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CRISPRs details
NC_015682_2
Flanking alignement tool
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NC_015682_2                                                                                                                 
top
Strain :
Thermodesulfobacterium sp. OPB45
RefSeq :
NC_015682 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_015682_2
DR consensus (35 bp) :
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAA
Number of repetitions :
42
Begin Position :
1115343
End Position :
1118449
1115343
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAA
TTACAAAAATAAAATTTTTCATGTGGACAGGTCCATTCAAGA
1115419
1115420
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAA
AATTGATCATAAAGTATTCTTTCAATTGTCTCTTTCAAATT
1115495
1115496
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAA
TTTCGTTGAACTTCTTTATCTTACTCGCACACTCTTTTTCACAA
1115574
1115575
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAA
ACCTCTTTGTAAATCATTTTAACCCTCCCTTTTTTTATT
1115648
1115649
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAA
TCTTCCGGTTTTGGTTTGTGCCATACTGGGAATTCAAATACGA
1115726
1115727
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAA
ACAGGACATTTTTCTAACATAACCTTACCTCCTTTTTAA
1115800
1115801
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAA
AAATTGCTCTATCCTCTCAAACTCAACTACTCTAAAT
1115872
1115873
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAC
ACTTTTATTTACTTTTCCTCCGATTTCGTTCCAAATATTAAT
1115949
1115950
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAA
ATACAAACCTCTTTACCCTCAGCACAAAGCTCTTCATATGT
1116025
1116026
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAA
TGTGGTAATTTTTTTTATCATGGCTTACACCTCTTTTTTA
1116100
1116101
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAA
AAATGATTTAATTAAATGTTGATAGTTCAACCAAAAG
1116172
1116173
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAA
AAGAGAGGAGTGGAGGATTTATTCAATTTTGATGGTAATTTCGG
1116251
1116252
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAA
ATACAAACCTCTTTACCCTCAGCACAAAGCTCTTCATATGT
1116327
1116328
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAA
TCTTTTTTTTCTGGCATAATAACCCTCCTTTATATTTT
1116400
1116401
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAA
ATAAGATCCCTGTCTTCTCCTATGATAATGAATTTTTT
1116473
1116474
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAA
TATACAAAAGCCACTTTCCTTATAATAAGGACAATTTTTA
1116548
1116549
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAA
AAATGATTTAATTAAATGTTGATAGTTCAACCAAAAG
1116620
1116621
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAA
TTGACACCTCCGTAAACTTTCGTATCGGCTGTATAATAGAA
1116696
1116697
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAA
GATCTAAATCTACCTCCCCTTCCCTTTTCTCTTTCAAATGG
1116772
1116773
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAC
TTTTTCATTTTTGTCCTCCTCCTTTTGATTTTTTATTTTTAT
1116849
1116850
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAC
ACTTTTATTTACTTTTCCTCCGATTTCGTTCCAAATATTAAT
1116926
1116927
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAA
TTAACATCTGCAAAATTTATAGGAATGTTAATG
1116994
1116995
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAA
TTTGCCATTTCCTTTCTCATAAGTCTCACCTCCTTATTT
1117068
1117069
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAA
AAGTTGCTACTTTTTCAATCATAGTTTTCCCCCTTTTTAGTG
1117145
1117146
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAC
GCAGACTTTATGACATCAGAAAGTCTAATCTGAGAAG
1117217
1117218
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAC
TTCTGTCCAGCCCAGCCCTAATAATTTGATATTGATTA
1117290
1117291
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAC
CCTAAAAAATTGGGCAACTCTAAAAACTACTGAAAGAACAC
1117366
1117367
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAC
ACTTTTATTTACTTTTCCTCCGATTTCGTTCCAAATATTAAT
1117443
1117444
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAA
TTAACATCTGCAAAATTTATAGGAATGTTAATG
1117511
1117512
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAA
TTTGCCATTTCCTTTCTCATAAGTCTCACCTCCTTATTT
1117585
1117586
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAA
AAGTTGCTACTTTTTCAATCATAGTTTTCCCCCTTTTTAGTG
1117662
1117663
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAC
GCAGACTTTATGACATCAGAAAGTCTAATCTGAGAAG
1117734
1117735
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAC
TTCTGTCCAGCCCAGCCCTAATAATTTGATATTGATTA
1117807
1117808
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAC
CCTAAAAAATTGGGCAACTCTAAAAACTACTGAAAGAACAC
1117883
1117884
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAC
ACTTTTATTTACTTTTCCTCCGATTTCGTTCCAAATATTAAT
1117960
1117961
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAC
CCTAAAAAATTGGGCAACTCTAAAAACTACTGAAAGAACAC
1118036
1118037
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAC
ACCCAGAGAAAAGAATAATCAAACAATCTTATTAAAAATTA
1118112
1118113
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAC
ATTAAAGATACAGCCTTCATCACTCCATAACCTTCTATAG
1118187
1118188
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAC
AATATTTTCTACTTTTTCAATTTTGGTATCCCATACTTTAG
1118263
1118264
GTTGAAACCTGCCCTGGATTAAAAGGGATTGCGAC
ATATGTTTTTGCGGTGATTATTCCTTGACCTACTGATTTCA
1118339
1118340
GTTGAAACCTGCCCTGGATCAAAAGGGATTGCGAC
GTATAAATTTCTTTGCTTCTTCAAGTTGATAGTTTAAATC
1118414
1118415
GTTGAAACCTGCCCTGGATCAAAAGGGATTGCGAC
1118449
Left flanking sequence : Till position 1115343 (length
bp)
GTAGCTCAAAATAAATGTGTTCTCCAAGGGTAAATTTTAAAAAATTTAATTTGTTTTAATATTCACAAAT
AAGATTTTATAAGATTTACATAGTGTTAGG
Right flanking sequence : From position 1118449 (length
bp)
TTGGGGATCAAAAAAGATTGCGGCCGTCTACTTGCAAAGTAAGACCAAACAACCTTCTTTGGTTTCTGAT
TTAAAAATTTTTAAAAATTGGTTATAGAAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp