Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_015587_9                                                                                                                 top


Strain : Hydrogenobaculum sp. SHO GCF_000215065 RefSeq :NC_015587 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_015587_9
DR consensus (29 bp) : GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGNumber of repetitions :51
Begin Position : 1088875 End Position : 1092207

1088875GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGACTTATGCAAAAGTATCTATTACATTAGAACTATCAAAC1088942
1088943GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGCCTGACAAAAATGAGAGCATAACACTTCCTACTTTTGCAA1089011
1089012GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTTATCACACGTGCAAGTGTTTTGTGTTTTGATATGA1089076
1089077GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTTGTCTCGTAACATTAAAATTCGTTGGAGTTGTAT1089140
1089141GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTCTTCAAAGCATACGTCAATAGTCTGCCAGCTTTGAGA1089207
1089208GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGCTAAATTTTGAAAGTGTGGAGGATATGAAATCTTTTT1089273
1089274GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGATTTCTTGAGATAATTTGATGATAGAAATATTTTTCT1089339
1089340GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGGTTAAAGAATCGTTTGAAAAACAGCAAATAGCAGAA1089404
1089405GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGATCTCCTACAGCACTCCATTGATAATATGTTATTT1089468
1089469GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTTTGCAGTTAGCTTCTTCAATAGATTGATGTTTATA1089533
1089534GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTTACAAGTTTGTAAAACATCTCTTAAAAGCTTGTTT1089598
1089599GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTCGCACAGCTAAACAGCAACAGACTACTTGCTAAAATA1089665
1089666GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGAACTCAACATCATGCAAATCTGGGACTGCTTCTTTTTGC1089733
1089734GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGCCAAAATATACTTGATAAAAACGATAAACAAGCACATTCG1089802
1089803GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTTATCTCATCTTTTTGTAGGTATCTCAATACTCCTTG1089868
1089869GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTTTTTTAGCATCACTTTTTAACGATGCATTAGGTTTAA1089935
1089936GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTTGTTGGATAAGTGATTTTTACTTTGTACTTCATGG1090000
1090001GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGGAAGCTGTCAATCTAAACACTACTTTGTAATTATTTG1090066
1090067GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTTTTGCATCAAGCGTATCAGGAACCAAAACTTTCGC1090131
1090132GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGGCACTTGCAAGTGCCACTTTGCGAGCCAATGCGAATAGA1090199
1090200GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTTTAAAATGGCGGAAAGTTCTTGCGATCTGTCTAGT1090264
1090265GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGATTAGAGCTTTGTCTTTTTTCAAGAAAGACTCTATTC1090330
1090331GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTTCCTTGGCGCTCTTTCTACTCTTGATATCACAGAA1090395
1090396GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTTTAGAAGAGCTTCAAGATTAAGTTGCTTTTCCATCT1090461
1090462GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGAAATAGCAGCCCAGCTCCAACCCCACTGTCTTTCAG1090526
1090527GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGATGTCAACATGTATTGGTCAAAAGCTGAAGGAAGGC1090591
1090592GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTGAGCCATATTCTCAGAGATTGGCTGGTGTAATAGCA1090657
1090658GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGGACGGTGTGCGTGGTCTTACGGGGGATGTCATTTTA1090722
1090723GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGGACAAAGACTTGATTGAAGATTTGCACTCAGTCAAAAA1090789
1090790GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGCGTTGAGTTGTGAGTATCACTTTGATATTTTGCATGA1090855
1090856GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTATTCTATTTGCAATCTCTTCAGGCTTGAGGGCTCT1090920
1090921GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGCTTAATCACTTCAAGCCGCAGATGTGTATCTCCTTG1090985
1090986GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTAGAGCATTTGCACTCATAGATGCTCCAGTAGGACT1091050
1091051GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTAAGTTTTTGCTTAAAACTTCTTCTAAAGAAGCTGCA1091116
1091117GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGAACACAGACGCAAACCTTTTAAACGCAAACGGTGTA1091181
1091182GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGACGTTTTTCACACGACCTAACGCATCTATGTGTTTCATCTGA1091252
1091253GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGACAATTGCTGAAAAAGTGGACGATGACAAGAAGAAGA1091318
1091319GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGGAAGTAAACAAAGCTCTGTTGCTTCTGGCGGCTTCT1091383
1091384GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGCTACCAATCGCATCTACGCCTATCACCTTCCAACCA1091448
1091449GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTTGATTACAAACATTATCAACGCACTTGTAAAACAAA1091514
1091515GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGGAGTAAGCGTTTTTTTAACAGAATGGAGGTCTTCTAT1091580
1091581GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTAGAGCATTTGCATTAATAGATGCTCCTGTGGGACTT1091646
1091647GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGGCGTTTGAAAATAGTATTTCTTTTGTGTAAAAATAGG1091712
1091713GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTTTAAAATGGCGGAAAGTTCTTGCGATCTGTCTAGT1091777
1091778GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGATTAGAGCTTTGTCTTTTTTCAAGAAAGACTCTATTC1091843
1091844GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGATATGATACTTTTAGCACTTGCCCGAGCCAGTAGCTAATGG1091913
1091914GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGATTACTGAAAAATTGCAACAATTATTAAACTACATG1091978
1091979GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGCTTCTAAGGTTTGATGTAGTCTTTCAATCATTTGAGGCA1092046
1092047GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGAGCATCGGGGCGTTTATAAATACCGATGCAAAAACT1092111
1092112GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGACAACAAGCGTTTGATAAACGTTAGCGGGAGTTGTTGA1092178
1092179GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG1092207
Left flanking sequence : Till position 1088875 (length bp)
CAGAATCTGGCATTTTCGGGAAATTACCTTCATTTGCGATGGGTACCCCCTTGACAAAACCATTGATACA
CTATATAATTTTAAATATAGTGATTTCTGG
Right flanking sequence : From position 1092207 (length bp)
TTTCATTCTACTTTGTAATAAAGGGTTATCTCTTTGTTGTCCCTTATGATTTTTACGCTGAAGCTTTGGC
TGTTTCTTAATGTACCTAATATTCTAAAAG

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp