Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_016109_3                                                                                                                 top


Strain : Kitasatospora setae KM-6054 RefSeq :NC_016109 (chromosome linear)
CRISPR id : NC_016109_3
DR consensus (28 bp) : CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCNumber of repetitions :39
Begin Position : 623530 End Position : 625875

623530CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCTTGACGTGGATTCCATCAGACGTGTGTCGACGT 623590
623591CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCCGGGACGGCCGAGGGGAGGACGTCGTGTCCCTC 623651
623652CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCCGGTCGTGGTGCCGGAGACGGTGATGCTGGGGG 623712
623713CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCCCAGCAGGCGGCCGGAGCCGAGCGCGACGCCTA 623773
623774CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCACGTGTCCAGCGTAGGCCCAACTGGGTTGTGAT 623834
623835CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCCTGCCGTTGCAGGCGTAGCACGGGGGTTCGTCG 623895
623896CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCCCGGCTGCCGCCGCTGGTGAAGGTGAAGCCGAT 623956
623957CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCGACCGACATGGCCCGTGAGTTCGCAGTCCGGCA 624017
624018CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCGCAACCGGGGCGGTTGTCGTGACGGAGAAACGT 624078
624079CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCCCGGCCCGGGATCCACGTCGAGGACATCGTGAA 624139
624140CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCCCGGGACAGCGGCGGCCGGGGCTGCGGGCTGCT 624200
624201CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCGTCGGCCGAACACCGCGCGGCCACCGGCAAGGA 624261
624262CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCGTTCGACCACCACCCTCAGGTAGCGGCTGCCGG 624322
624323CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCGCCGAAGCCGCGCTCATCGCCGCCCACCGCCTC 624383
624384CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCGGGCGTGTACCCGGAGGCCGGGCTGCAGATGTC 624444
624445CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCCCGGGAGCCGCGGCAGGAGATGGTCAGCCGGGC 624505
624506CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCTCGCTGCTGGCGGCGCGGCGATTCAACCCACCG 624566
624567CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCGGGCGTGTACCCGGAGGCCGGGCTGCAGATGTC 624627
624628CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCCCGGGAGCCGCGGCAGGAGATGGTCAGCCGGGC 624688
624689CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCGGGTCTCGCGATCCTGGCCAGGATCGGACTCGT 624749
624750CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCCCGGCCCGGGGCGCCCGCCGCCGGGGCGGAGAG 624810
624811CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCTTCTGTCACACAGATGGCATATTCGCGGGGCAT 624871
624872CTCGGCCCCGCGCTCACGGGGGTTGCTCCTCGGCGAGGCGGGCGGACGTCATGCGGACGAG 624932
624933CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCCGCGGTGGACAGGCTGACCACGCTGGTGGGTGA 624993
624994CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCGCGGGGCACGACCCCGGCCGAGGACAAGGCGTA 625054
625055CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCTCGCCCGGCGCCACGCTCAAGGACCTGCTGCTG 625115
625116CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCCCGCTGGACCGGGCTCACCGGCGCGCGCCCCGG 625176
625177CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCTTCTGGGCGTGCCGGTCTGCCCGACCCATTCCG 625237
625238CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCTCGGGAGAGTTGGGGCCGGGCGACCGGCTCCCG 625298
625299CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCCCCATCCCCGACGGCCGCGCGCTGTTCCTGGCC 625359
625360CTCGGCCCCGCGCTCGCGAGGGTTGCTCGATCGGCCTCGGCGGGATCGGCGACACCCTGAA 625420
625421CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCAGCGGGCCCGCCCCATCCATCCGGTGGACCGCA 625481
625482CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCCGATGAGGGCCTGGCGCTCAGCCGGGCTACGGG 625542
625543CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCCGGACGAGGGCCCGTGCGGCAACGCCACCCACC 625603
625604CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCTACGAACCGAGTAGCGTGACCGGGATGCACCAG 625664
625665CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCCACCGACTTGACGAGGTCGGTCTCGTTGACGTC 625725
625726CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGCTCCCGTGGCCGGCTCTTGTCCGGCATCACCCAGGC 625786
625787CTCGGCCCTGCGCTCGCGGGGGTTGCTCCATCTCCTCTTGCTCGTGACGAGTGGTCAGGCC 625847
625848CTCGGCCCCGCGCTCGCGGGGGTTGGTC625875
Left flanking sequence : Till position 623530 (length bp)
ACTGACAATCCGGCCGCCACCCAGACCATGCGCACATCCCAACCGAGTTCAACTAACAAAAATACTGCCC
CCTAACCCACAAAACACCAGCTCATCAAGC
Right flanking sequence : From position 625875 (length bp)
GCTACCACCATCGACAGTCCCTCCCCTGCGAGTTGATCATTCCTTCTCGAGCCATGGTCCGAATCGGAAT
ACGGAGCCGCTGTTTGCGATTGGTCTCTTC

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp