Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_015417_3                                                                                                                 top


Strain : Clostridium botulinum BKT015925 RefSeq :NC_015417 (plasmid p1BKT015925 )
CRISPR id : NC_015417_3
DR consensus (30 bp) : ATTAATAGATAACAAGATTTGTTTTTAAATNumber of repetitions :13
Begin Position : 27115 End Position : 27925

27115CAACCTACATCCCCAGATTTGTTTTTAAATATTAGTTTACCACACTTTGGACACATTCTCATTAG 27179
27180ATTAATAGATAACAAGATTTGTTTTTAAATCCGATAGTGTATTCTTTACCTTCAAATTCTACTTTA 27245
27246ATTAATAGATAACAAGATTTGTTTTTAAATATATAATCTTTTTTATGGAGGTGATACACTTGAT 27309
27310ATTAATAGATAACAAGATTTGTTTTTAAATTGTTTAGCTAGGTAGTTTTGATAAACTTTAGTATTC 27375
27376ATTAATAGATAACAAGATTTGTTTTTAAATTGAAATTGAGAATAAGCAAAAATCAATTCTTGTAAC 27441
27442ATTAATAGATAACAAGATTTGTTTTTAAATTCTGTACTCTCTTCTATAGTCATTTTTAATAGTGT 27506
27507ATTAATAGATAACAAGATTTGTTTTTAAATCATTTATATGGTTCTTGCTTGTCCGATTGACTTTATA 27573
27574ATTAATAGATAACAAGATTTGTTTTTAAATTCGTAATTGTTAATTATTATTTCAATTTTCTTAT 27637
27638ATTAATAGATAACAAGATTTGTTTTTAAATTATAAGTATAGTGATTTTAAAAATATTGATGATCTAG 27704
27705ATTAATAGATAACAAGATTTGTTTTTAAATAAAGTAGTTATTTTGAAACTTATAAATACATTAATC 27770
27771ATTAATAAATAACAATATTTGTTTAAACTTTAATTTGCATATGTTAAAATAGAAATAAATGTAG 27834
27835ATTAATCTATAATATAGTTTATTTTTAAATATATTTAGTTTTAATTCGCAAGGATTAGTAT 27895
27896ATTAATAGATAACATTATATGTTCTTAAAC27925
Left flanking sequence : Till position 27115 (length bp)
TTCTCATTTAGATTCCTCCTAAATTCTTATAAGTATATTATTCCAAACTAACCAATTTTCCATACAAAAA
AGATGTAGGTTAATTTGTTTTTACACAAAT
Right flanking sequence : From position 27925 (length bp)
GAAGTTTTAGATTAAGAAAGGAGGATTTTAAAGATGTTTGATTTAAAAATAGATAATATATATGCACATA
TAAACAAAGAAGCAAAAGAGACTTTATACC
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp