Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_015636_2                                                                                                                 top


Strain : Methanothermococcus okinawensis IH1 RefSeq :NC_015636 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_015636_2
DR consensus (30 bp) : GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATNumber of repetitions :9
Begin Position : 206578 End Position : 207146

206578GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAAAAATGACAAAACATAGCACATTAGATATGCTGCTAAAT 206645
206646GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAAACAGATTGGGAATGATAACATTATCTACAATATAATCA 206713
206714GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAACTCGAAATTAAGCTTTCGGAAGGAGAAACATTTAAATT 206781
206782GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAATACATAATACACCCTTCGATAGGATTCTTCATTATCTT 206849
206850GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAATAGTCTCACCTTAACCTAATCCTATATCTACATATTTA 206917
206918GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAATGCGTAGGATACCCCATTTCCAGCAACTTTTCTTTT 206983
206984GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAATGTATTTTTAGTTTCGAAAGGAACTGATTATGATTGG 207050
207051GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAATTCTCTTTTTGAATTTCTTATATTAATCTATAAAAGA 207116
207117GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT207146
Left flanking sequence : Till position 206578 (length bp)
AAACTTATATAAATAACAAAAATCAATGAGATTCGAGATGCAAGGTTTATATCGGAGTAATGCAAAGTTA
TTTTATGCAAAATAAGAAAAATTTTGAACT
Right flanking sequence : From position 207146 (length bp)
CTTTATTTTATTTAAAATAAATAGAGTATAAAAATAATTGGGTGAAAAAATGGATTTTCTGTTTAGTTTA
CTTCTAATATTTCTTTGTGGTTGTGGCTTA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp