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CRISPRs details
NC_014964_2
Flanking alignement tool
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NC_014964_2                                                                                                                 
top
Strain :
Thermoanaerobacter brockii subsp. finnii Ako-1
RefSeq :
NC_014964 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_014964_2
DR consensus (30 bp) :
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
Number of repetitions :
49
Begin Position :
121660
End Position :
124897
121660
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
AGCTGAAAGACATTTTAAAGTAGCAGGGCAAGGTACAG
121727
121728
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
AGTCTATCTTGGCCGACAGGTCTATCCCGATGTAACG
121794
121795
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
ACAAAAGCGACATGACAATTACTTGCATGAATGGCAA
121861
121862
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
GCAACATTGGCAAATGAGCTCAAGACGAAATTTAAT
121927
121928
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
GGCCGTACCTCGGTCCAGGCGATCCGAGGTTGAGG
121992
121993
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
ATTTATAATCTACAGATAAAACATAAGTTGTGCCTG
122058
122059
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TGCATTTCCCCACCTTCGCGGTAAAGCTCCACGAACG
122125
122126
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
CCAAGAGCGAAGGCAGCGCCAAATGCGCCGGCATTA
122191
122192
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
CGAGACCCAGAGCGGCAAGTTTGACATGATCAAGAA
122257
122258
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
CGCCGAATTCAGCTGGAAGCATGGGGAGTGGAAGGAG
122324
122325
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
ATACTATCACGGCATAAGGCACAAAAGATTGTTTATAT
122392
122393
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
AAGTATAATCAAAGCGGATGTGCTGACCCAACAGTTT
122459
122460
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
ACGTATAGCTTCAAACTGGCCGTAATTATAGGCAAA
122525
122526
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
ATTTTCGACGATATACAGAAACCCACAACAATCCAGAG
122593
122594
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
ATTTATTGACATGCGGCATATTCGGATTTGGATGGC
122659
122660
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TTTGCTGGTGCTCCAGAATGGTGCGTCCGGTTCTTTG
122726
122727
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TTGACAATAAAATCGCTTTTTCTGTTCAATATCCTATG
122794
122795
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TGCAAAATTTCAGAAAATTTCAGGAAAGGAGGTATGCG
122862
122863
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TGGGATGGTCGGATAAAAAAATTGCTGAACAATTAGG
122929
122930
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
AGATACTTTTTAACTTCTTTATATATTTAATAAAAA
122995
122996
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
ACCGATTCTTGTTCCTGCTGATTGTAGCAACATCAAC
123062
123063
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
AAACCCGTAGACCGTCATACCGTGAAATCCTCACCGG
123129
123130
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
GCCTTTTTGTCTAACACTTGGAATGCTATTAGCACG
123195
123196
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
ACACAACTGAGGTGACTGTAAGCCGATGGAAGCAAAG
123262
123263
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
GTTTAGGCACATCGTTTTCGCAGTTGCCGTTGCTAAG
123329
123330
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TGAGATTAAGGATTATCTTGTTGCTGACTGGGAGTTA
123396
123397
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
ACTCTTGATACTTGATTGCTTCTCTTTCTGCATTCCAA
123464
123465
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
CAGCACTCTTCCACCCCGCCGTTGACTAGTACGTTAA
123531
123532
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TAATGATTGATTCTTCTCTGCCGTCTTTATAAAGCACAGG
123601
123602
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
AACAACATATTATCAAAATTATGAAATTTCACAAACG
123668
123669
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
ACAAGCTCGCCTATCTTTCCACCAGCTGACTGCAT
123733
123734
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
AATCCTGGCCCCGGGCAAAGACCACTTCTTCATGCTCC
123801
123802
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TGTAAACGAGGGAAAGGATGAAAAAAAAATGATAAA
123867
123868
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TGATATTTAAGCGCGCGATGTGGAGGGGTCTCGTGG
123933
123934
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
CGTGCCTGCAGACTGCAATGCCTACGACGTCATGGA
123999
124000
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
AGTACTAAAGATTGAGGAGGTATAAACATGGAAGAG
124065
124066
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
CAGCCTGTTGCTTATAATTAAGGTAACAGCAGGTTAG
124132
124133
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
AGCTGTTCCTGCAAGGATGCGATGGTTGCAGTTTTTT
124199
124200
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
CCACCTTTTTTACCTCAATTAGTTCTATAGTATTAAAG
124267
124268
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
AAACTAGTGATGGATATGTTGATTGGCTAAGTATTGA
124334
124335
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TTGCTTTAGCAAGATTGTTATTTTTTAACATATTAC
124400
124401
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
GAAAAGCAGTTGGAGGAGGCAAAAGAACATGAAAAG
124466
124467
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
CAGTATTGAAACATTAAAAAATAATGCAGAGCTGAAG
124533
124534
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
CCTGTAGCACCTTTGTAGTTATCTAAAACCTCAATGG
124600
124601
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TAATATCCTGAAACAAAGAAAAAACGCTGAATCTCAG
124667
124668
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TAGAGCCTTTTAATATTGCAAAGGAAAAGGTGCTTTCG
124735
124736
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
ATCGCTTAAATTGTTCTTCTGTTAATTCATTCTCTG
124801
124802
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
AGTATTAAAAATTAAGGAGGTTTAAAAAATGGAAAA
124867
124868
GTTTTTAGCCTACCTATCCTGAAAATAGTG
124897
Left flanking sequence : Till position 121660 (length
bp)
TGATTTTATTGGACAATATGGTATAATAAAGTCAAGATACTTGACAGAAATTAAAAAATTGTAAGGTGTA
TAATGTGCTATTTATGCATGTTAGAATGAG
Right flanking sequence : From position 124897 (length
bp)
TCTCTCAAAAAGGCAACAAAAAACTAAACCCATACCGATGTAAAAATATGGGATAAATAAATGGTTAATA
AAGTTAAATTAAAAGTTAAGACACTGCAGA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp