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CRISPRs details
NC_015672_1
Flanking alignement tool
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NC_015672_1                                                                                                                 
top
Strain :
Flexistipes sinusarabici DSM 4947
RefSeq :
NC_015672 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_015672_1
DR consensus (29 bp) :
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
Number of repetitions :
44
Begin Position :
1011494
End Position :
1014319
1011494
TTTTCCTCCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
AGGCTAGAACACTGGCACACAAACTTAACATTCCATT
1011559
1011560
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
CTGCTGTGTTTAAACCTTGTGCCATATCATACAAAT
1011624
1011625
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
TAACATTATATTTCCATTATTAACTTGAACGCTATA
1011689
1011690
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
TCAAGATTTGCCCGTAAAGGTCTGCATCTTAACATTAA
1011756
1011757
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
CACTTGAGATATTTGAATATTATTTTTTATTAGAAG
1011821
1011822
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
AACTCGTTCGTTGATTGTATAATCAACGTGAATAAT
1011886
1011887
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
TCAAGATTTGCCCGTAAAGGTCTGCATCTTAACATTAA
1011953
1011954
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
CACTTGAGATATTTGAATATTATTTTTATTAGAAG
1012017
1012018
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
ACATCACCGATCATCTACATGTACTTGCTCTTTATG
1012082
1012083
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
TCGCAAATCCATTGTCCATTCCGGTATTTGGAGACG
1012147
1012148
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
CCCTCCACTATTCTTTGTGTACCGTCTTCTGTAGTA
1012212
1012213
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
CCAGTAGCGAACTGTTTTAACAATATTAACTTCACT
1012277
1012278
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
TTTTTTAGCGACTGCAATATGCCGAGCCCCTCCGTT
1012342
1012343
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
TTCTATGAGCTCCCGTTACAATTATATTCTTAAAC
1012406
1012407
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
CTCTGCTGTATCTGGTACATATACTGAAACATCAAG
1012471
1012472
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
AAACTGTCAATCTCTTGTCCACGTATATTAAATACG
1012536
1012537
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
GAGTTGGGAGAATATAAAACATTAGGTACTTATGAG
1012601
1012602
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
TTTTTCTCAAGATTTTGTGCGCTTCTGAGTGTTGCC
1012666
1012667
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
TGCCTTGTAAATCTTCTTCTGCTTCCGCCCTTTAAT
1012731
1012732
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
CACTTTGTACGATATCGAATAATGCAGGATTCCGTT
1012796
1012797
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
TTCTCGTCTCACTTTTCTAGCCTCGCTCCATGTAAT
1012861
1012862
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
CTGCTTGTGCTATTCTATCCCCTACATTTATTTTAA
1012926
1012927
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
GCTGTCTTCTATAAAGCAGAACAAATGCCCGAAATG
1012991
1012992
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
TTTATGTAAACAATTGACTAAAATTGCTGAAAGAGT
1013056
1013057
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
GGAACACGTTTCATTGCGTGTTCCTGAATCAAGCGA
1013121
1013122
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
GTTGAAGGAATTTTCGGTAAACTTGACGGCATTTTT
1013186
1013187
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
AACATATTATGACACAAAAACCGAAGTAAGTTCAGA
1013251
1013252
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
CGGGAGGAAGCCAAAAGCGATTCCTTTTTCCGCAAA
1013316
1013317
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
TTTCTCACCTGCATATTTAATATAGTTCGTTTCATT
1013381
1013382
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
TTGCTACTGCTGACATAGTTCCTTTAATGCTCACTA
1013446
1013447
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
TACAGAAGCGTCTCTAATACCGTATTGCTTTCTTAT
1013511
1013512
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
TATCTTGCAATGACCCTAATGTACTTCAACAACAAT
1013576
1013577
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
ACTGCTAACGCTGAATATGAAGATACTGCTTTTATT
1013641
1013642
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
ACTCTCTTATTTTCTTCGGGACTTTTTTCAAGTCCT
1013706
1013707
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
GTCTGAAATAGTAAAACTTATAAGGCCATTATCATA
1013771
1013772
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
GCTATCTACCGTCCCTACAGATGATAAGTCAAGCTG
1013836
1013837
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
AGGCGTGCTGCCTTCCAAAGTGCTACTAAGAACGC
1013900
1013901
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
ATTTTGTTAGGTCTGGAGATAAGGTAGAAGCTTTTA
1013965
1013966
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
AATACCGTTTATCGTTACATCTATACTATCCAATTG
1014030
1014031
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
TGTTCATCTTGCCGTTGTTTACAGAATTCTGCAACT
1014095
1014096
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
AACAGCACCGACAATGCCTACCTCTCTAACATCAGC
1014160
1014161
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
CAGAGGACAGAAAGATGAAATACGTAGCAAGGGACT
1014225
1014226
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
TTCTTGAGCATTATTAAAGCGTGTGCCTCTGAAATT
1014290
1014291
CTTTAAATCCCAGAATTGGGAACTAAAAC
1014319
Left flanking sequence : Till position 1011494 (length
bp)
ATACAAAAGTATTGTTTTACATATACTTAGCCAACATAACATTGAAAAATGTTCTTGCTGCAAAAATGGG
GTGACGTGATGCATAATTTACCTGACCCCA
Right flanking sequence : From position 1014319 (length
bp)
CCATAATTTATATATATTTTTCTTATCTCTTATCAGATACATATACCTATTTTATTTTCAAACATCAACG
AAAAATTTCCCGAAGTTCCGGTAATGCATT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp