409GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACAAAAGGCGGGATGAAAACCCGCCTGGATAGTGGAA 3142480
3142481GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACTAATCCACATCCCCAGGTTCGAAGCAAACACCTTAT 3142553
3142554GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACAGCGCGCGTTTTTCCGCAGGTACTTTGCCTACACCC 3142626
3142627GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACTTTTAGGGTCGGCAGTGTCCGGCTCGTCGAGAAAGA 3142699
3142700GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACGCCCGGCAAAGCGAGTGACGCTAATTTCCGTAATG 3142771
3142772GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACGAAAGGGGCGCCCCGTGTTCATCGCTGGAACCCTCAA 3142845
3142846GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACAATGCCCATTCTTTTTCTTCCTCAACGTAAGCCAGCAA 3142920
3142921GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACCTTGTGTAATGGTAAGGGATGTAATCGGGGCAATCAAAA 3142996
3142997GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACTAAGCCGGTCAAGGCGAAAATCACTGAGGGTTTATGG 3143070
3143071GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACTGTCGAGGTCGGAACTCTGGACGATGTGCGACGAT 3143142
3143143GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACGGTTCGGGACCGGGTTCATGCTGATGCGTCCTCGAT 3143215
3143216GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACAGGTCCCGCCGAATCCGGCTTGACGTTTCTTGATGAT 3143289
3143290GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACCTGCAGCAGTTCCAAATCCAGAACTGCTGCTAGCAAGT 3143364
3143365GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACGCGGCAAGGAAGTTGCCGTCATACTTTGAGGAATA 3143436
3143437GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACGTCGTGATTTTGGACGGTATCGAGGTCGGCACGGT 3143508
3143509GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACCCATGTCAGGTACCGTAGTACACAAAACTGAAATT 3143580
3143581GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACAGTGTAGGGCGCCCTCACTCATTCTGACATGTCTTG 3143653
3143654GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACGGCTTACGCTTATGCGTCAACAGTGTCCGTTCCGTT 3143726
3143727GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACTGAAATCGTTAATTTGATGAGAATCAACAAAACAAT 3143799
3143800GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACTAGATAATTACGTAGGCTGGCAACTCTGGCGGAATA 3143872
3143873GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACCTTGAAAGGCTTCAGTCAGTACGGGATCGAACTGAC 3143945
3143946GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACGACGGCATAGAGGATGATTCTGCCGTAATTAGAAAAA 3144019
3144020GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGGTGCAACCCAGAGGGGTCGACAACGTTATTACAGACTCTTCAA 3144092
3144093GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGATGCAACACTGAGCTCGCTCTCCGGAACACCGAATTTAGCACT 3144165
3144166GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGATGCAACGGGTAATAGAGAGGATTGCCCTTAATCTCGAATATC 3144238
3144239GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGATGCAACCGTAGGGGGTATCGTGTATTACAAGTTGTTGAGGATG 3144312
3144313GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGATGCAACGTGAAACGTATCGGGTTTGATTTACCTGTTTTCGGT 3144385
3144386GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGATGCAACTGCCTCAGCAATGGTGCGACTACGATGCCGAGAAG 3144457
3144458GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGATGCAACTACAAATCCGTCAAGAATTTGACTTCATCGCACAGGT 3144531
3144532GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGATGCAACTCCTGGCGATTTTCAAAGACGAAGCCGAGTGCCGCG 3144604
3144605GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGATGCAACGGGAACAAGGAACGCGAAACTGCGTACAAATTTCTGA 3144678
3144679GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGATGCAACTCCAAAAAAACAGCAATTGCTACCGTGAAAGTTAAAG 3144752
3144753GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGATGCAACCTGATGGGACTTCCTGGCATCGGACTGGAGCGGGCG 3144825
3144826GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGATGCAACGTCGCAGCACTAGTAAAACTCGGCGAAGCGTTCGCCGCGG 3144902
3144903GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGATGCAACTCGTCCCCAAAACACTTGACAATTAGTACCGTATG 3144974
3144975GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGATGCAACACGGTTGCCACAGAGCAACCGCATGCAAGTTGCT 3145045
3145046GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGATGCAACAATGGGCATCAATTGTCCTGCCCAGCATCCGCGATCT 3145119
3145120GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGATGCAACGCCAACGCCTTTTTCAAGTACGCAGAACCACGATG 3145191
3145192GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGATGCAACGTCAGCACCTTAAAAATCTGATAGACTAGAAAGGA 3145263
3145264GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGATGCAACCCTGTCCAGAGAGTCGAGCATCCAGCACCTCGCGAA 3145336
3145337GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGATGCAACATATTGTTGCTTCCGCCGCCAGCGCCCTCGGACGTCT 3145410
3145411GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGATGCAACAGAGATTGCCCCCCTACCAGAAGAGGGGGAAAGAT 3145482
3145483GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGATGCAACTTGGCCTTCCTGGTCGGTGACGGCAACACTAAACGTC 3145556
3145557GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGATGCAACTGCTTACCTACTTCTTCACGCCTGTCCCACGAGAGTA 3145630
3145631GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGATGCAACGTTCCTCCGCTACCCGAACACGTGGAACCCAAAACA 3145703
3145704GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGATGCAACCTCGGCGGAGGGCGCGCGGTTTACACTGGACCAAT 3145775
3145776GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGATGCAACTGGAGTGGCTCTATGGCGAGTATGACGCTATACAGA 3145848
3145849GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGATGCAACGAGATTACTCCCTTCTCGCAAATTTTCGAGATTAA 3145920
3145921GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGATGCAACATCGGAGGTCCACCCTGTCAGGCGCACAGCCGTTTAG 3145994
3145995GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGATGCAACGAATTTGCGCGGTGTGTAGAGGAAGCCCAACCCGAA 3146067
3146068GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGATGCAACTACCCCAATATCGCTTACCCACGAGCGGGCGAACTTTG 3146142
3146143GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGATGCAACCAAATCGCACCTTCAAAAAGACCTGTGTTGGAAAAA 3146215
3146216GTTTCAGTATCCACTAACGGATCGAGGGGGATGCAAC3146252
Left flanking sequence : Till position 3137389 (length bp)
ATGAGAGAGCAACTGTGACAAGGGGATTAGGGGTCCTGTGCCATTTATCCATAACAGAATATTTACAAAA
TCAGTAGAAGCCCTCAGCCGCGCCCCCCGA
Right flanking sequence : From position 3146252 (length bp)
CGCATTTTCTGCGTCCATTATACCCTATTTGTGGGGGAAAAGCATATGGTTCCCCCACATTTCTGGCATT
TTTTCTGTTTTCATTTTTTCCTATTTCGCA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp