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CRISPRs details
NC_015417_1
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_015417_1                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium botulinum BKT015925
RefSeq :
NC_015417 (plasmid p1BKT015925 )
CRISPR id :
NC_015417_1
DR consensus (30 bp) :
ATTAATAAATAACATAAGATGTTTTTAAAT
Number of repetitions :
21
Begin Position :
16802
End Position :
18148
16802
ATTAATAAATAACATAAGATGTTTTTAAAT
GCTTTGAAAGCTTGTCCCGAATAGCTTGTACACTTAT
16868
16869
ATTAATAAATAACATAAGATGTTTTTAAAT
GAAACACAGTTTAAAACAAATTTGGAAGTTGGAAT
16933
16934
ATTAATAAATAACATAAGATGTTTTTAAAT
AGCTAAAAAGAATGGTGAATACCTTCCTGAAATTA
16998
16999
ATTAATAAATAACATAAGATGTTTTTAAAT
GAATTAATAAAATTAATACAAGACAATACAATGGAA
17064
17065
ATTAATAAATAACATAAGATGTTTTTAAAT
AAATTTGCCATATGCGGTCCCCAAAGTACCCATTTAC
17131
17132
ATTAATAAATAACATAAGATGTTTTTAAAT
AAACCTACATGATGATATATGGAAAGTAGAGCTTAT
17197
17198
ATTAATAAATAACATAAGATGTTTTTAAAT
AAGTAAGCTTTTCCAGTAACTCCCCTTACTTTTAAT
17263
17264
ATTAATAAATAACATAAGATGTTTTTAAAT
TTAGTGCCATAGTTTGTACTCCAAATATCTAAAC
17327
17328
ATTAATAAATAACATAAGATGTTTTTAAAT
ATAAAAATTTAAGATAAATTTAAGGGAAGACACTAAT
17394
17395
ATTAATAAATAACATAAGATGTTTTTAAAT
TGAAGCAAGAAGAAAGAAGCGAATTTATAAAAGAGT
17460
17461
ATTAATAAATAACATAAGATGTTTTTAAAT
TTTGCTTGTCTTTGTTTTTCTCTAACATACTCCTGT
17526
17527
ATTAATAAATAACATAAGATGTTTTTAAAT
TCTATTAAAGATTTTAAAGCAAGATTTTCGCTTAT
17591
17592
ATTAATAAATAACATAAGATGTTTTTAAAT
AGGTAAAGAACAAGACGATGAGGGATATTTTAGAGA
17657
17658
ATTAATAAATAACATAAGATGTTTTTAAAT
TTTGTAACTGTAAAATCATTTAACTTTTTAATATCT
17723
17724
ATTAATAAATAACATAAGATGTTTTTAAAT
TGTGATAGAGTAGCATTTAAATATAAGGTTCTAGGT
17789
17790
ATTAATAAATAACATAAGATGTTTTTAAAT
ACATCTAATATAGTAATAGTCTTTTCTTTATCGTT
17854
17855
ATTAATAAATAACATAAGATGTTTTTAAAT
AGAATTACGAAGACAGTATGAGAATGCTAGAGAACTT
17921
17922
ATTAATAAATAACATAAGGTGTTTTTAAAT
TTTGACAAGCCTGTTTTTTATCCATTTTTGACATT
17986
17987
ATTAATAAATAATATAAGATGTTTTTAAAT
GAAATCGGTTGTCCTTTTGTATAATCTCTTAATCCA
18052
18053
ATTAATAAATAACATAAGATGTTTTTAAAT
TTTTGTTTTGTTCAGTATCTTTTTTTGGGAGTTCCT
18118
18119
ATTAATAAATAACATTATATGTTTTTAAAC
18148
Left flanking sequence : Till position 16802 (length
bp)
AAGTTATTTGTTAGAATCGGTTGGGAAAATTCTAGTTGAAATATTGGTATATAAGGGTTATCATATAAAT
ATGAACAATAAGAATGGCATAAATACTATG
Right flanking sequence : From position 18148 (length
bp)
CGCAAAGTTAAAGATTAATATATGTAAAGAACTACTTTATAGTAAGGTAGTTCTTTTTTTATTGCGGAGA
AATAGGTTGGTTGTTAAATAAAGTCAAGCA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp