Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_016077_1                                                                                                                 top


Strain : Acidaminococcus intestini RyC-MR95 RefSeq :NC_016077 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_016077_1
DR consensus (36 bp) : GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACNumber of repetitions :53
Begin Position : 1011010 End Position : 1014466

1011010GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACTCCAGTTTTTGGGGTACACATCAGACTTCT 1011075
1011076GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACTGCGCAAGCGTCTGTCGCGGAGCAAGCTTT 1011141
1011142GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACTGAATACGGCATTGACATTGACACCGATAC 1011207
1011208GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACAGCTGTGCAATCCTTGTCGGATGGCTGGCG 1011273
1011274GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACCGGGTCAAAGAATCTATCGCGGAAATGGG 1011338
1011339GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACGCCGATGGTAATGGCCTTGCCGGCGGCAAT 1011404
1011405GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACAAATGCAGCTGAAAAGAATATAATAACACT 1011470
1011471GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACGTTCATTCATACCCATTGCTTTTACCACTT 1011536
1011537GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACCTGGATTCTTGGCTAGCATCACGACATGT 1011601
1011602GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACTTACAAACTGTTTGATTGCCTTATACTGTC 1011667
1011668GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACGCTGGTCGGTCTGATCTCACCCTTGATGGC 1011733
1011734GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACAGTTGAGCTCCTGTTCATACAGGCTGATGT 1011799
1011800GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACGGACTATCTGACGAAGGCGCTGATTGGCTA 1011865
1011866GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACTTCTCTGCTTGTTACTAATGCTCCTTGCA 1011930
1011931GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACATAGGAGGGCATTCGATGAGCCTTGAATGC 1011996
1011997GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACGATGAGAGATGCTGCTGCTTGCTGGTTTCC 1012062
1012063GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACCGGCTATTTGCTGATTCGTAAGGCCCCGTT 1012128
1012129GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACCCCGGCCACTTCAAACCCTTTGGCGTCAT 1012193
1012194GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACTGATCATATACTCTTCAAAAGCCGTTAAGT 1012259
1012260GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACCAAGCTCCTGAAGCTCCGGTAAGTTGGCCG 1012325
1012326GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACTCAAAACCCTCGCCAAAGAGGTCAACATTA 1012391
1012392GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACCGTCGGCGTCATCCACGGTTTTGCCCTCCC 1012457
1012458GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACCATCCAGCCCGGGACGAAAATCAAGATTAG 1012523
1012524GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACGGGTATAGCACTGTGTTACTGCCTATCACA 1012589
1012590GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACCTTTTTCATTAGCGTATCCGAAAGCTCATC 1012655
1012656GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACGGTCGGACTGGACGGTTTCGCCCCAGAGAC 1012721
1012722GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACATTAAGCCCTTCGGAAAGCTTTTCTGGGT 1012786
1012787GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACGGAATATCATATCGTCATAGCAGACGATGT 1012852
1012853GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACCTTAATCTCGCCCCCGAGGAGCCGGTCGA 1012917
1012918GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACCTTCACCTTCTCCCAATTTTACTACATTT 1012982
1012983GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACACAGTTTGGCGAATTCTTCCAGAAGCTTCA 1013048
1013049GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACTCAACGATGTTCAAAGCCTTGAAATATGAA 1013114
1013115GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACAGTATGACGCTTTTTCCCAATGGCAATTGC 1013180
1013181GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACATATCCCCGAATATATCGTTCCTTATGACGA 1013247
1013248GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACCATTTTCATCTCTGGTATTAATGGACGTAG 1013313
1013314GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACAGGATTTCCGTCAGCCACGAGCAATGGTTA 1013379
1013380GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACCTGCTGTCTGAAATGCGAATGACAATAAT 1013444
1013445GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACCATGCTCCGCATCGACTGCTGAACGTGGAG 1013510
1013511GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACTCAAAATCTAGGTTGCGTTTAATGGAATCC 1013576
1013577GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACATCTTGCCCGTGATCCGTCGGGCCAACAAA 1013642
1013643GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACCTTAACCACAAAAATGACCTTTAGGAGGT 1013707
1013708GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACCAATCTGGCCACGAACAAGCCGCCGACGGT 1013773
1013774GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACTTCCTGCTGTGTAAGTTTTGATAATGCTC 1013838
1013839GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACTGATAATAATCTCCGGTGTAGTTTTTGCC 1013903
1013904GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACTGTCATACTCAGGGTGCTGTTGTTGAATA 1013968
1013969GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACGAACGCTATGCCGTTGACCTTCACGTTCGA 1014034
1014035GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACAGTCAGTAAGGCCAAAGAGCTGCAGTCTCA 1014100
1014101GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACCGCTGTCGCTGACTCCGTTCTGGCGTCTGA 1014166
1014167GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACACTTGCCACGCAAGTTCCAGACTTCAACAT 1014232
1014233GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACAAACATCGGACACAGAGCGCTTGGCCGCGT 1014298
1014299GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACCGACGTTGACGTCAGCGATTTGCCTGACTG 1014364
1014365GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAATCAAACAATGAAAGTCAAAGGGCTCCCCAGGGCCCT 1014430
1014431GTTTGAGAGATATGTAAATTCAAAGGATAACTAAGC1014466
Left flanking sequence : Till position 1011010 (length bp)
AGGAAAAGAGGGTTCTTATAGATAACGATTTATGTGTATTATAAATTAGCACCTTTTGAATTTATCTACA
CGGAATGATAATCCGTTGATCAAATTTGAG
Right flanking sequence : From position 1014466 (length bp)
GTAAAATGTTTTTCGGTAGGGAAAAATAGTCCTTGCAGAATAAAAGGGAGGCCCCTATTGTTAAGATAGT
GTTAACGGCACGAATATCAAAACAAAGGAA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp