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CRISPRs details
NC_015311_8
Flanking alignement tool
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NC_015311_8                                                                                                                 
top
Strain :
Prevotella denticola F0289
RefSeq :
NC_015311 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_015311_8
DR consensus (37 bp) :
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
Number of repetitions :
43
Begin Position :
2808033
End Position :
2811108
2808033
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
TAACGACGGTTTCGCCGTCGTTGTTAAGCTCTGCA
2808104
2808105
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
GTTTTTGGATCTTCGACCCGAACTTTTTTTTATT
2808175
2808176
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
ATCCTGATTCTCAACCTTATTAGGTTTTTTGGATC
2808247
2808248
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
TCGAGGGCTTAAAGGGTTATATTAATTTCGG
2808315
2808316
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
CCTTGTTTTACTCTCATAATTAACTTTGTAAAAGTA
2808388
2808389
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
TCATAATTAACTTTGTAAAAGTAAGCGTACCGCC
2808459
2808460
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
TGGAAATGCCCACACCAAAATAATGTCGTGACAAATAA
2808534
2808535
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
TGCAGCGAATAACTCGTCCATGCTATCATAGTTCTGG
2808608
2808609
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
GCTGTTTTTGCCTAACATATCGGGAAAGGCTTAAATA
2808682
2808683
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
CGCGCGTGTCTCCTTGTTGTCGCAAAAAGCCAAA
2808753
2808754
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
CACCCCGACACTCATCAACGAGTGGATGTCGGA
2808823
2808824
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
AAATATATATTGTTGCAATAAGTCAAAGATGGA
2808893
2808894
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
AAGATTTCCCATATAATTGCAATTTTTGGTTACCGAA
2808967
2808968
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
AAGAGAATTTATTCTGCTCTGTAATTGGTAAAAT
2809038
2809039
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
AATGCTTGCTTTTTTTGTCCCTAAAGCAGTTTGTAA
2809111
2809112
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
GAGCCTCTAATCAAACTTCCCATATAATTGCAATCT
2809184
2809185
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
TTGCAAAACTCCCCGCTGTGTCGCTTACATAATAGTG
2809258
2809259
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
AGTTTATTTCCGTTGTTATCAACTCCCTTAACTTTC
2809331
2809332
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
GACGAGACACCACGCTTCATTTATTCTAAACGAAAG
2809404
2809405
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
TCTATGTCATGCGTGTACTTTTCGCAAGTAGTGTA
2809476
2809477
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
TATGTTTTTTTTAAGTCTTGTAGATTCATGACTTTA
2809549
2809550
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
ATCACTACACTCTTTATATGTTTTTTTTAAGTCTT
2809621
2809622
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
ACCTTCCTGGCCTCGCTTGATGAAGACTTCCTT
2809691
2809692
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
GGCTTGCTTAAAGGTCATGTAGACAGGGGTGTTGTATC
2809766
2809767
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
CCGCACATTGTTTACTTGCTGTAAGTTCTGTTAAGT
2809839
2809840
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
GATTTGTTGAGTTCGTTTGCCGTGCAGATTGTTAC
2809911
2809912
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
CACGCTTTAAGCAAGCAGCGAAACTTTCGCCTGTA
2809983
2809984
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
TTTCTTAAAGATTTTTTTTCTTTGTCAGTGCAGTCC
2810056
2810057
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
CTTATTTGCCACAACCAAAGCAGACTCCTTTGGCT
2810128
2810129
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
TTCAGAGCCTCCTTGAATTCCTTAGAGTTTTGATCC
2810201
2810202
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
AAAGGGCATACGCTCTCTTAGACATTCTTATCGCCAC
2810275
2810276
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
TCTAAGTAAATATTTCATAATTATAGTTATTATAGTT
2810349
2810350
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
ACAATTCCTTTTACTTCTACCCCAGGTAAAAGTACT
2810422
2810423
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
AATCTCTTCAAATTCTTTCTCATCACCCTTGAAGAA
2810495
2810496
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
TTGTTTTTCTCTGCGAAGTCAACTGCCTCTTGGAA
2810567
2810568
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
CGAAGGCATCACAGCATTACGCACAAGCTGTCTAA
2810639
2810640
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
TCCGTATTTAAGAGCGATAAGAATATCGTTTTTCT
2810711
2810712
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
CATCGGAGAAAAACGTTTTCTCATTCACGCGCTCCACT
2810786
2810787
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
TCAGAGTAATAAGAGTAATAAATGAAACCGCCAA
2810857
2810858
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
TCAGAGTAATAAGAGTAATAAATGAAACCGCCAA
2810928
2810929
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
CTCTGATATGTAGTCATTGGGAATTTCATTGTAG
2810999
2811000
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
TTTTTCATGCTAAGTCTGACCCTTATTCTAAGATT
2811071
2811072
CTCAATGAGTATCTTCCATTAAAACAAGGATTAAGAC
2811108
Left flanking sequence : Till position 2808033 (length
bp)
GCACTCGCTTGGAATATGGTTAATTTCTCTTAATTCCTCAAGCATTTTTAGGTCTTACACGCATGGGGCT
GCGGCATATAAAGGAATACAAGTCTTTACT
Right flanking sequence : From position 2811108 (length
bp)
TTTGCAAGAATTCGCTTTGCGTCCTCAACCTTCACTCAATATTAGAACAAGGATTCGGAAGAAGAGCCTT
TTGGGGCAAAAGAATTATGATTTATAAATT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp