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CRISPRs details
NC_015426_1
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_015426_1                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium botulinum BKT015925
RefSeq :
NC_015426 (plasmid p2BKT015925 )
CRISPR id :
NC_015426_1
DR consensus (29 bp) :
ATTTATAACTAACATAGTTCTATTAATAC
Number of repetitions :
29
Begin Position :
75803
End Position :
77677
75803
ATTTATAACTAAGATAGTTCTATTAATAC
TTCTTTAATTGATAAATGTAACAATTTCATTTCTGG
75867
75868
ATTTATAACTAACATAGTTCTATTAATAC
TCAGCTTGATACAGAGCCTCTAAGTTATTTCAATAGTC
75934
75935
ATTTATAACTAACATAGTTCTATTAATAC
TGAGGGCTTTTTTGATCTTTAAAACAGTTTCTATACC
76000
76001
ATTTATAACTAACATAGTTCTATTAATAC
TTTGAAGCTTATCACCTATAAGTTTGTATTTTTTTC
76065
76066
ATTTATAACTAACATAGTTCTATTAATAC
ATGCAGTTTTAAAGTCTTTATTATTAGCTAGTGTTGC
76131
76132
ATTTATAACTAACATAGTTCTATTAATAC
CCGCATTGAATAATTTTTTAGTTAAACATTTAAATTTA
76198
76199
ATTTATAACTAACATAGTTCTATTAATAC
GGATTATAGTAGTAGATAGAAAATTAGATTTAAAAAGA
76265
76266
ATTTATAACTAACATAGTTCTATTAATAC
GCAATGGGTATGCGACTAGGTGGAGCTGGACATCAAGT
76332
76333
ATTTATAACTAACATAGTTCTATTAATAC
ATAGTTTAAAAATGTTGTTCTTCCTCTGTTAAATA
76396
76397
ATTTATAACTAACATAGTTCTATTAATAC
GTGATTTAGCTGCTACAAATCCAAATGCTATTTCAAC
76462
76463
ATTTATAACTAACATAGTTCTATTAATAC
TTCAAGGAAGTGGTATTGGTCTGAATACTCTATCTTT
76528
76529
ATTTATAACTAACATAGTTCTATTAATAC
CAGATTACTTGGAACAAATAAAGTCAATAGTCTCTGG
76594
76595
ATTTATAACTAACATAGTTCTATTAATAC
TAATTTCTTTTGCTTCATCTTTTTTACTTTCGTAGGC
76660
76661
ATTTATAACTAACATAGTTCTATTAATAC
CTATATATTTTTGACTACCTTCCGATTTAGTTCCATA
76726
76727
ATTTATAACTAACATAGTTCTATTAATAC
ACAAAAAAATAACACATCCGTATCAATCGATTAGTT
76791
76792
ATTTATAACTAACATAGTTCTATTAATAC
GCAAGATGATAGCTGGTATGGCTAAAGATTATTTCA
76856
76857
ATTTATAACTAACATAGTTCTATTAATAC
GTGCAAGACGTGTCATGTTATAAGTCTTTCCTTGACC
76922
76923
ATTTATAACTAACATAGTTCTATTAATAC
CAATACTGAACTATCCTAAGAGTGATATTCGCTCAATTGG
76991
76992
ATTTATAACTAACATAGTTCTATTAATAC
AGATTATAATAGAGTGACACAAAATTAAAACAATGT
77056
77057
ATTTATAACTAACATAGTTCTATTAATAC
GTTAAAAGATTGCTTAATTTTAGAAGATTGCTGAAA
77121
77122
ATTTATAACTAACATAGTTCTATTAATAC
CAAGCAACCATGAGTTTGATTGAGCATGGTAATTTAAG
77188
77189
ATTTATAACTAACATAGTTCTATTAATAC
CAACATATATTCACCACTTACAAGTTTTCTCATATA
77253
77254
ATTTATAACTAACATAGTTCTATTAATAC
GGTTTTATTTTGAAGATGAATTTAATACTCTTTTTAA
77319
77320
ATTTATAACTAACATAGTTCTATTAATAC
ATTCAGACGTGAGTATAAATTAGCAGCTGCCAACA
77383
77384
ATTTATAACTAACATAGTTCTATTAATAC
AGATGAAAGAGTTTATTTATCTAAGCAATATGGAAA
77448
77449
ATTTATAACTAACATAGTTCTATTAATAC
CAAGCACGTTAGTATATGCATAGATGGAAAATCTGAAG
77515
77516
ATTTATAACTAACATAGTTCTATTAATAC
GGAAAAAAATAAAAATATATAAACTTCAAGTACCTAA
77581
77582
ATTTATAACTAACATAGTTCTATTAATAC
ATAGAAGGAATAAGCATTTTAGAAAATGCAGTTAAATT
77648
77649
ATTTATAACTAACATAGTTCTATTAATAC
77677
Left flanking sequence : Till position 75803 (length
bp)
ATATATTTGTGAAAAATCTATTATATTTCAATAGGTTGAGAGGAATCAATGTTCATATAACTTAACAGAA
CTAAAAATATTACAAGAAGGTTTTTCTATG
Right flanking sequence : From position 77677 (length
bp)
CCCATTTTTCTTTTAATATCTTTGTTTTACTATACAACTCCATATTTTACACTTAAAATTTGAAAAGAAA
TCATACAATTTTGCAGTGAGCTATTTTTTT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp