Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_015144_1                                                                                                                 top


Strain : Weeksella virosa DSM 16922 RefSeq :NC_015144 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_015144_1
DR consensus (50 bp) : GTTGTGAATTCCTTTCAAATTTTTGTAGATTTACTCAGTAGAATTACAACNumber of repetitions :21
Begin Position : 1975310 End Position : 1976959

1975310ACGCTTCGCTTGATTCAAATTTTTGTAGATTTACTCAGTAGAATTACAACAACAAAATAAGATGAGTGTAATTGATTTAT 1975389
1975390GTTGTGAATTCCTTTCAAATTTTTGTAGATTTACTCAGTAGAATTACAACCTTTGTGCAATGCCGAGTTCGGTGCTTCAT 1975469
1975470GTTGTGAATTCCTTTCAAATTTTTGTAGATTTACTCAGTAGAATTACAACTGTATTTCATAAATTTATCTAATCTCTCAA 1975549
1975550GTTGTGAATTCCTTTCAAATTTTTGTAGATTTACTCAGTAGAATTACAACGGAAACGGGCGTCGGTGAAGTCATCGATAC 1975629
1975630GTTGTGAATTCCTTTCAAATTTTTGTAGATTTACTCAGTAGAATTACAACTGTTTATAACAAGCTAAGAGGGTGGAAGTC 1975709
1975710GTTGTGAATTCCTTTCAAATTTTTGTAGATTTACTCAGTAGAATTACAACTACTCCATCATGCGTTATCGATCCCGATAA 1975789
1975790GTTGTGAATTCCTTTCAAATTTTTGTAGATTTACTCAGTAGAATTACAACATGTAGAATATGAATCAGATAGAGATGCAA 1975869
1975870GTTGTGAATTCCTTTCAAATTTTTGTAGATTTACTCAGTAGAATTACAACTCTGAAATTCAGATGCCTGTTTTACTTTAT 1975949
1975950GTTGTGAATTCCTTTCAAATTTTTGTAGATTTACTCAGTAGAATTACAACATATTATTTTGAGAAAACTTATAAATCATC 1976029
1976030GTTGTGAATTCCTTTCAAATTTTTGTAGATTTACTCAGTAGAATTACAACTCGCCATTGGTTTGGACGCCTTGTGCCCAT 1976109
1976110GTTGTGAATTCCTTTCAAATTTTTGTAGATTTACTCAGTAGAATTACAACTCGCTTCGGTATTGACCGAAATAGCCCACC 1976189
1976190GTTGTGAATTCCTTTCAAATTTTTGTAGATTTACTCAGTAGAATTACAACATAAAACATTTCAAACAAAATTCTTTAAGC 1976269
1976270GTTGTGAATTCCTTTCAAATTTTTGTAGATTTACTCAGTAGAATTACAACTATTAATTCAAGCATAATGTTTTGATGGTT 1976349
1976350GTTGTGAATTCCTTTCAAATTTTTGTAGATTTACTCAGTAGAATTACAACAAGTAGATCTTGATTTTATAGCTGGCTATA 1976429
1976430GTTGTGAATTCCTTTCAAATTTTTGTAGATTTACTCAGTAGAATTACAACGCACTGAATATGGATATCCAGACGATCGTC 1976509
1976510GTTGTGAATTCCTTTCAAATTTTTGTAGATTTACTCAGTAGAATTACAACTTTATAGCAGACGTAGAGGTTGTGGTAAGT 1976589
1976590GTTGTGAATTCCTTTCAAATTTTTGTAGATTTACTCAGTAGAATTACAACGTACTTGCCGTTCGGTCTTGCGTGGTATAC 1976669
1976670GTTGTGAATTCCTTTCAAATTTTTGTAGATTTACTCAGTAGAATTACAACCAGTTTCTAATCCAACGCTGAACGTTGATA 1976749
1976750GTTGTGAATTCCTTTCAAATTTTTGTAGATTTACTCAGTAGAATTACAACGTGGAGTATTTGCTTAATGCCTTTGTTGGC 1976829
1976830GTTGTGAATTCCTTTCAAATTTTTGTAGATTTACTCAGTAGAATTACAACGCTCAATATATCCAAGAGCAACACAATGGT 1976909
1976910GTTGTGAATTCCTTTCAAATTTTTGTAGATTTACTCAGTAGAATTACAAC1976959
Left flanking sequence : Till position 1975310 (length bp)
TCGTTTTCATATATTGTTTTAGATGTGCATTGGCTGAGCCAGATGCTGGATCTTAGTTGGCGTTATCTCA
TCGTTATTATTTTGTTTTGGATTCGATGAT
Right flanking sequence : From position 1976959 (length bp)
CTTATATAAAAGATTGATTATGAGTGATGTATAAGATGATCTACAAAAGAAAAAAACAAAAAATGCTTGA
AGAAATTTCTTTCTGCAAGCATTTTTTTAT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp