Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_015672_2                                                                                                                 top


Strain : Flexistipes sinusarabici DSM 4947 RefSeq :NC_015672 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_015672_2
DR consensus (36 bp) : GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAATNumber of repetitions :30
Begin Position : 1428495 End Position : 1430685

1428495GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAATCATAGGCTCATTAAAGGGCATGTAAGCATGGAGCTTGT 1428568
1428569GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAATGCAAAATACAACTGAAAACACAAGTAAAGTAAAACTAA 1428642
1428643GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAATAAAAGGGTCAATGATTTCTTATTTAAAAAGATACAGCT 1428716
1428717GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAATGCGCCGCCGTAAGTTTTTTAACGGCGGATATAAGGCT 1428789
1428790GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAATAGTTAAAAGCTGTTTTCACTCTCCTGAAATGGGAGAGTGAA 1428866
1428867GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAATCAAAAATCTGCGTGAGCCAGAGATAGAAGAAGGCAGTAC 1428941
1428942GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAATAAGATATGTATAACGTAGCCTTCGAACTGTACTGTGAGAA 1429017
1429018GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAATGAAAATTGTCATGGCAATTCTATTTTTTGGCGGTCTAG 1429091
1429092GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAATAAAATTTAGTATTAACAACAAGTGGAAACAAACTCTATGT 1429167
1429168GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAATACCATTGTTCAACACACTATTCAATGCTGTGACAAAGAAC 1429243
1429244GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAATAAAATATGGCGCGAGGTTTGCAGACTTGCAGCCTCACGCT 1429319
1429320GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAATATTAATTTTCTTATCAGGGGGGGAAGAAAAAATAAA 1429391
1429392GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAATAAAAAGGTAAAAAAATATACAATTAAAGACGAGTTGGGA 1429466
1429467GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAATTCCATGGTCAGAGCTCGAATCCGCAATCGGGCACCCGGA 1429541
1429542GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAATTAGATGTTGCAAAGCAGCCGGTTAAGCTCCGGCTGCTAT 1429616
1429617GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAATCATAAGTGCATCTGAATTTTGGGAGCGCGCAGTAAAA 1429689
1429690GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAATTAATATTACAAAATGTTATATTAATAATAATATTGATA 1429763
1429764GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAATAAAATCAAATAAATTTAAGAAGTCTGCAAAGCGCAGG 1429836
1429837GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAATCGAATCCGCCATCGGGCACCCGGATACAGCCCGGGTGC 1429910
1429911GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAATCTTAAAAGCTTTATGGAACAAAATGGCCTGGCGGAAAT 1429984
1429985GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAATAGATTAAAAGATTTATATAAAAAGTACGGCGCTGAGTAT 1430059
1430060GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAATTACTTCCGCGTAGAAGTACTTTAAAAAAATAAAAACCGT 1430134
1430135GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAATCGGCGGGTATAAAGCAGTCCTCAGATACTTTGAGGA 1430206
1430207GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAATATAATAAGCGCCTTATCCAATCAAAAAATTTTTCTTTT 1430280
1430281GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAATTCCCGGGGAGAAAAGAGACATAGCAAAGCAGCCGGTTAA 1430355
1430356GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAATAAGCAATAAGCTTACATAAAAATTCTTTCTCTCCTTT 1430428
1430429GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAATAGATTGTTCTACTCTTACCTTTATTCGTCTTTATGA 1430500
1430501GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAATAAAATGAGAAATGAAATAATTGTAAATAAGATTTCAGAA 1430575
1430576GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAATGGAAGGGGCAACAACCCTTCCGGAGGGTTTTAAAATGA 1430649
1430650GTCGTAATCCCTTCAAATCAGGTCATTAATTCCAAT1430685
Left flanking sequence : Till position 1428495 (length bp)
ATATCTCATCGCAAATGTTTCTGTTCAGAGCTTGCTGGAAATCAGGTCATTAATTCCAATTGAAGATTAA
TGACCCGAAGCAAATCCAGATTTTAGAAGA
Right flanking sequence : From position 1430685 (length bp)
AGCCCCTATTTTTATACCTTAAGTTTTAGTAAGTTACAATGCCATTTTTTAGGAAGGGGGGGTATCCGGT
TTTTCTACTTTTCAAAATCAGCCCCCCTAA
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp