CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_015636_4
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_015636_4                                                                                                                 
top
Strain :
Methanothermococcus okinawensis IH1
RefSeq :
NC_015636 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_015636_4
DR consensus (30 bp) :
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
Number of repetitions :
81
Begin Position :
225510
End Position :
230898
225510
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TTTACTGCTTTTACGCTCGTTATATATCCCTGTTTAGTT
225578
225579
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
CAATATCGTGAGCACTCAGGATGTGTCACGATTGACAC
225646
225647
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
CCTCTTTCCTCAACTTGTAATTTACTATCTATACTTAC
225714
225715
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TGTTTAAGACATCATCTATTGTAAAAGCCTTTCCTTTTCCT
225785
225786
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
CCTGAAACTGCAAAAATGGTGGGCGTTTCCCCTCC
225850
225851
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TCTCTAAATCTTTTATGCCTTCTTTTTGCTTATATCGG
225918
225919
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TTATTTCCAATTTTAATAGTGATATCCTCAATAGATT
225985
225986
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TCCAATCAAAGAGGTGAGGTTTATGAATATATTAC
226050
226051
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
ATACAATGTTAATATATAAGATGTAAATATGGAAAT
226116
226117
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
CCAATTATCATCTAAATTATTGTTATACTCATATTC
226182
226183
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
AAATTCATAAAATTAGGAGATGGAGATAACATATACT
226249
226250
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TAATTATAATGACATGTATCTGGTTATGGGGGCTAATCCT
226319
226320
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
ACCCCCAATACTTTTTTAACTTGTTTAATTACAAA
226384
226385
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
AAATATAAAGGAGAGGGACATTTCCAAGAGGAAGATA
226451
226452
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
AATTAAACTGAGAATAAATTATATGGATATACACT
226516
226517
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
ATTAAAGATATTGAAGAGCCAGAGCCTGCGGAAACTC
226583
226584
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
ATAAATAAAGGTAATGAGAATATCTATTCGTTTGAAG
226650
226651
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TCTTTTATAATTCTATATGTACCATACCCGGTTGG
226715
226716
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
ATAAATGCTGAAAATAGTAAAAAAGATAGGGTATTTTT
226783
226784
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TATGATGATGAAGATGGAGGATACGACAGCATTTCAA
226850
226851
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
AGGTTGTGTATTTAAATTTCTCATGTCGATATACTTC
226917
226918
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TTGTAATGGCCAGTCGATGTCACCCTTGTTGAGGGC
226983
226984
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
GATAGTTAAAGAATTTAATGAAGTCTAATTTAGTT
227048
227049
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
ATCTTTTGTAAATATTCATTATCTTTTTCGTAAATTTTA
227117
227118
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
AAATGAAAATGAAGAAAATAATCCACAAGAAAATAAT
227184
227185
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
CTATGTGGTTCATTGAAATAGGTAGCTATACCAAG
227249
227250
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
GTTAAAACAATAGAATTATTTAAAGTCTCATCTAAAT
227316
227317
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
ATTCTGCCTATAAGTCATAACAGTAGCTAAAGGACTA
227383
227384
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
AAGTGAGTATTTCATACAAAAATACGGAGGAAGCA
227448
227449
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
ATAAAGTCTTCGTTCCAGATAATGGAATTGATATAGCGA
227517
227518
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
AAATTACTATAAAAATGGTGTTATAAACAATATTATGA
227585
227586
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TGCTTATACTACAAAAGATTCTTACCAACTTTCCTTCG
227653
227654
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
ATCCATTAATGGGGTGACTTCTTTCTCCCAGTCCCCTAC
227722
227723
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
ATTATCTGATGAGGATAAAGAAGAAACACCAAAAGC
227788
227789
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
CTATCTCACTTTTAGTATCTGAGATATACTGATCAATA
227856
227857
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TTTTATATCTTGTTCTTCTTCTGTCATTCTTTCACCAAAGA
227927
227928
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
CCACTTGCATCTGAATCTGATACAATTGTTCCATTAAC
227995
227996
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TGCAAAATGTATGTATGAATGCGAACCGCCAGAGCTC
228062
228063
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TTATTAATATCCAACCTCCCAATATAACCTATTGTCT
228129
228130
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
CTTTTAAATTCTCAATTTCTGTTTTATGCTTAGCT
228194
228195
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TTTGGGGCGCGCCCCTACCGAGCTAAGTATCCATTCC
228261
228262
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
AAAGAGGTATCTTTCAACTCAGGAAGTTCATTTGCAG
228328
228329
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TGTCATATATATCTATACTTATTTCATCCCCTATTATAT
228397
228398
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TAATTTTTAATTTTTAATGTCATTTCTATTTTATTATTAATA
228469
228470
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TCAATTTTTACTTGGAAATCATTTAGGTCGTAACTGTTT
228538
228539
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TCTTGGAATTTCATTTATATGTTCATCTTTAACATATT
228606
228607
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TCTTGGAATTTCATTTATATGTTCATCTTTAACATATT
228674
228675
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TTGGGATTTTATAATAAATGAAATTCGGAGCAATGGC
228741
228742
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TCTAATGGTCTGATTATAAATAAAATATAAAAATTAA
228808
228809
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
CTAAATTTAACATTTACTCCTTCTAAAACAATATAT
228874
228875
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TCATTGATGCAGAAATCTAAAAATTCCTCTAAATCA
228940
228941
GTTAAAATCAGACCACTGATGGATGGAAAT
TTCTTGAATTTAAAATATTTTATCATTATTTCACC
229005
229006
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGAAAAT
TTGTCAAATCTTATCCCTACTTTATTACTGGATATTGG
229073
229074
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
CAAGAACCTATGATGACAATGGAAATGTCGTAATTAA
229140
229141
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
CACTTTTTTAATTCCGATTGTCAGGCTTCGCCTG
229204
229205
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
GATTTCTATATTAGAATTCATCAGTTATATCCCCAC
229270
229271
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
ATTATTTGTATATCTCCTGAGGAAATGTTTGAGTTAGAT
229339
229340
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
CAGTTAAGAAAGTAACTAAACAAGGAAAATACGGG
229404
229405
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TTCAATGATGCTACAAATAGTTTGTTTGTAGTTAAG
229470
229471
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
CAAAAAAACATACAACAAGCGTATCGACAATAACT
229535
229536
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TCCTTTATTTAATCAATAAGGTATTTTACATTGAGTT
229602
229603
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TTTTTTATATCATAACCCTCAAAATTCCAGTAATCCT
229669
229670
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TTTTGTAAGGGTTATTGATTTTGAATTTGTTACATAA
229736
229737
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
GCATTTTTATCACCCTTTTATTTTATTTTTTTTATT
229802
229803
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TATCTATTTATTAACTCCGTTGGGTTTTGAATAACT
229868
229869
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TCAATAATATTTCTTGTTGGAATATTGACTTCCTT
229933
229934
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
CAATGATTTAATCCTTTCCGTATGGTTCTTCCCCTCCAC
230002
230003
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TACTTGGAGGAACTATTCCCGCAAGTGCTAATGATG
230068
230069
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TCGATACGAGATTAAATTTAGCAACACCACCATCATA
230135
230136
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TGATAATTATTATATCTATATATTTGTATGGGATTGC
230202
230203
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TAGTATAAATACCTGCGGCTACACCAGCCCCTACTT
230268
230269
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
CATTTGTTTTAATAAAATAAAAATAAAATATTATGT
230334
230335
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
GTGAGATTAAAAACTTCAAGAGCCCTGAGGTATCTAAC
230402
230403
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
AATTCTGAAAGGTTAGGAATGATAACATTATCAATA
230468
230469
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TTTTGTGCTGGCGTGATACCATAATGTGATTTAAGAA
230535
230536
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TAGTTCAAGTTCAAAAACATACAATCCAAATACAAC
230601
230602
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
ATAAATTTATTGGAATAAAAATTTTCTGAGTCATTTT
230668
230669
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TAATTTACAATACCAGAGTTTATCATATTTACATTATC
230736
230737
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
CCAATAACACATATAAAAAAAGCAATATATAAAATAA
230803
230804
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TTATATACTATGAGCGATAAGTATAATTTAGAAGT
230868
230869
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
230898
Left flanking sequence : Till position 225510 (length
bp)
TCAGACCATTGATGGATGGAAATTTTACCCTGATGCTTCCAGTGCGGGGAGCTCATTATTTCCTTTTGTA
TTTTACATAAAATAAGAAAATTTTTGAACT
Right flanking sequence : From position 230898 (length
bp)
GCTGTATTTAATATATATTGGGTTGTTAAAAACGATAAAAAACAGGTAATTTTTTATTTCATTTATTATT
TCTTAAAATTCATTGATAATAGTCTCTTTT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp