CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_015873_9
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_015873_9                                                                                                                 
top
Strain :
Megasphaera elsdenii DSM 20460
RefSeq :
NC_015873 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_015873_9
DR consensus (32 bp) :
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
Number of repetitions :
39
Begin Position :
1758457
End Position :
1761039
1758457
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
CCGTTCCTTACAGGCTATGCCGCCCTCTGCTAC
1758521
1758522
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
AAAGATACCCAGTATCCCCTGGCGGACATCAACGC
1758588
1758589
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
CGGAAAGCGATATCTTTGAAGACGTCCCGTCGGCCA
1758656
1758657
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
AAAGTTGATGCCGTAGCTGATGGCGCCCAGGCCCAT
1758724
1758725
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
ACTGGATATATCCTTGAAAGGCCAGCTGGTCCTGG
1758791
1758792
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
TCGTCAGCCGCGGCTTGTCTGAGAGCCGGGAAAAG
1758858
1758859
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
CAGGAAGATGCCCTGCGGTTGTTCCGGGCCTGCCGC
1758926
1758927
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
CCGATATGGTGAAGCGGGCCAAGGAGTTGAATATGC
1758994
1758995
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
GATGAGGTCCATCTGGTCGACGTTCATGCCGGTCTT
1759062
1759063
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
CTCAATGGGCAGGGCATCGACGTCGGCCCGCAGG
1759128
1759129
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
AAGCACGTCAGCCCGGCTGGGGCCGCCGTCGCC
1759193
1759194
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
TACAGCGGATATGAGTACGCGGCAGTTGGCGACCC
1759260
1759261
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
ATGCTCTCTGCTGCTTCGACGATGTAATCAAGGGCT
1759328
1759329
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
AAGTTTTGCTAACCACTGCTCATAGACACGAATCTT
1759396
1759397
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
CGGTTCGGGCTGTTTAGTGGTTGCGGTGGCCGGG
1759462
1759463
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
GCATTGACATCTGTAAAAGGGAAAAACTGGCTTAC
1759529
1759530
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
TTCACGGCGCCTGTGACGCCATGCCATGCCTTAGA
1759596
1759597
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
AATATCAAACAGAACACGGCTGCGGCCTGGCTGGAA
1759664
1759665
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
ATAATTATCATCTACAAGGCACTGCTTCTGGGTAT
1759731
1759732
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
TGAAACCATGACGGATTTCCTCACAGATGCATAC
1759797
1759798
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
TGGTTGGCTGTGATGCTTGAAGAAAGCGGCACGTC
1759864
1759865
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
AGTTGAAGTACGACTTTATCCGAGTCTTGATGAA
1759930
1759931
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
CCGTGTGCGTCCGCCGGATGAGATTTCCGCGCCGT
1759997
1759998
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
GTTGCTGATAAAAGCTAGTTCCACTAACACAGCAG
1760064
1760065
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
ATCGGGCCAGGGCAAGAAGAGCTGTCTTTTAAACTG
1760132
1760133
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
ATGAGGTAGACCCTTTTCATACGACCGTAAGCATC
1760199
1760200
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
GAGGACCGCGGACGACGTTTCACGCGAAATCCGAT
1760266
1760267
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
GCAAGCCGGGCAGATCTGTGTTTCCAGCCATTTTAC
1760334
1760335
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
GGAACTCATCCAGGAAGACGCCGGTATCGTCCCG
1760400
1760401
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
TGGGCAGTACTGATTGGCGTCCTGGTATCGGCCGCA
1760468
1760469
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
CTTGCGGGTCACAGTCAATCATGAGTACTTGCGGT
1760535
1760536
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
ACGCTGGAGGATTTAGACGGTCGGACACCCGAACAG
1760603
1760604
GTCGCACCTTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
GTCGGCATGGCCGCAGATGCCCTCGACGCCATCTGC
1760671
1760672
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
TACTGGCGTACTTTGAATAAGCGACAAATCACAT
1760737
1760738
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
GTTGCTGATAAAAGCTAGTTCCACTAACACAGCAG
1760804
1760805
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
TCCGATGCCGTGGCTAAGTACCTCGACCGGATTGGC
1760872
1760873
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
GCTGTCTACCATCTCCCATAAGTCAGCACCATTGAC
1760940
1760941
GTCGCACCCTTCATGGGTGCGTGGATTGAAAT
TTGCTGGTTGTCGCCGAAGCTTTTATCCGGCTACT
1761007
1761008
GTCGCACCCTTCATGGGTCCGTGGATTGAAAT
1761039
Left flanking sequence : Till position 1758457 (length
bp)
CAATATCCAGATAATTAACTCAAAAAATTAGATTGGCTTTCTCTCAGTTCGCAATATAGATGATAGAAAA
GCAGGCGATGACTGAGTTAATTTGAAGACT
Right flanking sequence : From position 1761039 (length
bp)
CACATGGAGGCTCCGCCTTGTACGGATACTTACAAGTCTCACCTTTCATGGGAAAAAAGAATGTTAACTT
GCTTTAGATTGTTCGGGCAAAATTACTGCG
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp