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CRISPRs details
NC_015510_4
Flanking alignement tool
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NC_015510_4                                                                                                                 
top
Strain :
Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100
RefSeq :
NC_015510 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_015510_4
DR consensus (30 bp) :
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
Number of repetitions :
93
Begin Position :
611640
End Position :
617749
611640
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
TCCTTGGATGTGAGGCGGTGCGGGTGGTCTTCATTC
611705
611706
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
TATCAGAGGTGATTCCGTCGTAATGCGGGGTTATCAT
611772
611773
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
ATAGCGAAGAGGCAACAGAGTTGCAGGTATCAATTG
611838
611839
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
AAGTCGAACACTTAAATGAAGCTCATAGATCGTATA
611904
611905
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
GGTCTTTTCGTCAAACGGGTCATCCTCTTCATCGGC
611970
611971
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
AAGCCCAAAACAAAAGGAATGGGAAGCACTGGTTAT
612036
612037
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
TGCAACGCAAAACTCATGCCCTGGTTGATAAACGCC
612102
612103
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
GTAGTACCCGCCGCCGTCCTTGTCGAGGTAGGCATAG
612169
612170
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
TGAATTTTGCGTTTAGACGTGAGCTGATGCCGTATG
612235
612236
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
TGCAGAGGATGAAGCGAGGAAAGAGCAAGAACGGTT
612301
612302
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
TATGTCCGCCGTAGTCCTTCCCGATTGCCAGATCGG
612367
612368
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
CAATAACCATTCCTGTCGTTGACATCGCCCTCAGCAGC
612435
612436
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
CGGGTTAATGTGTCGTACAATTCCCGGTTGGGTTGA
612501
612502
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
TTTACACATGCGGCAAACATTTTTCCACACTTGCAA
612567
612568
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
AGGCGAACAACGCCTTTTTTTGTCCAGAAAATCGAA
612633
612634
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
TTTTTTTGATACTGGATAATCCACTCGAGCAATCCC
612699
612700
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
TTCGTTGTCTTGGGTGTCAAAAACAAGGTCCGACAC
612765
612766
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
CAAGTGGCACCACCGCCACCCAAAACCGACCTGATG
612831
612832
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
TCAGTGGCGGGACAGGCACAAGTATCAACGTGTCTG
612897
612898
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
GAATTAGACATCCGGAGCGACCGACACGAAATCGCAG
612964
612965
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
ATAGGGTTAGCAATGCAAGCAGCAAGCCAGGGAGTA
613030
613031
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
CACAAGTAATGATCAATACATTAGAACACGGACTAT
613096
613097
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
CTGTTACCGGGTTCATCAATAGAACTAGAGTACACA
613162
613163
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
CAGCTAACAGGAACGTACTGTACTCTGCTATCTTTC
613228
613229
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
AGTACACTAATGGTGATAGCGTCATTAACGCCCAGG
613294
613295
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
TGCTTCGTGGCGGTAGCTGTCGATCTCCGGGTGAAA
613360
613361
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
TTACAACGAACATATTAAAACCTGCCCACCAGCGCTC
613427
613428
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
TCAGCCATGTATCCTAAACCTTCAGTCAATTTGCCCG
613494
613495
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
CCATATCCCAGATGGTGAACAACAACTGGGCGCAAA
613560
613561
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
TTGAGTGGAGTGATGACCCTCGGCACTTGTTGCCTG
613626
613627
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
TGAATTCGCCTTCAGTTAGTCCATCGTGGTGCATG
613691
613692
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
ATGTTGAAGGTCTCGCGCTGGTCGCTGCCGGATCCG
613757
613758
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
AATTAAATTTTAAGGTTTTAAAAATCACTTATCAAA
613823
613824
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
TCACCAAGAACCGCCAACCCCAATATTTTATCCGCG
613889
613890
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
ATAATACCCCCTTCTTTTTCTGCGCAGGCAGTAG
613953
613954
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
TCGGTGTTGTCCAGGTAAGCGGACAAGGAAACCGAG
614019
614020
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
ATTAGCGGCGTCTTCTATCATGAAAAAATAGACTAC
614085
614086
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
AAGGTTACTATGCTCAGTAAAAAACACAAAATGAAT
614151
614152
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
TGTTTAGCCCCTTTCCCATCAATTCTGCTCAAGCATC
614218
614219
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
TTTGGGGCCGCGCTCCTCCACCATTTGCCCGTGTTG
614284
614285
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
ACGTAAAGCACTACGTTAAAACCCCTAAGCAGTAG
614349
614350
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
CGTAAAAATAGAAGCGGATAAAAGCCTCTAAGTTTT
614415
614416
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
GAAGCTGAGCAAGGAAATTCAATTAGTTATTACACA
614481
614482
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
TTTAATACGGGCTATTCGCAGCCCTGCAATAATCTCC
614548
614549
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
TAATTAGATAGCCTACGACTATAACGATAAGGAAAA
614614
614615
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
TCTTGTTCGTCAGCTTGAATGGGTTGGGTAAACCAA
614680
614681
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
TCGAATTAGCAGCATTGGCTACACTGCTGGCCAAAA
614746
614747
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
TTTTTTCAAAGCCCGACAGAGCGGTTGTCGGATTTG
614812
614813
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
TAAATTACACCGATCGAAACGTTACCGTTCGATCCT
614878
614879
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
AGATAAGGAAGTATTCCCTAAGTCTCTTCTATTAGT
614944
614945
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
AGTTTAAAGGGGCGTAGCTTAAATATAAGGGGAAACG
615011
615012
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
TCATGATGGGGGCAGCCTTTTCCAAAGGTCATTTGA
615077
615078
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
TGAGTAGGTGGTTTCGCCCGATAAAGTCTCGCTCTT
615143
615144
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
TCAGCAATGACGTGACATTCTCGTGTATTCATACC
615208
615209
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
TGCAAAAAGACAAAATACTGAGCGACTTCGCCGGGC
615274
615275
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
AGGCTTCCACCCAGGGCGGTGAGCGCCCCGCCGATG
615340
615341
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
TCACTCAGAGGAGTTGAATTGTAGTCGGAGATAGTT
615406
615407
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
ACACGTATAAGCGTCAAGCTGCTCCAGCGAAACCGC
615472
615473
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
CTAGGAGATGGCTTGGAATTAAGTTGGTCTACCGTT
615538
615539
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
CCCGCTGAAAAAGCCAGGGTTTCCCCGTTGGTGATG
615604
615605
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
ACAAGACATCGGGTTTACTGAAACGGGGGATTTTAA
615670
615671
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
GCAATAGCAACGCCGGCGATACTGTGATTAATGTGG
615736
615737
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
CCAGACACGGACAGGGTATTGGAGGACAGCGTCAGC
615802
615803
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
AAGGTTATACCAAGACGGCAGCAACCAAAACACCGCC
615869
615870
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
GTGGGTGATCTTGTATTCGTCCTCGGGAATTTGATA
615935
615936
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
TGCACTTTTCAGCAGCGTATTTTAGTTGAAGGTCGT
616001
616002
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
GTATTCAGGGGAGGCATGATTAAAGATGTGATCTTC
616067
616068
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
GCGTTCAATCAAATCGGATTCCAAAACGACATTAAC
616133
616134
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
AATCCAGGAGATGGAGAGGCTAAAAGTGATGATAAT
616199
616200
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
TTGTAAATGCCAACAGCATCATAAAAATAAGATTGC
616265
616266
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
CGAAGGAACCCAAACCTACATTTCCGCGTGGATCGA
616331
616332
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
CATTTCCCCCTGGTCTAATTTGTGTAGCCATAGCGC
616397
616398
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
AACAAGAAGAACGGCGGAAACGTGCCTCACATGCACG
616464
616465
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
GCTTTCGGATGGTGCGGGCTGCGTTGAAGAATCCGA
616530
616531
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
GTGATCATTGCCGTCAAAATATTCTGACTGAATTTC
616596
616597
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
ACATTTCGGAGAAGCTGGCCACGGTATTGCTGCCCG
616662
616663
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
GCGCCTACGCAGCCACCGTGGCCGAGCTGTATGCGAA
616729
616730
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
AAGTCAAAGCTTTTTCGCCTAAAAAGCCTTTCAAAAC
616796
616797
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
GTGGAAAGAAATTGCACCCAAAAAATGGGTATCCG
616861
616862
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
TGAGAACAGCGTTTCAAGATAGAGCAATGGTCTGCC
616927
616928
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
TTGTTGATGATGTAAAAAACAACCGCATTGATAACT
616993
616994
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
AAATATGTCGCGTTCCTTTACAGTTATTCTCATTTC
617059
617060
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
CTAGTTCATGGGCGCGAGCTTCGCGTTCTTTCAAGC
617125
617126
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
GGGGCAATTCCCTTGGTTCCATCCAGCGCTGGTGAA
617191
617192
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
CAGAATCATGCGCTCCAGTGCGTTGTAGGCCTGGGT
617257
617258
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
ATGTTGAATATTGTCCGCTTCTTGAATGAATATAGG
617323
617324
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
AAATACAACCCGTACCGGTGCTACTCGGGCTACCGG
617389
617390
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
AGGATTAAGCGGAATAGGTATAGCACCGACGGACGA
617455
617456
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
CTTTCATCAATCCTGCCCTCACTTCTTGCGAGTTCT
617521
617522
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
ATGCTGCTGTCTCTTGTTCCTGAGACAAGGCTTGTC
617587
617588
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
ACTCTTCCGGGTTCCTTCACCTACCGAATCACTTTA
617653
617654
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAAAC
GTAATAGCTTCGCTCCTGGATTGAATTAATCTGGCG
617719
617720
CTCGCAATTGGATTAAGATGGGATTGAATG
617749
Left flanking sequence : Till position 611640 (length
bp)
TCCGCTTATTGAACATCGACGATTTTTATGGGCTAAAAACGCTCTTTGACAAGTTGGTATTTATTTGGTT
TTTAAGGAATAATGTATATTTTTGTGACGG
Right flanking sequence : From position 617749 (length
bp)
TCATTAGTCACGAAAAGTGTACCACCAATAATCACGAAAAGTGTACCACTATAAATTGTTAAATTCTCTG
GGTCAAACCGGAGCAACAATGTATAGAATG
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp