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CRISPRs details
NC_015636_8
Flanking alignement tool
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NC_015636_8                                                                                                                 
top
Strain :
Methanothermococcus okinawensis IH1
RefSeq :
NC_015636 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_015636_8
DR consensus (30 bp) :
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
Number of repetitions :
29
Begin Position :
1529273
End Position :
1531189
1529273
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TTAATTTTGGTATAATAAAAAACCTCAATTTGA
1529335
1529336
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TTTTTTCACCTTTATAAGTAATTAGGGATTGCCCCTG
1529402
1529403
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
CAAATATTGCAACATTTTTGTAAGAATAATTGTAAAA
1529469
1529470
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TATTTATATAGTGATTTTTGAGTTATAGTATTAAGTGTAGTATCA
1529544
1529545
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TGCAATCATTGAAAAAATATCTGCACTTATATATTG
1529610
1529611
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
AAAGCTCGTTCTGGTGTCATCGAAATAATTTTAAC
1529675
1529676
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TAATACAATTTCTCATATTTCGCATACTATTCATAAT
1529742
1529743
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
AAAGCTCGTTCTGGTGTCATCGAAATAATTTTAAC
1529807
1529808
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TAATACAATTTCTCATATTTCGCATACTATTCATAAT
1529874
1529875
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
AAAGCTCGTTCTGGTGTCATCGAAATAATTTTAAC
1529939
1529940
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TAATACAATTTCTCATATTTCGCATACTATTCATAAT
1530006
1530007
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
CATTAAATAGTGATGTTCCAAGAATTAAAGTGTTCC
1530072
1530073
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
GGAGCTCCGATAGTGTTGAGATTTCATAATATATATTATCAT
1530144
1530145
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TTATTATATTCATCATCTAAATTAATTAATTCTTCCTGCGT
1530215
1530216
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TTGAATGACTATATACATCATTCAAAGGCAAATTTA
1530281
1530282
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TTCAATAGATGAAAAATAAACAGTCTGTAAATAGAGCTTCAT
1530353
1530354
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TGAAATATTAAGTGACTTGGAACTTATAAATGACATTGT
1530422
1530423
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TAAGCCTCTTTTTGTGATGCATCATAATAGTAATC
1530487
1530488
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
AGATTGGAAAGGCAGGAATGAAAGGTGTTAGATA
1530551
1530552
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
ACGCATAAATCTTTTATCATATCATTCCTCAAAGCTGC
1530619
1530620
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
CTTCTATTTTATTAATAATATATTGTGCCACTTCATC
1530686
1530687
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
CTAAACAGTGCATACCGCACCTACATGTAATTTTAT
1530752
1530753
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
AGATTCTATCTTTTCGGGTCTTTTAGGTTGTGGTTGAA
1530820
1530821
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
CTTTAATGTCTTCGTCAATAGGTTCTGGCGTTTCC
1530885
1530886
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
ATAATTTCACCTTCATTATCTAAATTCCAATTAATA
1530951
1530952
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
GAGGATGTTCTTACAAATGCATTTTATAAAGGATATTTAAAAGA
1531025
1531026
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
TAAATCTATTATGTAATAATATTCAATGTCTGAAATA
1531092
1531093
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAT
AGATATATGAAAAAGAAAAAAGAAAAGCAAATTATAG
1531159
1531160
GTTAAAATCAGACCATTGATGGATGGAAAC
1531189
Left flanking sequence : Till position 1529273 (length
bp)
AAAACTATATAAATAACAAAAATCAATGTGATTCGAGATGCAAGGTTTATATAGGGGTAATGCAAAGGTA
TTTTACATAAAATAAGAAAATTTTTGAACT
Right flanking sequence : From position 1531189 (length
bp)
TTTTTAATTTATAATTAAATATTTAAAGAACACTTATAATTGCTATAAAGAATATGGATATTACTACCCT
TGTTAATGTAGATATCGTCATGAGACTTAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp