Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_015160_2                                                                                                                 top


Strain : Odoribacter splanchnicus DSM 20712 RefSeq :NC_015160 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_015160_2
DR consensus (30 bp) : GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGNumber of repetitions :71
Begin Position : 1524050 End Position : 1528710

1524050GTTTCAATTCTACCCTAGTTCAATTAAAAGTAGGAATAAACCGTACCCAACCACGTAGCCATATACG 1524116
1524117GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGCGCCGGGCATGGTTTCGGTGGTTTCGGGGAAAGTGT 1524182
1524183GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGGGGGTGAATCCACCGGTTTTCATTCCATGGGGAAAAA 1524249
1524250GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGGGTGGTGCCGCATGAAAACTGCGTGGACAGAAAAAT 1524315
1524316GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGGGATTTCCACAAGCTTATTTTTCTGGGACATTCTCCA 1524382
1524383GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGAAGCCACCATTTCCCCATCCGTTGTTACCCCAACCCA 1524449
1524450GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGGGGATTGAAGGTATCAATGAACTAACCGATCTGGCA 1524515
1524516GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGGAGTATTGCAGAATGGCGTTTAGCTATCGGTATGGA 1524581
1524582GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGACTCATTCTTTAAAAGAAAAAACATGGAAAAGACAT 1524647
1524648GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGGAAGGAGCAAGCGGATGCCAGAAAAGCGGTTGTGGA 1524713
1524714GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGCTTAAAGTAAAAGAAATACAGGTATTAAAAGAAGA 1524778
1524779GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGAGCAGATGTCGGAATATGTAGAACAGTCAAAATCAA 1524844
1524845GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGTAATTTATTTCACCTTCACTAGTGTATTTTCTTCCA 1524910
1524911GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGATGGGTCAAAGGTGTGAGAGAAATACTTAACCTAAA 1524976
1524977GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGCTCTTCCGGTTATGACGCTAAGATCGGCTCTTCCGG 1525042
1525043GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGCTGTAACCGATGTACAAAATCCTCTTCCCCTTCCTTG 1525109
1525110GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGGGATTAAAATTTTAAAGGTATCTAATTCGATACCT 1525174
1525175GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGATTATTATGTGATATAAAGGAAATTGCAAAATTTTC 1525240
1525241GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGAATATGAAGTATATTTGCTTTATAGAATAAAGGCAA 1525306
1525307GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGCAATTCGTTGTATTATATTCAATGTGAAATATAAAA 1525372
1525373GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGCAGAGAAGATGCTAGAGTTGCATTACAAAGATGGTA 1525438
1525439GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGTATCCTTTTATTTATTTGTTTTCAAAGTAGGTAGAAT 1525505
1525506GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGTCAACTTCGTAATAAGGGATAAACTCATTTTTATAAG 1525572
1525573GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGCGAGAACAGGCCGCACATGCTTAACACCGTGAAAAG 1525638
1525639GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGAGATTTACAATAAAGGTCAGAAGGAGATTGCTCAAA 1525704
1525705GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGGATAATTACCAGTCGGAGCAAAGTTACCTGAATTCA 1525770
1525771GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGGTCTCCGGCTGAAGTCGATGCTTGGATGGTTTCTCT 1525836
1525837GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGGATAATTACCAGTCGGAGCAAAGTTACCTGAATTCA 1525902
1525903GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGGTCTCCGGCTGAAGTCGATGCTTGGATGGTTTCTCT 1525968
1525969GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGCTTATCAACCGAGCGTTGGTTCGAATGTTTACACAT 1526034
1526035GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGTGACCAGTAATCACATAATCCAAAAGCGGAACAACG 1526100
1526101GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGATTCCCAGAATCAGTGGTCTTTGGATCAGTGGAACCG 1526167
1526168GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGGGTTGTATTCATATGAATACTGATGTAAATCTTCTTA 1526234
1526235GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGTACTTGTTTTCGTATTGGAGGTTCTGCGTCTAATAT 1526300
1526301GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGATGCAGGAATTATTTTCGAAACGCGAGAGTAATTCTT 1526367
1526368GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGAATCGATTCTTAATTGTAGCCAAAGACAACATGCCT 1526433
1526434GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGGAAATATTGTTATTTTGTTAGTCTCACTTATAAAAA 1526499
1526500GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGTAGTGATTTTCGCAAAGCACAGATAGCGAGTCTTAT 1526565
1526566GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGTCAAAATTATACGTATAAGGCTCGTTTTTCTCCCAT 1526631
1526632GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGTCACTTTTGCATAGTAAGGACAAGAAGAGTGAATCGA 1526698
1526699GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGTAGCACGAAAGGCAAAATTTTAAAAGGGAAAAGTTA 1526764
1526765GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGTCAAAATTATATGTATAAGGCTCGTTTTTCTCCCAT 1526830
1526831GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGTAATATCCACAATTCTGAGCAGGGCGAATTATTCTT 1526896
1526897GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGTGTCGGGAGCAAATAAAATAATCCTTTAATAGAAACA 1526963
1526964GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGGCCGCCATGATTTTTCAAACTCTTTTGCGGAAGAAG 1527029
1527030GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGCATATCTATTGTTATATTTTTACAATGCTCTACTAT 1527095
1527096GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGACAAACAACCCGATTTGCGGAACCCGGTGCAAATGT 1527161
1527162GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGCTTGATTGCGCCGATTGCGCCGTTTTCGTCGAAAA 1527226
1527227GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGTAGTACAAACCTATCATTTTGCTTTGTGCAATATAT 1527292
1527293GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGGTTTTTCAAGACGGAAATAAACAGCGTCTTAATAGT 1527358
1527359GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGTGTTTTGGATTGTCTTAACCTCCTGTTCCGTCATTT 1527424
1527425GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGCCGGAATATTTATGCGATGCAATGCGTATAATCCGA 1527490
1527491GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGTTTGTGCAGTCGTTCAATTAAAGCAACTTTGAAATA 1527556
1527557GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGACTTATCGCCCCGTTCGCTAAAAACGCATTTACAAA 1527622
1527623GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGTTTTAAATTTGCCGTCCTCAATAAACCAATAGCATT 1527688
1527689GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGGTATTTGTGCATACATAAACAGCATTCCCGATAAGT 1527754
1527755GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGTTTCCACGAATGGGACGTTGTACGTTTGCCGTACAT 1527820
1527821GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGCAATTGCGTTTCCCTGTATCTCGGTTGTGTCAACCG 1527886
1527887GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGCAATTTGCAGAAACCGGCTTGCGGGCGTTTTTAAAA 1527952
1527953GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGTGAGGTTTACAAGAATTTAACACGTAAAATAAAGAAT 1528019
1528020GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGCCGGTTGTTGGATATACTCAAAAAATACTATTCGCAAA 1528087
1528088GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGCAACTTTGCCCGGTTCGCCTCTAAATCGTCTAATTCT 1528154
1528155GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGTCACCATAAATAATTGTACTATGTTATTCAAAGTAT 1528220
1528221GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGTCAAAATTATACGTATAAGGCTCATTCTTCTCCCAT 1528286
1528287GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGATGGCTTTCTCTGCCATAAAGATTTATCTTTATTTA 1528352
1528353GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGCAGCCGTATTTACAGGCTGGGTACGAGTAAACAAT 1528417
1528418GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGCTAAGCCGAGAACAGGCCGAGTGTGCTTAACACCA 1528482
1528483GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGTGTTCTCGGCTTAGCGATGGACCAGCAGTTTGAGTT 1528548
1528549GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGACAACGTCACCAATAAGATTAGACGAATCAGAAGA 1528613
1528614GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAGTCGTCAATAAGTTTTACACTGAATGTCAACATAAACA 1528680
1528681GTTTCAATTCTACCTTAGTTCAATTAAAAG1528710
Left flanking sequence : Till position 1524050 (length bp)
TTCATCGTTCCGAGAAGATCAATACCCCGGCGACAAACTGACATTTCGGAATCTCACCCTTATCCGGGAC
GGTTAATAAAAACATGCCAGGTTGAGTCCA
Right flanking sequence : From position 1528710 (length bp)
CCGTTAAAAACGCCAACAAATATACTTCAAAATCAATGATTTATCATCCATTTATTCTCATTTTTTACAA
ACATTTGCAGTCGACCTTCAATTCTTAAAT
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp