Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_016001_5                                                                                                                 top


Strain : Flavobacterium branchiophilum FL-15 RefSeq :NC_016001 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_016001_5
DR consensus (36 bp) : CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAACNumber of repetitions :29
Begin Position : 1899989 End Position : 1901917

1899989CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAACGATGTTTGTAGAATAGAGTCAAACCCTTAT 1900054
1900055CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAACTTCTTAAAAAGAAAAAATAATGATTAGAAA 1900120
1900121CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAACTAGTTCCGTTTTCATATTCTTTTATAAACT 1900186
1900187CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAACATTGAAGGGTTTTCATTAACAACTGAAAAA 1900252
1900253CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAACCTGTATTTGCCTGAAATGGCATTTGGAAAT 1900318
1900319CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAACAATGGCTATGAAGAAACTAAGATAGCCAAA 1900384
1900385CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAACTGCCTGTGGTGTGTTATTATTTGTCGGAAA 1900450
1900451CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAACGCTAATACAGTTGATACAGCCAAAAGATTT 1900516
1900517CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAACTATTTGAACTCCATTTTGGAAACTTCAAGC 1900582
1900583CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAACGTAGGCCAAAACAATTGCACCAATAAAACG 1900648
1900649CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAACGCTTGTAATCGCTTGAATTAAAGCGTTAAA 1900714
1900715CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAACATTCTCACAATTTGTGAGTTTTTCTTTGGT 1900780
1900781CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAACATTTAACGAACTTAATGTTTTAGCACAATC 1900846
1900847CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAACGGGGCAAATATACAAACACTTGCAAGTATT 1900912
1900913CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAACACCCCAACGTATCGGCAGCTGCTGGTATG 1900977
1900978CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAACTATACATAATAACATCGAAAATCATGGCGA 1901043
1901044CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAACCCAAGTGCCGCCCACACCATCGGGCGTAAT 1901109
1901110CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAACTCGTCCTTAATTTCATTTTCTTTTTGCTTG 1901175
1901176CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAACTATGGCTCCTGCTGGCACTTTTATTTGAG 1901240
1901241CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAACGGATGCGTTGGATATTAATTTAATACTAGG 1901306
1901307CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAACACGCCAGCTGCTACGGTACATGTTGCCCCA 1901372
1901373CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAACGTAGGCCAAAACAATTGCACCAATAAAACG 1901438
1901439CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAACGCTTGTAATCGCTTGAATTAAAGCGTTAAA 1901504
1901505CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAACGGGGCAAATATACAAACACTTGCAAGTATT 1901570
1901571CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAACACCCCAACGTATCGGCAGCTGCTGGCATG 1901635
1901636CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAACCCAACGAGCTACCAGACTACTCTAACCCGC 1901701
1901702CATATCGTGTTTTCTAATTTTTAATCAAACCACAACACTAAAAATGTAATTATTAAAAAATATGTT 1901767
1901768CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAATAAATTCACAAACACACCTATAAAAAATATTATTTTGGTGTTTGTAAACCACAACTCAATACCGTTGATTTTCAAAAAATCTGAA 1901881
1901882CATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAATAAATTC1901917
Left flanking sequence : Till position 1899989 (length bp)
AAAAATGCCTCAATATAGGGTTATCAGTCCTATAAAGAGGCATTTTTTATAACGATATTTACAATTAATC
CCTTGAATATCAGAAGGCAACAAGCCAACT
Right flanking sequence : From position 1901917 (length bp)
ACAAACACACCTATAAAAAATATTATTTTGGTGTTTGTAAACCACAACTTTAAAATTGCCACTGATGCAC
AGATTACTCTTATATCGTCTTTGTGGTTTG

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp